More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0612 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  57.1 
 
 		 639 aa  748    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  100 
 
 		 640 aa  1326    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  57.21 
 
 		 631 aa  747    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  54.99 
 
 		 624 aa  693    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  47.51 
 
 		 349 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  48.39 
 
 		 348 aa  335  1e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  46.06 
 
 		 347 aa  335  1e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  47.23 
 
 		 349 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  48.68 
 
 		 348 aa  330  6e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  47.79 
 
 		 339 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  47.23 
 
 		 347 aa  327  3e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  46.65 
 
 		 353 aa  325  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  46.18 
 
 		 350 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  47.94 
 
 		 342 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  43.86 
 
 		 352 aa  315  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  45.29 
 
 		 348 aa  310  5.9999999999999995e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  45.48 
 
 		 349 aa  309  1.0000000000000001e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3937  Agmatine deiminase  44.15 
 
 		 349 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591935  normal  0.116304 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  44.12 
 
 		 346 aa  302  1e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  44.12 
 
 		 352 aa  301  3e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  44.48 
 
 		 347 aa  295  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  47.01 
 
 		 334 aa  293  5e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  43.99 
 
 		 365 aa  289  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  43.35 
 
 		 348 aa  283  8.000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  43.41 
 
 		 334 aa  277  4e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  43.99 
 
 		 343 aa  273  1e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  43.62 
 
 		 351 aa  265  2e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1731  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  49.48 
 
 		 289 aa  258  3e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1941  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  44.7 
 
 		 303 aa  258  3e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.516758 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1608  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  47.33 
 
 		 290 aa  257  5e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1183  peptidyl-arginine deiminase  40.42 
 
 		 370 aa  256  7e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.460045  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0005  hypothetical protein  36.63 
 
 		 347 aa  253  8.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1903  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  47.78 
 
 		 296 aa  253  8.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00174651  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1717  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  46.39 
 
 		 291 aa  251  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0005  hypothetical protein  36.31 
 
 		 346 aa  250  5e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0672  agmatine deiminase  41.24 
 
 		 371 aa  250  7e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.915937  decreased coverage  0.00000489111 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1822  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  46.48 
 
 		 294 aa  247  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1018  hypothetical protein  39.71 
 
 		 341 aa  247  6e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1026  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  47.86 
 
 		 291 aa  247  6e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.451175  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2118  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  46.59 
 
 		 285 aa  246  8e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.556726  normal  0.0624833 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2741  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  46.48 
 
 		 294 aa  246  8e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0707  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  46.21 
 
 		 295 aa  246  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3413  agmatine deiminase  40.47 
 
 		 346 aa  244  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0942  carbon-nitrogen hydrolase family protein  47.78 
 
 		 294 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  36.86 
 
 		 358 aa  243  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2560  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  45.26 
 
 		 291 aa  243  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.195885 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  36.86 
 
 		 368 aa  240  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  36.86 
 
 		 368 aa  239  8e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3938  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  44.13 
 
 		 291 aa  238  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0480903  normal  0.165411 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  37.3 
 
 		 368 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  38.55 
 
 		 344 aa  238  3e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0784  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  43.9 
 
 		 295 aa  238  3e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  38.84 
 
 		 346 aa  237  6e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1444  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  44.41 
 
 		 294 aa  236  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0920298 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2857  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  44.1 
 
 		 292 aa  235  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  0.190038 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4017  agmatine deiminase  38.46 
 
 		 365 aa  234  3e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0693  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  44.44 
 
 		 291 aa  234  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0168  agmatine deiminase  37.57 
 
 		 367 aa  234  5e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52163  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  37.02 
 
 		 371 aa  233  5e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  37.02 
 
 		 371 aa  233  5e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  37.02 
 
 		 365 aa  233  6e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0153  agmatine deiminase  37.29 
 
 		 367 aa  233  6e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0291  agmatine deiminase  38.36 
 
 		 368 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3810  agmatine deiminase  37.57 
 
 		 365 aa  232  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.387298  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1751  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  42.62 
 
 		 307 aa  231  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.294979  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  37.53 
 
 		 368 aa  231  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2623  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  43 
 
 		 299 aa  231  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1746  Agmatine deiminase  38.05 
 
 		 342 aa  230  6e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2962  agmatine deiminase  39.07 
 
 		 374 aa  230  6e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  38.67 
 
 		 369 aa  230  6e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2597  Agmatine deiminase  38.76 
 
 		 340 aa  229  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0204527  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  37.07 
 
 		 372 aa  228  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2447  peptidyl-arginine deiminase  37.35 
 
 		 357 aa  228  3e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2521  agmatine deiminase  37.91 
 
 		 375 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.415458 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  38.66 
 
 		 344 aa  227  6e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2471  peptidyl-arginine deiminase  37.57 
 
 		 343 aa  227  6e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  36.36 
 
 		 368 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1017  amidohydrolase  41.46 
 
 		 295 aa  226  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1447  agmatine deiminase  39.07 
 
 		 342 aa  226  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.994739  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2512  carbon-nitrogen hydrolase  43.21 
 
 		 290 aa  226  1e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  36.1 
 
 		 368 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1510  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  43.54 
 
 		 299 aa  225  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1514  carbon-nitrogen hydrolase family protein  45.21 
 
 		 292 aa  224  3e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2472  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  41.4 
 
 		 293 aa  224  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  36.1 
 
 		 368 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1254  peptidyl-arginine deiminase  40.39 
 
 		 386 aa  224  4e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3416  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  42.12 
 
 		 296 aa  224  4.9999999999999996e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0379108  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  38.6 
 
 		 351 aa  223  7e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1750  peptidyl-arginine deiminase  36.94 
 
 		 350 aa  222  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355031  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  34.71 
 
 		 368 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1834  Agmatine deiminase  36.36 
 
 		 343 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2176  peptidyl-arginine deiminase  36.36 
 
 		 343 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  35.83 
 
 		 364 aa  221  3e-56  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1861  hypothetical protein  37.72 
 
 		 367 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.114437  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0652  Agmatine deiminase  36.31 
 
 		 370 aa  220  6e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3203  agmatine deiminase  37.43 
 
 		 348 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.659757  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3490  agmatine deiminase  37.21 
 
 		 348 aa  219  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  36.65 
 
 		 356 aa  219  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1745  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  41.4 
 
 		 293 aa  218  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1755  agmatine deiminase  36.84 
 
 		 348 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.807714  normal  0.973962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>