More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0615 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 147 aa  298  2e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4235  transcriptional regulator, MarR family  36.5 
 
 		 148 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4196  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 182 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4259  transcriptional regulator, MarR family  36.5 
 
 		 148 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1001  transcriptional regulator, MarR family  36.5 
 
 		 148 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3880  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230852  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  37.23 
 
 		 165 aa  88.6  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4149  transcriptional regulator, MarR family  36.5 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2823  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 148 aa  87.8  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3956  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 148 aa  88.2  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4033  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 148 aa  87  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3866  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 148 aa  87  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0257058  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4348  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 148 aa  87  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 148 aa  67  0.00000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  41.98 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  31.43 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1608  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0698671 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 150 aa  60.1  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 140 aa  60.1  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  32.63 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4527  MarR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  32.63 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  31.53 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0840  regulatory protein, MarR  29.82 
 
 		 170 aa  57.4  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  31.63 
 
 		 158 aa  57  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1190  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 		 148 aa  57  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  39.13 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  31.07 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  37.08 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  30.61 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1376  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0410  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  32.98 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  38.57 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  30.53 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02539  DNA-binding transcriptional repressor of microcin B17 synthesis and multidrug efflux  37.04 
 
 		 176 aa  53.5  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1000  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 		 176 aa  53.5  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2806  transcriptional repressor MprA  37.04 
 
 		 176 aa  53.5  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00193858  hitchhiker  0.00916443 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02504  hypothetical protein  37.04 
 
 		 176 aa  53.5  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2820  transcriptional repressor MprA  37.04 
 
 		 176 aa  53.5  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3192  transcriptional repressor MprA  37.04 
 
 		 176 aa  53.5  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.885571  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 153 aa  53.5  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 153 aa  53.5  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  28.43 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 153 aa  53.5  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1023  transcriptional repressor MprA  37.04 
 
 		 176 aa  53.5  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  28.32 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 155 aa  53.5  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0843  regulatory protein MarR  30 
 
 		 178 aa  52.8  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.852456  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2028  transcriptional regulator, MarR family  26.5 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.400753  hitchhiker  0.000427569 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 143 aa  52.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  29.17 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4830  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.538912  normal  0.641937 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 139 aa  52.8  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  32.29 
 
 		 166 aa  52.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3928  transcriptional repressor MprA  37.04 
 
 		 176 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.500125 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  29.06 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2732  hypothetical protein  25.71 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5772  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 168 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1816  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 160 aa  51.6  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.927572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 167 aa  51.6  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 167 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  31.53 
 
 		 174 aa  51.6  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4328  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 143 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2967  transcriptional repressor MprA  37.04 
 
 		 176 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.771263  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3512  transcriptional regulator, MarR family  25.2 
 
 		 188 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>