More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0267 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 202 aa  415  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  59.9 
 
 		 202 aa  249  2e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0283  Radical SAM domain protein  60.89 
 
 		 202 aa  234  7e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.173391  normal  0.103255 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  54.95 
 
 		 202 aa  228  3e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  52.74 
 
 		 234 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  47.06 
 
 		 223 aa  171  5.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  42.16 
 
 		 212 aa  164  8e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  43.14 
 
 		 212 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  45.1 
 
 		 216 aa  161  7e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  43.14 
 
 		 210 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  43.14 
 
 		 210 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  42.16 
 
 		 210 aa  157  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  42.23 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  39.9 
 
 		 209 aa  155  4e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  42.65 
 
 		 233 aa  155  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  42.65 
 
 		 210 aa  154  8e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  42.93 
 
 		 215 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  41.95 
 
 		 226 aa  152  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  40.98 
 
 		 215 aa  151  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0069  radical SAM domain protein  42.65 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0070  Radical SAM domain protein  42.65 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.457092  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3969  radical SAM domain protein  41.35 
 
 		 215 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0978763  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  41.67 
 
 		 227 aa  149  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  41.67 
 
 		 217 aa  149  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  42.44 
 
 		 264 aa  148  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1225  radical SAM domain protein  40.49 
 
 		 215 aa  148  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  40.49 
 
 		 215 aa  148  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3990  radical SAM domain-containing protein  40.98 
 
 		 215 aa  147  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4193  radical SAM domain-containing protein  40.49 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  41.18 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  41.18 
 
 		 217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  43.14 
 
 		 212 aa  145  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1071  radical activating enzyme  41.18 
 
 		 217 aa  144  6e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0749004  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  37.61 
 
 		 226 aa  144  6e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0952  radical SAM domain-containing protein  41.18 
 
 		 217 aa  144  8.000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0717091  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  40.38 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  38.05 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2711  radical SAM family protein  41.18 
 
 		 234 aa  142  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  43.63 
 
 		 215 aa  142  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0538  Radical SAM domain protein  38.73 
 
 		 227 aa  141  7e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128544  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  39.81 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  38.54 
 
 		 211 aa  139  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0569  Radical SAM domain protein  41.18 
 
 		 232 aa  139  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  35.16 
 
 		 245 aa  138  7e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  36.53 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  41.18 
 
 		 213 aa  136  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  36.07 
 
 		 244 aa  135  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  38.24 
 
 		 213 aa  135  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  38.24 
 
 		 213 aa  135  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  41.06 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1766  Radical SAM domain protein  37.91 
 
 		 220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.988544  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0505  radical activating enzyme, putative  36.49 
 
 		 226 aa  124  9e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.759738  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36610  Radical SAM protein  39.68 
 
 		 193 aa  120  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506067  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1879  Radical SAM domain protein  36.67 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00268762 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1702  Radical SAM domain protein  36.36 
 
 		 222 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.86531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0430  radical activating enzyme, putative  36.02 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1979  radical SAM domain-containing protein  36.15 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1950  Radical SAM domain protein  32.88 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  34.43 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  34.93 
 
 		 216 aa  97.8  9e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  36.57 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  49.51 
 
 		 220 aa  95.9  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2280  Radical SAM domain protein  32.86 
 
 		 223 aa  95.5  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.28532  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  33 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  33 
 
 		 205 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  33.82 
 
 		 211 aa  93.2  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1045  hypothetical protein  31.08 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0321486  normal  0.408994 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  45.53 
 
 		 227 aa  92  5e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  36.87 
 
 		 216 aa  92  5e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1848  hypothetical protein  32.88 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361359  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  39.04 
 
 		 280 aa  89.7  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3716  radical activating protein  32.96 
 
 		 255 aa  89.4  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.235387  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1772  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  35.03 
 
 		 244 aa  89.7  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3149  hypothetical protein  30.49 
 
 		 210 aa  89  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105264  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  32.85 
 
 		 206 aa  89  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  32 
 
 		 195 aa  89.4  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1319  Radical SAM domain protein  31.86 
 
 		 210 aa  89  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  33.49 
 
 		 216 aa  88.6  6e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1494  hypothetical protein  30.17 
 
 		 211 aa  88.2  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  37.58 
 
 		 216 aa  87.8  9e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0526  hypothetical protein  30.8 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313091  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1382  hypothetical protein  35.24 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.41745  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1571  hypothetical protein  31.67 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.794785 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2645  hypothetical protein  34.65 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1837  hypothetical protein  42.15 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0997579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3844  hypothetical protein  31.56 
 
 		 212 aa  85.5  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.621065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  31.16 
 
 		 192 aa  85.1  6e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  38.51 
 
 		 235 aa  85.1  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3380  hypothetical protein  33.04 
 
 		 212 aa  85.1  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1899  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  32.76 
 
 		 247 aa  85.1  6e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1974  radical activating enzyme, putative  32.18 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1221  hypothetical protein  30.18 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.688566 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0659  Radical SAM domain protein  32.72 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.815067  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2177  radical SAM domain-containing protein  35.03 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1300  hypothetical protein  33.04 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1382  hypothetical protein  30.18 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.980113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3790  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  29.61 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1008  radical SAM domain-containing protein  31.43 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2045  radical SAM family protein  32 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1394  hypothetical protein  31.98 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.102541 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>