More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0426 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  100 
 
 
256 aa  494  1e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  44.92 
 
 
251 aa  208  8e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  42.46 
 
 
254 aa  193  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  40.15 
 
 
264 aa  185  7e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  39.84 
 
 
249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  40.64 
 
 
250 aa  180  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  40.56 
 
 
249 aa  176  5e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  40.96 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  40.87 
 
 
249 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  40.23 
 
 
264 aa  170  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  37.15 
 
 
253 aa  170  2e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  37.94 
 
 
253 aa  170  3e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  38.34 
 
 
249 aa  169  5e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  36.61 
 
 
256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  36.61 
 
 
256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  36.76 
 
 
253 aa  166  4e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  36.4 
 
 
253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  38.1 
 
 
249 aa  162  6e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  37.3 
 
 
255 aa  156  3e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  33.46 
 
 
255 aa  154  1e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  39.91 
 
 
270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  41.67 
 
 
281 aa  152  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2893  ABC-2 type transporter  35.27 
 
 
270 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  38.64 
 
 
284 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1125  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  37.6 
 
 
260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.742933  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  36.57 
 
 
253 aa  146  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  34 
 
 
254 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  39.82 
 
 
289 aa  142  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  35.91 
 
 
288 aa  140  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0215  ABC-2 type transporter  37.96 
 
 
275 aa  132  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716105  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2221  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  32.64 
 
 
273 aa  126  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000454003  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  29.96 
 
 
260 aa  125  5e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  37.05 
 
 
280 aa  125  9e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  31.05 
 
 
285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  29.89 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  29.52 
 
 
289 aa  120  3e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0427  ABC-2 type transporter  30.74 
 
 
278 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.469533  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  30.61 
 
 
256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0242  ABC-2 type transporter  31 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  27.46 
 
 
254 aa  113  4.0000000000000004e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  29.92 
 
 
242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  29.92 
 
 
290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2515  ABC transporter, permease protein  29.52 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0251  ABC-2 type transporter  32.88 
 
 
255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.452318 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  33.04 
 
 
261 aa  108  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0685  ABC transporter, permease protein  32.79 
 
 
277 aa  106  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.537478  normal  0.14182 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  31.67 
 
 
252 aa  105  5e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 
251 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2794  hypothetical protein  28.63 
 
 
276 aa  103  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2499  ABC-2 transporter component  30.84 
 
 
276 aa  102  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  30.36 
 
 
256 aa  101  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  28.83 
 
 
256 aa  99.8  4e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0010  ABC-2 type transporter  28.05 
 
 
280 aa  95.1  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5948  ABC transporter permease  27.88 
 
 
284 aa  93.6  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0673459  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  27.84 
 
 
243 aa  92  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3931  ABC-2 type transporter  30.43 
 
 
263 aa  91.3  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284935  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  34.11 
 
 
304 aa  91.7  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0723  ABC-2 type transporter  30.8 
 
 
272 aa  91.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0756908 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  33.17 
 
 
293 aa  90.9  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1789  ABC-2 type transporter  33.91 
 
 
261 aa  89.7  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2013  ABC-2 type transporter  28.38 
 
 
256 aa  89  8e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000119274  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0945  ABC transporter related  30.37 
 
 
665 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1034  ABC-2 type transporter  27.93 
 
 
256 aa  88.2  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.150436 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2667  ABC transporter  26.85 
 
 
263 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0137793  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3096  ABC-2 type transporter  26.85 
 
 
263 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  30.41 
 
 
241 aa  86.7  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3136  ABC-2 type transporter  26.69 
 
 
263 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1894  putative daunorubicin resistance ABC transporter, permease protein  28.44 
 
 
260 aa  86.3  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2328  transporter, putative  33.33 
 
 
246 aa  85.5  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.117528  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2261  ABC-2 type transporter  26.39 
 
 
260 aa  85.5  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121091  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1861  ABC-2 type transporter  28.07 
 
 
258 aa  85.5  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  30.94 
 
 
255 aa  85.1  9e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0249  hypothetical protein  26.32 
 
 
281 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0025  ABC-2 type transporter  25.33 
 
 
290 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  26.99 
 
 
270 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  30.49 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  30.49 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0808  hypothetical protein  29.87 
 
 
253 aa  84  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283236  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1936  ABC-2 type transporter  29.03 
 
 
286 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0030  ABC-2 type transporter  27.16 
 
 
272 aa  84.3  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2613  ABC-2 type transporter  25.79 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.937981  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2845  ABC-2 type transporter  26.94 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2056  ABC-2 type transporter  32.44 
 
 
251 aa  82.8  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.374499  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1851  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 
297 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.894723 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2186  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 
297 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1912  ABC-2 type transporter  30.34 
 
 
253 aa  82  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.846791  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2668  putative ABC-2 type transporter  27.56 
 
 
263 aa  82  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.149875  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1802  ABC-2 type transporter  27.35 
 
 
293 aa  82  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.454939 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  24.45 
 
 
269 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1245  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 
292 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0464218  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  27.59 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2587  ABC multidrug efflux transporter, inner membrane subunit  28.57 
 
 
286 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1750  putative multidrug efflux ABC transporter  32.44 
 
 
277 aa  80.9  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0190039  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  27.72 
 
 
286 aa  80.5  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1796  ABC-2 type transporter  26.41 
 
 
280 aa  80.1  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000116393 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0552  ABC-2 type transporter  30.22 
 
 
244 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0176  hypothetical protein  25.4 
 
 
241 aa  79.3  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67071  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1079  ABC-2 type transporter  32.02 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1533  ABC-2 type transporter  24.8 
 
 
274 aa  79  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0010  ABC-2 type transporter  27.65 
 
 
277 aa  78.6  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0265688  normal  0.974707 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>