143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0624 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0624  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  100 
 
 
175 aa  344  3e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1629  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  56.73 
 
 
175 aa  176  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.301211 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0801  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  48.24 
 
 
171 aa  164  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.897087  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2310  YeeE/YedE family protein  47.65 
 
 
173 aa  159  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1597  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  44.79 
 
 
170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2856  hypothetical protein  41.21 
 
 
175 aa  129  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1978  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  38.18 
 
 
174 aa  128  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.248725  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1695  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40.34 
 
 
181 aa  128  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000630724 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1168  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40.85 
 
 
172 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.709858  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0175  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.1 
 
 
176 aa  124  5e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121367 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3682  putative membrane protein of unknown function with YeeE/YedE motives  45.68 
 
 
180 aa  124  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137172  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2969  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.72 
 
 
172 aa  124  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4308  hypothetical protein  41.38 
 
 
174 aa  117  7e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1868  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.93 
 
 
180 aa  107  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3015  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.82 
 
 
133 aa  84  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1463  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.97 
 
 
165 aa  76.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1156  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  44.79 
 
 
407 aa  71.6  0.000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.643231  normal  0.0925546 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3344  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.13 
 
 
177 aa  71.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0171  YeeE/YedE  31.29 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.96637  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0269  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.37 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4882  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.21 
 
 
187 aa  67.8  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437819  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0053  hypothetical protein  35.86 
 
 
344 aa  66.2  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101016  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0054  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.86 
 
 
352 aa  66.2  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0689897  normal  0.802997 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2608  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.43 
 
 
186 aa  64.7  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6934  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.44 
 
 
191 aa  63.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2804  hypothetical protein  27.27 
 
 
180 aa  62.8  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1835  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.06 
 
 
177 aa  62  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1366  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.94 
 
 
182 aa  61.2  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11778  hypothetical protein  48.21 
 
 
185 aa  60.5  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2678  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.38 
 
 
191 aa  59.3  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.782906  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0788  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  26.25 
 
 
175 aa  58.5  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0768937  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2997  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  48.44 
 
 
187 aa  57.8  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.207373  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3331  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.02 
 
 
186 aa  57  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286233  hitchhiker  0.0021122 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1172  hypothetical protein  34.51 
 
 
373 aa  57  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0358  YeeE/YedE family protein  54.9 
 
 
144 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1899  YeeE/YedE family protein  54.9 
 
 
144 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279304  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1813  YeeE/YedE family protein  54.9 
 
 
144 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12633  hypothetical protein  26.23 
 
 
185 aa  55.8  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.318164  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1028  hypothetical protein  27.08 
 
 
185 aa  55.1  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.637792  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1214  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.96 
 
 
100 aa  55.1  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0826897  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0556  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.2 
 
 
174 aa  54.7  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1086  YeeE/YedE family protein  50 
 
 
144 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0490771  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2596  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.22 
 
 
171 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.127536 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0938  YeeE/YedE family protein  52.94 
 
 
144 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0444  YeeE/YedE family protein  52.94 
 
 
144 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0203  YeeE/YedE family protein  52.94 
 
 
144 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1403  YeeE/YedE family protein  52.94 
 
 
144 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.14374  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0812  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40.3 
 
 
462 aa  53.1  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0438  hypothetical protein  48 
 
 
144 aa  52.4  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.616071 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1883  YeeE/YedE family membrane protein  46 
 
 
144 aa  52.4  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3645  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  48.08 
 
 
143 aa  51.6  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.301745  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3116  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.17 
 
 
191 aa  51.2  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0855  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  36.63 
 
 
142 aa  50.8  0.000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000829035 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3368  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  48 
 
 
144 aa  50.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0969639  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0812  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  39.47 
 
 
145 aa  50.4  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.938577  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0104  hypothetical protein  29.1 
 
 
187 aa  50.4  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.313018 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4161  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  34.19 
 
 
360 aa  49.7  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2080  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.88 
 
 
412 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4036  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  48 
 
 
144 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.139813 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0329  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  44 
 
 
144 aa  49.3  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3681  putative membrane protein of unknown function with YeeE/YedE motives  31.43 
 
 
366 aa  49.3  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241689  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2820  YeeE/YedE  32.03 
 
 
170 aa  48.9  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2107  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.48 
 
 
159 aa  48.9  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3555  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  48 
 
 
127 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0314  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  44 
 
 
144 aa  48.9  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2350  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.03 
 
 
144 aa  48.1  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1026  putative transmembrane protein  44 
 
 
144 aa  48.5  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.304948  normal  0.155882 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2101  inner membrane protein YeeE  27.06 
 
 
344 aa  48.1  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2519  hypothetical protein  26.74 
 
 
144 aa  48.1  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0396534 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01950  YeeE/YedE family protein  44 
 
 
144 aa  47.8  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.67924  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3143  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.46 
 
 
144 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.151117  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3295  YeeE/YedE family protein  44 
 
 
159 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.544227 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2448  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.94 
 
 
251 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0511  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.58 
 
 
330 aa  47.4  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413537  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2497  integral membrane protein  40.32 
 
 
139 aa  47.4  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4846  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  42 
 
 
144 aa  47.4  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.90387 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5675  putative transporter component domain-containing protein  42 
 
 
145 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1493  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  42.31 
 
 
145 aa  47.4  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4108  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.05 
 
 
169 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.629553  normal  0.177629 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3774  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.29 
 
 
374 aa  47  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2077  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.38 
 
 
136 aa  47  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6241  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  44 
 
 
144 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.837043  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1716  YeeE/YedE  41.51 
 
 
135 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.539971  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3909  hypothetical protein  33.33 
 
 
353 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.192183 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6793  hypothetical protein  39.62 
 
 
140 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0320556 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0742  hypothetical protein  34.43 
 
 
145 aa  45.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2899  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  37.93 
 
 
139 aa  45.8  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1618  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  42 
 
 
137 aa  45.8  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000269171  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0512  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.89 
 
 
176 aa  46.2  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2436  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  41.07 
 
 
147 aa  45.8  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392126  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1478  putative inner membrane protein  25.99 
 
 
414 aa  45.8  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1409  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.07 
 
 
147 aa  45.8  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5568  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  42 
 
 
144 aa  45.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1335  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.29 
 
 
143 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000842724 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0191  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  40 
 
 
145 aa  45.1  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2718  hypothetical protein  44 
 
 
144 aa  45.4  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.814513  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2716  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.59 
 
 
171 aa  45.1  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.653376  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5807  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  45.61 
 
 
159 aa  45.1  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0641705  normal  0.400068 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4717  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  38.46 
 
 
147 aa  45.1  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1759  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  47.06 
 
 
332 aa  44.7  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000112803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>