18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0287 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0287  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 632 aa  1302    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00361715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0336  hypothetical protein  37.58 
 
 		 705 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1081  putative transcriptional regulator  36.05 
 
 		 492 aa  103  7e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3033  hypothetical protein  31.95 
 
 		 756 aa  98.2  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02080  hypothetical protein  28.65 
 
 		 764 aa  90.9  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.701469  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3084  hypothetical protein  29.7 
 
 		 778 aa  89.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5330  putative transcriptional regulator  31.36 
 
 		 313 aa  89.7  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1143  hypothetical protein  37.07 
 
 		 277 aa  78.6  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.046118  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0157  AAA ATPase  27.89 
 
 		 382 aa  76.6  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3359  divergent AAA region  30.19 
 
 		 348 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0553  putative transcriptional regulator  40.85 
 
 		 489 aa  58.9  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2295  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 208 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.00086981 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  32.32 
 
 		 455 aa  50.8  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  29.68 
 
 		 433 aa  50.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1509  putative transcriptional regulator  38.36 
 
 		 223 aa  46.2  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.452011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1740  putative transcriptional regulator  40.58 
 
 		 230 aa  45.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.952214  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1712  putative transcriptional regulator  28.85 
 
 		 138 aa  44.3  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.111866  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0827  hypothetical protein  31.37 
 
 		 574 aa  44.3  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>