More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0320 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2699  chaperonin Cpn60/TCP-1  66.09 
 
 		 527 aa  716    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0320  chaperonin Cpn60/TCP-1  100 
 
 		 536 aa  1078    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.659362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2395  chaperonin Cpn60/TCP-1  82.11 
 
 		 530 aa  887    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.418738 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  63.15 
 
 		 532 aa  657    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.674517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0271  chaperonin Cpn60/TCP-1  68.12 
 
 		 529 aa  722    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.25851  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0771  hypothetical protein  59.58 
 
 		 528 aa  630  1e-179  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0291157  hitchhiker  0.000000204198 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2146  thermosome, chaperonin Cpn60/TCP-1  52.39 
 
 		 542 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0769  thermosome  53.33 
 
 		 543 aa  541  9.999999999999999e-153  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1287  thermosome  52.31 
 
 		 551 aa  523  1e-147  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312902  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1084  Hsp60  49.07 
 
 		 543 aa  519  1e-146  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1201  Hsp60  49.33 
 
 		 555 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0199  thermosome  52.96 
 
 		 552 aa  513  1e-144  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0916  thermosome  49.13 
 
 		 560 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1131  thermosome  49.91 
 
 		 539 aa  507  9.999999999999999e-143  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0206  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  50.28 
 
 		 551 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.609669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0032  thermosome  51.41 
 
 		 551 aa  505  9.999999999999999e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0315  thermosome  51.22 
 
 		 547 aa  503  1e-141  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2549  thermosome  50.66 
 
 		 552 aa  497  1e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.143505 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2346  thermosome  50.37 
 
 		 553 aa  489  1e-137  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0060  thermosome  48.94 
 
 		 545 aa  486  1e-136  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.869644  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1157  thermosome  48.94 
 
 		 542 aa  484  1e-135  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0291  thermosome  47.49 
 
 		 545 aa  485  1e-135  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00322261  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0761  thermosome  48.55 
 
 		 542 aa  480  1e-134  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0693  thermosome  47.22 
 
 		 553 aa  480  1e-134  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.540733  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0828  thermosome  48.17 
 
 		 543 aa  476  1e-133  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2095  thermosome  46.36 
 
 		 557 aa  472  1e-132  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1792  thermosome  47.22 
 
 		 570 aa  472  1e-132  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1023  thermosome  48.21 
 
 		 543 aa  473  1e-132  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0733  thermosome  48.46 
 
 		 541 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0971  thermosome  46.23 
 
 		 552 aa  461  9.999999999999999e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.497136  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2662  thermosome  45.79 
 
 		 563 aa  461  9.999999999999999e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3659  thermosome  47.23 
 
 		 558 aa  450  1e-125  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0699  thermosome  44.49 
 
 		 558 aa  451  1e-125  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.758666  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1270  thermosome  43.93 
 
 		 559 aa  451  1e-125  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0027  thermosome  44.93 
 
 		 557 aa  447  1.0000000000000001e-124  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.196401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1960  thermosome subunit, group II chaperonin  46.5 
 
 		 500 aa  444  1e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3171  thermosome subunit  44.91 
 
 		 547 aa  442  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000559701 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1258  thermosome  44.34 
 
 		 554 aa  435  1e-120  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1851  thermosome  44.13 
 
 		 559 aa  432  1e-120  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0805773  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2264  thermosome  43.44 
 
 		 553 aa  433  1e-120  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.802406 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1710  thermosome  44.63 
 
 		 562 aa  432  1e-119  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1577  thermosome  42.53 
 
 		 540 aa  429  1e-119  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1469  thermosome  41.68 
 
 		 554 aa  427  1e-118  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  43.33 
 
 		 537 aa  424  1e-117  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.862112  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1323  thermosome  44.61 
 
 		 548 aa  423  1e-117  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.678735 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0007  thermosome  41.45 
 
 		 558 aa  413  1e-114  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3025  thermosome  42.64 
 
 		 561 aa  415  1e-114  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0958  thermosome  44.51 
 
 		 554 aa  410  1e-113  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1771  thermosome subunit  42.67 
 
 		 554 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000503304 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1052  thermosome subunit  43.75 
 
 		 549 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1704  thermosome  42.29 
 
 		 558 aa  404  1e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.52837 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2135  thermosome  43.86 
 
 		 550 aa  402  1e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0501  thermosome  43.13 
 
 		 560 aa  403  1e-111  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.41409 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0416  thermosome  42.05 
 
 		 548 aa  402  9.999999999999999e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.213711 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1525  thermosome  42.75 
 
 		 553 aa  394  1e-108  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2121  chaperonin Cpn60/TCP-1  40.08 
 
