84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0537 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0537  50S ribosomal protein L22P  100 
 
 		 154 aa  313  8e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.34854  normal  0.63908 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0447  50S ribosomal protein L22P  71.71 
 
 		 156 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0102501  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0569  50S ribosomal protein L22P  72.08 
 
 		 153 aa  224  2e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0413889  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2248  50S ribosomal protein L22P  60.53 
 
 		 154 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000896212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0086  50S ribosomal protein L22P  56.41 
 
 		 157 aa  186  7e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.438509 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1723  ribosomal protein L22  50.98 
 
 		 152 aa  150  5e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00000443469  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1388  50S ribosomal protein L22P  43.42 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0105  50S ribosomal protein L22P  45.1 
 
 		 151 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.379943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0006  50S ribosomal protein L22P  44.44 
 
 		 151 aa  133  7.000000000000001e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000018702  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1270  50S ribosomal protein L22P  42.11 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000000869512  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0175  50S ribosomal protein L22P  42.11 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000281865  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0648  50S ribosomal protein L22P  42.11 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000866939  hitchhiker  0.000275224 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0714  50S ribosomal protein L22P  40.13 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00766872  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1833  ribosomal protein L22  41.33 
 
 		 153 aa  122  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.271117 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0556  50S ribosomal protein L22P  41.22 
 
 		 168 aa  120  6e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2297  50S ribosomal protein L22P  40.67 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1930  50S ribosomal protein L22P  38.51 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.70908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1516  ribosomal protein L22  40.94 
 
 		 151 aa  110  6e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  9.68145e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1732  50S ribosomal protein L22P  35.81 
 
 		 198 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0748  50S ribosomal protein L22P  35.14 
 
 		 185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0770  50S ribosomal protein L22P  37.16 
 
 		 185 aa  107  7.000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0215  ribosomal protein L22  40.3 
 
 		 165 aa  103  8e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0805  50S ribosomal protein L22  35.06 
 
 		 152 aa  97.8  4e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.589501 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2223  ribosomal protein L22  36.57 
 
 		 159 aa  96.7  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1773  ribosomal protein L22  39.84 
 
 		 157 aa  94.7  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0489  ribosomal protein L22  37.21 
 
 		 127 aa  94.4  6e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2444  50S ribosomal protein L22P  30.87 
 
 		 154 aa  84  6e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0096  50S ribosomal protein L22P  35.88 
 
 		 156 aa  84  7e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000729368  unclonable  0.000000429528 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29177  predicted protein  34.9 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.669765  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32234  Ribosomal protein L17, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  32.41 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.333156 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00776  60S ribosomal protein L17 (AFU_orthologue; AFUA_1G14410)  29.5 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.844288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89240  ribosomal protein L17B  29.71 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01720  60s ribosomal protein l17, putative  28.06 
 
 		 182 aa  51.2  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0291  ribosomal protein L22  31.88 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00562751  normal  0.0409902 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0872  50S ribosomal protein L22  30.43 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233531  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  28.06 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  30.43 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2397  50S ribosomal protein L22  29.71 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0178523  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0063  50S ribosomal protein L22  28.99 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.279384  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1902  50S ribosomal protein L22  28.99 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.40685  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23071  50S ribosomal protein L22  39.71 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2455  50S ribosomal protein L22P  30.43 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.082512 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1519  ribosomal protein L22  29.71 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1179  ribosomal protein L22  37.14 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000146322  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1297  50S ribosomal protein L22  36.11 
 
 		 119 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00515674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0371  50S ribosomal protein L22  38.24 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.300281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  25.36 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  29.71 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1960  50S ribosomal protein L22  39.71 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1359  50S ribosomal protein L22  30.56 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279063  normal  0.0319534 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1684  ribosomal protein L22  30.77 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000041198  hitchhiker  0.0000116755 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2227  50S ribosomal protein L22  38.24 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.793555  normal  0.494658 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17441  50S ribosomal protein L22  38.24 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0201  50S ribosomal protein L22  29.71 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0571206  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20820  LSU ribosomal protein L22P  24.48 
 
 		 125 aa  42  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.594698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  28.26 
 
 		 114 aa  41.6  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2564  50S ribosomal protein L22  36.76 
 
 		 119 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17601  50S ribosomal protein L22  38.24 
 
 		 128 aa  42.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1645  50S ribosomal protein L22  38.24 
 
 		 128 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19981  50S ribosomal protein L22  38.24 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.508737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1345  ribosomal protein L22  36.76 
 
 		 212 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0296  50S ribosomal protein L22  28.26 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.09394e-28 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1124  50S ribosomal protein L22  38.24 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06300  50S ribosomal protein L22  29.41 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.504619  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0286  50S ribosomal protein L22  25 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0125661  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0600  50S ribosomal protein L22  30.43 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000168861  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4744  50S ribosomal protein L22  36.36 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00307262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1560  ribosomal protein L22  26.09 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.671944  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0459  50S ribosomal protein L22  36.36 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.292472  unclonable  0.00000017309 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3904  50S ribosomal protein L22  36.36 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.321312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0492  50S ribosomal protein L22  36.36 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379964  normal  0.101974 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0631  ribosomal protein L22  36.36 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000531978  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08900  50S ribosomal protein L22  36.36 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0235931 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0842  50S ribosomal protein L22  36.36 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4543  50S ribosomal protein L22  36.36 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5074  50S ribosomal protein L22  36.36 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000267076  normal  0.274237 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0489  50S ribosomal protein L22  36.36 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0270  ribosomal protein L22  36.67 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000922526  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  26.81 
 
 		 113 aa  40.8  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  26.81 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  26.81 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  26.81 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  26.81 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0696  50S ribosomal protein L22  36.76 
 
 		 119 aa  40.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00931457  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>