More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0622 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0622  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 365 aa  742    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1469  DNA-directed DNA polymerase  47.73 
 
 		 368 aa  348  9e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0380  DNA-directed DNA polymerase  50.28 
 
 		 360 aa  340  2e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.158929  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2765  DNA polymerase IV  45.56 
 
 		 367 aa  332  7.000000000000001e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  44.86 
 
 		 354 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  41.94 
 
 		 425 aa  248  9e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  41.57 
 
 		 356 aa  246  3e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1555  DNA-directed DNA polymerase  41.36 
 
 		 422 aa  243  3e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.558973  normal  0.0210398 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  40.29 
 
 		 384 aa  240  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0963  DNA polymerase IV  40.06 
 
 		 395 aa  239  6.999999999999999e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0560  DNA polymerase IV  38.02 
 
 		 365 aa  238  9e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  40.06 
 
 		 408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  38.06 
 
 		 409 aa  233  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  36.13 
 
 		 359 aa  233  3e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  39.5 
 
 		 411 aa  233  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  38.12 
 
 		 389 aa  233  5e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13520  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  37.64 
 
 		 433 aa  233  5e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2368  DNA-directed DNA polymerase  38.58 
 
 		 445 aa  232  7.000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  37.78 
 
 		 393 aa  232  8.000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  40.17 
 
 		 410 aa  229  4e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  37.78 
 
 		 409 aa  228  9e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  40.78 
 
 		 355 aa  228  9e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  40.11 
 
 		 466 aa  228  9e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  37.11 
 
 		 358 aa  227  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  37.75 
 
 		 397 aa  228  2e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  37.75 
 
 		 354 aa  226  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  40.69 
 
 		 378 aa  226  6e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2314  DNA polymerase IV  36.87 
 
 		 364 aa  226  6e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.023311  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  40.69 
 
 		 378 aa  226  6e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  40.37 
 
 		 407 aa  225  7e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  42.49 
 
 		 420 aa  225  9e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  36.18 
 
 		 385 aa  225  9e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0687  DNA-directed DNA polymerase  39.55 
 
 		 444 aa  224  1e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000344848  hitchhiker  0.00527115 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06310  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  38.42 
 
 		 454 aa  224  1e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  39.22 
 
 		 407 aa  224  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  39.66 
 
 		 430 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  36.01 
 
 		 372 aa  224  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  37.1 
 
 		 364 aa  223  3e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  37.99 
 
 		 399 aa  224  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  38.55 
 
 		 395 aa  222  9e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  37.03 
 
 		 359 aa  222  9e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  40.64 
 
 		 419 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  39 
 
 		 378 aa  221  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  38.55 
 
 		 374 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  40.74 
 
 		 419 aa  220  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2332  DNA-directed DNA polymerase  41.81 
 
 		 353 aa  220  3e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.353166  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  39.77 
 
 		 410 aa  219  5e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  42.24 
 
 		 402 aa  219  7e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  39.01 
 
 		 363 aa  219  7e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  36.39 
 
 		 410 aa  218  8.999999999999998e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  38.38 
 
 		 430 aa  218  1e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1330  DNA-directed DNA polymerase  38.01 
 
 		 359 aa  218  1e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64899  normal  0.124466 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  39.33 
 
 		 418 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2166  DNA-directed DNA polymerase  35.93 
 
 		 364 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  37.64 
 
 		 408 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  40.17 
 
 		 414 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  36.65 
 
 		 371 aa  216  7e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0949  DNA-directed DNA polymerase  39.12 
 
 		 385 aa  216  7e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.868276  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  39.27 
 
 		 418 aa  216  7e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  39.04 
 
 		 418 aa  216  7e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  37.99 
 
 		 399 aa  215  7e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  35.45 
 
 		 360 aa  215  8e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  35.53 
 
 		 385 aa  215  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  39.2 
 
 		 415 aa  215  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  37.68 
 
 		 359 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  37.03 
 
 		 412 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2067  DNA-directed DNA polymerase  37.36 
 
 		 388 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0860005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7420  DNA polymerase IV  39.4 
 
 		 429 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108606  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2071  DNA-directed DNA polymerase  37.5 
 
 		 348 aa  212  5.999999999999999e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485173  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  38.18 
 
 		 381 aa  212  7e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  36.03 
 
 		 409 aa  212  9e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6682  DNA polymerase IV  38.81 
 
 		 435 aa  211  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  36.39 
 
 		 409 aa  211  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2123  UMUC-like DNA-repair protein  36.46 
 
 		 387 aa  211  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48636  hitchhiker  0.00329078 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0662  DNA-directed DNA polymerase  35.67 
 
 		 353 aa  210  3e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0629  DNA-directed DNA polymerase  37.2 
 
 		 542 aa  210  3e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  37.29 
 
 		 369 aa  209  4e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1983  DNA polymerase IV  36.44 
 
 		 356 aa  210  4e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1949  DNA polymerase IV  36.44 
 
 		 356 aa  210  4e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2353  DNA-directed DNA polymerase  36.22 
 
 		 413 aa  209  6e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.48043  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3636  DNA polymerase IV  36.63 
 
 		 396 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  38.03 
 
 		 380 aa  208  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  37.18 
 
 		 481 aa  208  1e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0455  DNA polymerase IV  39.69 
 
 		 356 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  36.87 
 
 		 426 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3213  DNA-directed DNA polymerase  37.61 
 
 		 407 aa  207  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  36.36 
 
 		 385 aa  207  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  35.55 
 
 		 425 aa  207  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  39.09 
 
 		 834 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  36.08 
 
 		 413 aa  207  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  38.7 
 
 		 417 aa  207  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3545  UMUC-like DNA-repair protein  37.12 
 
 		 393 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  36.36 
 
 		 391 aa  206  4e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  37.07 
 
 		 378 aa  206  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  36.18 
 
 		 408 aa  206  5e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1323  DNA-directed DNA polymerase  34.32 
 
 		 416 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308192  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1621  DNA polymerase IV  35.51 
 
 		 367 aa  205  8e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1679  DNA polymerase IV  34.93 
 
 		 385 aa  205  1e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.452401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1640  DNA-directed DNA polymerase  37.18 
 
 		 360 aa  205  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.582821 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5287  DNA-directed DNA polymerase  35.75 
 
 		 437 aa  205  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>