107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0534 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0534  50S ribosomal protein L23P  100 
 
 		 83 aa  166  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.646212  normal  0.481774 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0566  50S ribosomal protein L23P  73.75 
 
 		 82 aa  124  6e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0431079  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2251  50S ribosomal protein L23P  65 
 
 		 82 aa  106  9.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000000299035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0444  50S ribosomal protein L23P  66.25 
 
 		 82 aa  104  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0443463  normal  0.681719 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0083  50S ribosomal protein L23P  56.79 
 
 		 82 aa  96.3  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.657611  normal  0.218333 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0108  50S ribosomal protein L23P  49.4 
 
 		 82 aa  88.6  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0003  50S ribosomal protein L23P  44.58 
 
 		 82 aa  79  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000337619  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2220  ribosomal protein L23  43.21 
 
 		 84 aa  74.3  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0212  ribosomal protein L23  44.58 
 
 		 84 aa  73.2  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2294  50S ribosomal protein L23P  44.3 
 
 		 87 aa  71.6  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1726  ribosomal protein L25/L23  38.75 
 
 		 82 aa  71.2  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0978109  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0805  50S ribosomal protein L23P  41.77 
 
 		 86 aa  70.5  0.000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.720418  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1519  ribosomal protein L23  44.16 
 
 		 87 aa  70.5  0.000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000262554  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1830  50S ribosomal protein L23P  43.04 
 
 		 85 aa  70.1  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.649517 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0815  50S ribosomal protein L23P  45 
 
 		 81 aa  68.6  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0859  50S ribosomal protein L23P  43.04 
 
 		 86 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.455359  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0807  50S ribosomal protein L25/L23  37.66 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.563432 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0793  50S ribosomal protein L23P  41.77 
 
 		 86 aa  67.4  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.110307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0228  ribosomal protein L25/L23  40.26 
 
 		 90 aa  67  0.00000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0031  50S ribosomal protein L23P  41.77 
 
 		 86 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2447  50S ribosomal protein L23P  39.51 
 
 		 84 aa  66.2  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1125  50S ribosomal protein L23P  41.77 
 
 		 86 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1585  50S ribosomal protein L23P  38.75 
 
 		 81 aa  64.7  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2048  50S ribosomal protein L23P  38.75 
 
 		 82 aa  64.3  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.700766 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1798  50S ribosomal protein L23P  41.25 
 
 		 81 aa  63.2  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.217622  normal  0.590833 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0093  50S ribosomal protein L23P  42.5 
 
 		 81 aa  60.8  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000249681  unclonable  0.000000335999 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0315  ribosomal protein L25/L23  44 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.997937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16602  Ribosomal protein L23a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  33.75 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  48.44 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00350  ribosomal protein, putative  37.04 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  48.98 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  49.18 
 
 		 94 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20850  LSU ribosomal protein L23P  54.17 
 
 		 107 aa  50.1  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  43.94 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1776  ribosomal protein L23  39.19 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1547  50S ribosomal protein L23  42.86 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1366  50S ribosomal protein L23  44 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.263915  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  45.61 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  48.15 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29720  LSU ribosomal protein L23P  52.08 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3446  50S ribosomal protein L23  55.1 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.947767  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0710  50S ribosomal protein L23  37.29 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.58529  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1294  50S ribosomal protein L23  42.37 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000921122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0869  50S ribosomal protein L23  39.06 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000185087  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  44.26 
 
 		 95 aa  43.9  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2905  50S ribosomal protein L23  40.68 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000254231  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5068  50S ribosomal protein L23  42.86 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.304969 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2294  50S ribosomal protein L23  38.6 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0336822  normal  0.0105282 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1743  50S ribosomal protein L23  37.14 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745247  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1572  Ribosomal protein L25/L23  46.15 
 
 		 97 aa  42.7  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000483803  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08856  60S ribosomal protein L23 (AFU_orthologue; AFUA_5G05630)  41.38 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  41.79 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2297  50S ribosomal protein L23  53.06 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1557  ribosomal protein L25/L23  40.58 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271789  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61259  predicted protein  32.47 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0690  Ribosomal protein L25/L23  46.81 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1681  50S ribosomal protein L23  48.08 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0570438  hitchhiker  0.0000115816 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00732  50S ribosomal protein L23  41.51 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  48.21 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0322  50S ribosomal protein L23  39.29 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00637694  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  48.48 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  48.21 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17140  50S ribosomal protein L23  43.75 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.538328  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  46.55 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001740  LSU ribosomal protein L23p (L23Ae)  41.51 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000423409  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2657  Ribosomal protein L25/L23  48 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1228  50S ribosomal protein L23  44 
 
 		 98 aa  41.6  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.195733  unclonable  0.00000945894 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2973  50S ribosomal protein L23  43.75 
 
 		 101 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.505088  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2172  50S ribosomal protein L23  40 
 
 		 100 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267938  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1356  ribosomal protein L25/L23  46.43 
 
 		 103 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.385939  normal  0.0499735 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5785  Ribosomal protein L25/L23  39.68 
 
 		 95 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0742289 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2685  50S ribosomal protein L23  43.75 
 
 		 101 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.85807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  39.51 
 
 		 98 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4345  Ribosomal protein L25/L23  40.35 
 
 		 95 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000178584  normal  0.183841 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0703  50S ribosomal protein L23  47.17 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000032639  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1865  50S ribosomal protein L23  36.23 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0212066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  38.27 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0267  50S ribosomal protein L23  39.66 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000129072  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0629  Ribosomal protein L25/L23  45.83 
 
 		 100 aa  41.2  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0194  Ribosomal protein L25/L23  44.23 
 
 		 94 aa  41.2  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0060  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.735142  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4274  50S ribosomal protein L23  35.14 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000576147  unclonable  0.00000000000382148 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0291  50S ribosomal protein L23  38.89 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0604  Ribosomal protein L25/L23  38.1 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3182  50S ribosomal protein L23  42.86 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0330  ribosomal protein L23  42.86 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2816  50S ribosomal protein L23  46 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.947427  normal  0.439693 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0289  50S ribosomal protein L23  46 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0312226  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2227  50S ribosomal protein L23  38.89 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000627291  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3665  50S ribosomal protein L23  51.02 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0250  50S ribosomal protein L23  46.43 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06270  50S ribosomal protein L23  41.94 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219554  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3141  Ribosomal protein L25/L23  46.81 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.457141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0247  50S ribosomal protein L23  46.43 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23041  50S ribosomal protein L23  39.22 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  41.18 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0374  50S ribosomal protein L23  43.14 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0293  50S ribosomal protein L23  38.71 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>