217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0454 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  100 
 
 
135 aa  280  3.0000000000000004e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  67.91 
 
 
135 aa  201  2e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0966  hemerythrin-like, metal-binding  60.45 
 
 
135 aa  176  7e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208932  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0508  hemerythrin  47.41 
 
 
135 aa  139  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  47.01 
 
 
135 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0386  hemerythrin-like metal-binding protein  47.41 
 
 
135 aa  130  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235664  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3121  hemerythrin-like, metal-binding protein  44.78 
 
 
135 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.86 
 
 
722 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  41.79 
 
 
135 aa  123  9e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149718  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  39.69 
 
 
158 aa  114  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1539  hemerythrin-like metal-binding protein  38.81 
 
 
135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0293600000000005e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2701  hemerythrin-like metal-binding protein  40.48 
 
 
135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000332936  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0453  hemerythrin-like metal-binding protein  41.86 
 
 
138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2752  hemerythrin-like, metal-binding  40.8 
 
 
135 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.81 
 
 
526 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.534221  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0550  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.97 
 
 
518 aa  106  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0126879 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3650  hemerythrin-like, metal-binding  39.1 
 
 
132 aa  105  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151887  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40 
 
 
518 aa  105  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.46 
 
 
529 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.46 
 
 
529 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0827  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.46 
 
 
529 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.456094 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.46 
 
 
529 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.36 
 
 
689 aa  103  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  37.01 
 
 
133 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3890  methyl-accepting chemotaxis protein  38.46 
 
 
529 aa  102  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.46 
 
 
529 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.46 
 
 
529 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129252 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4221  hemerythrin family protein  41.22 
 
 
188 aa  102  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568355  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3223  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.06 
 
 
529 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000784984 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.36 
 
 
779 aa  101  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.532561  normal  0.695827 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.88 
 
 
518 aa  101  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  34.92 
 
 
133 aa  101  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00047967 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0715  hemerythrin family protein  40.3 
 
 
131 aa  99  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651175  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2835  hemerythrin-like metal-binding protein  38.71 
 
 
143 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.06522  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0434  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.12 
 
 
579 aa  97.8  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3958  hemerythrin-like metal-binding protein  38.02 
 
 
131 aa  98.2  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000239483 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2773  hemerythrin-like metal-binding protein  37.3 
 
 
145 aa  97.4  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0368703  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.8 
 
 
941 aa  97.4  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.328788  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0256  hypothetical protein  37.4 
 
 
145 aa  96.3  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1467  hemerythrin-like metal-binding protein  36.51 
 
 
145 aa  96.3  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.437815 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1333  hypothetical protein  36.51 
 
 
153 aa  96.3  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.792826 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2447  hemerythrin-like metal-binding protein  36.03 
 
 
615 aa  95.5  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.148826  normal  0.0273457 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.64 
 
 
530 aa  93.6  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.85 
 
 
515 aa  93.2  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0612  hemerythrin-like metal-binding protein  35.71 
 
 
142 aa  92  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.326939  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.85 
 
 
515 aa  92.8  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3870  hemerythrin-like metal-binding protein  34.71 
 
 
131 aa  92.8  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1698  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.12 
 
 
963 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3651  hemerythrin-like, metal-binding  33.85 
 
 
152 aa  91.3  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766451  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.64 
 
 
1032 aa  90.9  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000134562  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0633  hemerythrin-like metal-binding protein  34.92 
 
 
173 aa  90.1  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10440  hemerythrin-like metal-binding protein  35.38 
 
 
138 aa  88.6  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000654042  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.59 
 
 
994 aa  87.8  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  34.38 
 
 
736 aa  87.4  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42860  hypothetical protein  35.2 
 
 
153 aa  87  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0407  hypothetical protein  35.71 
 
 
161 aa  87  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.388824  normal  0.189045 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2168  iron-binding protein, hemerythrin  33.86 
 
 
130 aa  87  9e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0820701  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1013  hemerythrin-related protein  30.3 
 
 
137 aa  86.7  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3115  hemerythrin-like metal-binding protein  35.56 
 
 
133 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.278333  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1400  hemerythrin-like metal-binding protein  31.58 
 
 
155 aa  86.7  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3216  hemerythrin-like metal-binding protein  35.56 
 
 
133 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3599  hypothetical protein  35.2 
 
 
153 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4236  hemerythrin family protein  36.15 
 
 
192 aa  85.1  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.385764  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0173  hemerythrin-like metal-binding protein  35.71 
 
 
132 aa  85.1  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2454  cyclic nucleotide-binding protein  33.88 
 
 
871 aa  84  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0230  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.85 
 
 
963 aa  83.6  9e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3954  PAS:GGDEF:hemerythrin HHE cation binding region  32.79 
 
 
667 aa  82.8  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.567366  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0834  hemerythrin-like, metal-binding protein  34.96 
 
 
155 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3016  hemerythrin-like, metal-binding protein  34.07 
 
 
133 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2484  hemerythrin-like metal-binding protein  32.56 
 
 
130 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0423908  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2058  hemerythrin-like metal-binding protein  31.3 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0326251  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1809  hemerythrin-like metal-binding protein  30.83 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.216325  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0183  hemerythrin-like metal-binding protein  36.8 
 
 
135 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228116  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3168  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.96 
 
 
926 aa  81.6  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000240071  normal  0.0523799 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4355  hypothetical protein  33.6 
 
 
213 aa  82  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.340338  normal  0.157708 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2998  hemerythrin-like metal-binding protein  37.01 
 
 
135 aa  81.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.541154 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.79 
 
 
559 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.191486  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4443  hemerythrin-like, metal-binding  27.27 
 
 
134 aa  80.9  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1401  hemerythrin-like metal-binding protein  32.85 
 
 
146 aa  80.9  0.000000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2929  hypothetical protein  32 
 
 
131 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2359  hemerythrin-like metal-binding protein  31.75 
 
 
131 aa  80.5  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236367  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1074  hemerythrin-like metal-binding protein  33.06 
 
 
360 aa  80.1  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1745  hemerythrin family protein  32.54 
 
 
131 aa  80.1  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4300  hemerythrin-like metal-binding protein  33.87 
 
 
134 aa  80.1  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.77512  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1302  hemerythrin family protein  32.52 
 
 
143 aa  79  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0465  hemerythrin-like metal-binding protein  32.03 
 
 
128 aa  79  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0529238  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4225  hemerythrin-like metal-binding protein  32.82 
 
 
133 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960265  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2241  hemerythrin-like metal-binding protein  34.13 
 
 
134 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4100  hemerythrin-like, metal-binding protein  32.82 
 
 
133 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4250  hemerythrin-like metal-binding protein  32.82 
 
 
133 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.507447  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4102  hemerythrin-like metal-binding protein  41.67 
 
 
90 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2455  hemerythrin-like metal-binding protein  30.16 
 
 
151 aa  77.4  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0327  hemerythrin-like metal-binding protein  28.68 
 
 
137 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1974  hemerythrin-like metal-binding protein  32.58 
 
 
147 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.579152  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1984  hemerythrin-like metal-binding protein  33.08 
 
 
134 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1585  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.67 
 
 
997 aa  77  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0506564  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3562  hemerythrin-like metal-binding protein  33.33 
 
 
138 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4119  hemerythrin-like metal-binding protein  33.07 
 
 
133 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.186868 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1655  hemerythrin HHE cation binding region  34.15 
 
 
148 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000138474  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0099  hemerythrin-like metal-binding protein  30.4 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.161287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>