41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0330 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0330  SirA family protein  100 
 
 		 75 aa  154  3e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0046  SirA family protein  39.19 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0379  SirA family protein  50 
 
 		 325 aa  54.3  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0718  SirA family protein  42.86 
 
 		 76 aa  53.5  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1817  ArsR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 184 aa  49.3  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0130872  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1812  SirA family protein  36.99 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000207986  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1758  SirA family protein  36.99 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708198  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1763  SirA family protein  32.76 
 
 		 181 aa  46.2  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144222  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1466  SirA family protein  35.62 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1209  SirA family protein  33.33 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2100  hypothetical protein  37.5 
 
 		 73 aa  46.2  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1366  SirA family protein  33.33 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4184  SirA family protein  37.5 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.842151  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0855  SirA family protein  33.33 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.412959  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00560  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  32 
 
 		 76 aa  43.5  0.0009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1310  SirA family protein  31.88 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0510  SirA family protein  36.62 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000586624  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1048  hypothetical protein  32 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.609594  normal  0.0924415 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1220  hypothetical protein  32 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.466451  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2945  hypothetical protein  32 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.91003  hitchhiker  0.00000000000335476 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01901  hypothetical protein  32 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2303  hypothetical protein  32 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2150  hypothetical protein  32 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4368  SirA family protein  36.11 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1822  redox protein, regulator of disulfide bond formation  32.89 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0447  SirA-like  36.23 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1739  hypothetical protein  32.89 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.626352 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01915  hypothetical protein  32 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0643  SirA family protein  31.88 
 
 		 70 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1628  SirA family protein  32 
 
 		 75 aa  41.6  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.241969 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1319  SirA family protein  37.74 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.514232  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04730  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  39.66 
 
 		 76 aa  42  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1645  SirA family protein  32 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  28 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0588  hypothetical protein  44.44 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.456844  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1293  SirA family protein  31.94 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1620  SirA family protein  32.39 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.591727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0043  hypothetical protein  33.85 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3934  SirA family protein  35.14 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.125725  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22790  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  34.67 
 
 		 75 aa  40  0.01  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7291  SirA family protein  34.78 
 
 		 87 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>