More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0356 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1371  aminotransferase class V  84.42 
 
 		 387 aa  660    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00447816  normal  0.862029 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0356  aminotransferase, class V  100 
 
 		 390 aa  802    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.230832 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  53.7 
 
 		 389 aa  418  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1063  aminotransferase class V  51.58 
 
 		 388 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  52.51 
 
 		 388 aa  409  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_002978  WD0997  cysteine desulfurase  50.78 
 
 		 415 aa  407  1.0000000000000001e-112  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1092  Cysteine desulfurase  51.32 
 
 		 388 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.793736 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  52.62 
 
 		 403 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  51.57 
 
 		 417 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  50.78 
 
 		 405 aa  395  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3449  cysteine desulfurase  49.87 
 
 		 389 aa  394  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0629  cysteine desulfurase  50 
 
 		 410 aa  394  1e-108  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0410  cysteine desulfurase  49.09 
 
 		 422 aa  391  1e-107  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  53 
 
 		 383 aa  389  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  50.9 
 
 		 403 aa  387  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  49.74 
 
 		 405 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  51.56 
 
 		 384 aa  382  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1493  cysteine desulfurase IscS  48.7 
 
 		 419 aa  383  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  48.95 
 
 		 407 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  51.56 
 
 		 384 aa  383  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3416  aminotransferase class V  51.06 
 
 		 399 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  48.17 
 
 		 407 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  48.72 
 
 		 507 aa  377  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  48.43 
 
 		 405 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  48.17 
 
 		 405 aa  378  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  49.22 
 
 		 392 aa  375  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  48.46 
 
 		 405 aa  375  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  49.48 
 
 		 406 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0469  cysteine desulfurase IscS  47.92 
 
 		 419 aa  377  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00221025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  48.43 
 
 		 405 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  48.95 
 
 		 407 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  49.21 
 
 		 407 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  49.21 
 
 		 407 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  46.63 
 
 		 407 aa  372  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  49.21 
 
 		 407 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1950  cysteine desulfurase IscS  48.56 
 
 		 405 aa  373  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000843977  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  48.95 
 
 		 407 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  47.8 
 
 		 407 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  49.21 
 
 		 407 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  49.21 
 
 		 407 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0041  aminotransferase class V  53.83 
 
 		 389 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  48.43 
 
 		 407 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  48.43 
 
 		 403 aa  374  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  47.8 
 
 		 407 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2059  cysteine desulfurase IscS  48.46 
 
 		 407 aa  373  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0733618  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  47.8 
 
 		 407 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  49.21 
 
 		 407 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  48.06 
 
 		 407 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0822  cysteine desulfurase IscS  46.63 
 
 		 421 aa  372  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.02372  normal  0.880264 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  47.8 
 
 		 407 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  47.8 
 
 		 407 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45194  predicted protein  47.09 
 
 		 395 aa  370  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0622302  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  47.18 
 
 		 405 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  48.18 
 
 		 404 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1487  cysteine desulfurase IscS  48.7 
 
 		 406 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000124631  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  47.91 
 
 		 407 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0808  cysteine desulfurase IscS  47.42 
 
 		 405 aa  371  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000772731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  47.18 
 
 		 399 aa  368  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0247  cysteine desulfurase  48.43 
 
 		 403 aa  366  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0618  cysteine desulfurase  49.74 
 
 		 404 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0627  cysteine desulfurase  49.74 
 
 		 404 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  46.63 
 
 		 403 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1629  cysteine desulfurase IscS  46.55 
 
 		 408 aa  365  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000331255  hitchhiker  0.0000285871 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85588  predicted protein  47.79 
 
 		 493 aa  367  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.464986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0592  cysteine desulfurase  49.74 
 
 		 404 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0303  cysteine desulfurase  49.32 
 
 		 402 aa  365  1e-100  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2178  cysteine desulfurase IscS  46.92 
 
 		 405 aa  366  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000963732  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01055  cysteine desulfurase  48.7 
 
 		 404 aa  366  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  46.37 
 
 		 436 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  46.37 
 
 		 436 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  49.87 
 
 		 394 aa  363  2e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2262  cysteine desulfurase  46.35 
 
 		 406 aa  363  2e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  49.1 
 
 		 392 aa  363  4e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  48.32 
 
 		 414 aa  363  4e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  48.85 
 
 		 390 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  46.35 
 
 		 403 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0277  cysteine desulfurase  47.92 
 
 		 404 aa  362  6e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284858  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  47.66 
 
 		 404 aa  361  9e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4336  cysteine desulfurase  46.61 
 
 		 404 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.180367  hitchhiker  0.00000000219205 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0637  cysteine desulfurase  48.7 
 
 		 404 aa  361  1e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273964 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0830  cysteine desulfurase IscS  46.67 
 
 		 407 aa  361  1e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.184128 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  47.92 
 
 		 404 aa  360  2e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  47.92 
 
 		 404 aa  360  2e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  47.92 
 
 		 404 aa  360  2e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  47.92 
 
 		 404 aa  360  2e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  47.92 
 
 		 404 aa  360  2e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1841  cysteine sulfinate desulfinase, NifS-like  49.58 
 
 		 384 aa  360  2e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.131774  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  47.92 
 
 		 404 aa  360  2e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  47.92 
 
 		 404 aa  360  2e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  47.92 
 
 		 404 aa  360  2e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  47.92 
 
 		 404 aa  360  2e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  47.4 
 
 		 404 aa  361  2e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  47.92 
 
 		 404 aa  360  2e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  47.4 
 
 		 404 aa  360  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  47.4 
 
 		 404 aa  360  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  47.4 
 
 		 404 aa  360  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  47.4 
 
 		 404 aa  360  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1299  cysteine desulfurase  47.92 
 
 		 404 aa  359  4e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0382772  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  48.18 
 
 		 382 aa  359  4e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3027  cysteine desulfurase  47.66 
 
 		 404 aa  359  5e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0576674  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>