 		 555 aa  392  1e-107  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3203  chaperonin Cpn60/TCP-1  41.02 
 
 		 528 aa  368  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.203796 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2113  chaperonin Cpn60/TCP-1  38.84 
 
 		 546 aa  365  1e-99  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2902  chaperonin Cpn60/TCP-1  40.92 
 
 		 525 aa  359  8e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.174384  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0864  chaperonin Cpn60/TCP-1  39.12 
 
 		 519 aa  354  2e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2827  chaperonin Cpn60/TCP-1  40.87 
 
 		 525 aa  350  4e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.27751  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0790  thermosome  36.31 
 
 		 535 aa  336  7.999999999999999e-91  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01290  t-complex protein 1, delta subunit (tcp-1-delta), putative  37.33 
 
 		 535 aa  331  2e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.692548  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88066  predicted protein  35.98 
 
 		 527 aa  323  5e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0363344 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21430  predicted protein  36.33 
 
 		 541 aa  318  1e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03134  T-complex protein 1 (Broad)  35.39 
 
 		 538 aa  317  3e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.257749 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30446  predicted protein  35.59 
 
 		 529 aa  315  1.9999999999999998e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_66007  T-complex protein 1, epsilon subunit  35.51 
 
 		 550 aa  311  2e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00830  t-complex protein 1, alpha subunit (tcp-1-alpha), putative  36.81 
 
 		 558 aa  311  2.9999999999999997e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81386  predicted protein  36.67 
 
 		 553 aa  310  5.9999999999999995e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87451  predicted protein  35.59 
 
 		 527 aa  307  4.0000000000000004e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452422  decreased coverage  0.00282742 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02918  t-complex protein 1, delta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07830)  35.67 
 
 		 536 aa  306  5.0000000000000004e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.116367 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01960  conserved hypothetical protein  34.01 
 
 		 567 aa  299  7e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25908  predicted protein  34.57 
 
 		 553 aa  299  1e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19811  predicted protein  34.57 
 
 		 553 aa  299  1e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34049  predicted protein  35.5 
 
 		 542 aa  296  6e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.013996  normal  0.104894 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01904  t-complex protein 1, epsilon subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07540)  34.35 
 
 		 548 aa  295  1e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.512875  normal  0.991941 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02149  t-complex protein 1, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16020)  34.43 
 
 		 568 aa  294  3e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00480  T-complex protein 1 epsilon subunit, putative  35.34 
 
 		 548 aa  292  1e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49043  predicted protein  34.79 
 
 		 536 aa  291  3e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0141345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21789  predicted protein  33.27 
 
 		 559 aa  287  4e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207672  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66456  T-complex protein 1, delta subunit (TCP-1-delta) (CCT-delta)  32.96 
 
 		 533 aa  286  5e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26980  predicted protein  35.51 
 
 		 551 aa  284  2.0000000000000002e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24942  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85255  predicted protein  34.4 
 
 		 542 aa  283  6.000000000000001e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37131  predicted protein  34.67 
 
 		 577 aa  280  6e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42602  predicted protein  33.21 
 
 		 530 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.316899 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02460  t-complex protein 1, zeta subunit (tcp-1-zeta), putative  32.58 
 
 		 552 aa  261  3e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830505  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25463  predicted protein  31.95 
 
 		 570 aa  260  4e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.261555  decreased coverage  0.000278196 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02700  t-complex protein 1, eta subunit (tcp-1-eta), putative  31.11 
 
 		 560 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0993409  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49114  predicted protein  32.11 
 
 		 527 aa  250  4e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.024249  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00381  t-complex protein 1, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01740)  31.56 
 
 		 531 aa  250  5e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.469207  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04280  t-complex protein 1, beta subunit (tcp-1-beta), putative  31.45 
 
 		 523 aa  249  1e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03070  t-complex protein 1, zeta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09590)  31.96 
 
 		 539 aa  248  2e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.470693 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03610  t-complex protein 1, theta subunit (tcp-1-theta), putative  30.54 
 
 		 547 aa  243  7.999999999999999e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05713  t-complex protein 1, eta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06710)  30.74 
 
 		 563 aa  240  4e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74533  cytoplasmic chaperonin of the Cct ring complex  30.21 
 
 		 558 aa  234  4.0000000000000004e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.265552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89309  predicted protein  32.44 
 
 		 526 aa  233  7.000000000000001e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.140079  normal  0.133549 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34150  predicted protein  31.35 
 
 		 541 aa  229  1e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00879554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29714  predicted protein  32.09 
 
 		 534 aa  222  9.999999999999999e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191135  hitchhiker  0.0018905 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19801  predicted protein  32.09 
 
 		 534 aa  222  9.999999999999999e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.289192  normal  0.0151262 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>