53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0174 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0174  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 236 aa  488  1e-137  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1299  xylose isomerase domain-containing protein  54.24 
 
 		 237 aa  271  5.000000000000001e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.47167  normal  0.0132415 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1143  xylose isomerase domain-containing protein  56.78 
 
 		 243 aa  270  1e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0740  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  50.43 
 
 		 243 aa  254  6e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0871  hypothetical protein  46.55 
 
 		 241 aa  225  4e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00496229  hitchhiker  0.00660497 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0442  hypothetical protein  35.74 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0600  xylose isomerase domain-containing protein  37.34 
 
 		 244 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1379  hypothetical protein  35.27 
 
 		 242 aa  123  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.100757  normal  0.0567681 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  31.25 
 
 		 253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0988  xylose isomerase domain-containing protein  34.31 
 
 		 253 aa  115  6.9999999999999995e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.279783 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0122  xylose isomerase domain-containing protein  27.47 
 
 		 254 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.668761  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  30.16 
 
 		 257 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  29.78 
 
 		 257 aa  105  8e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1974  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.56 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.520711 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1555  xylose isomerase domain-containing protein  32.11 
 
 		 257 aa  99  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1364  hypothetical protein  30.13 
 
 		 256 aa  98.2  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000110599  hitchhiker  0.0000000254981 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  31.31 
 
 		 256 aa  96.3  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  27 
 
 		 268 aa  94  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  27.76 
 
 		 264 aa  92.4  5e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  27.34 
 
 		 268 aa  92  8e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  27.24 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  27.54 
 
 		 268 aa  87.8  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1592  xylose isomerase domain-containing protein  31.16 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234456 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1398  xylose isomerase-like TIM barrel  29.63 
 
 		 271 aa  68.9  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0511  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.41 
 
 		 258 aa  68.6  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0531  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.33 
 
 		 258 aa  68.6  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0474  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.43 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3128  hypothetical protein  29.71 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.87 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0247  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  31.38 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3793  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.17 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0319  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  24.76 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1528  xylose isomerase-like TIM barrel  29.83 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.317464  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4159  xylose isomerase domain-containing protein  27.62 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.5 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.883338 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0023  xylose isomerase domain-containing protein  27.42 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140146  normal  0.179482 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1263  hypothetical protein  28.44 
 
 		 269 aa  54.7  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6463  hypothetical protein  25.73 
 
 		 273 aa  52.4  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.920651  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0830  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.02 
 
 		 272 aa  52.4  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.801774  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4163  xylose isomerase domain-containing protein  30.25 
 
 		 257 aa  49.7  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3371  AP endonuclease  26.34 
 
 		 256 aa  49.7  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2110  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.28 
 
 		 249 aa  49.3  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517822  normal  0.355951 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1458  xylose isomerase domain-containing protein  25.62 
 
 		 255 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.32 
 
 		 255 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9360  apurinic endonuclease Apn1  25.99 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.480693  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0655  AP endonuclease  31.25 
 
 		 278 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0064  xylose isomerase-like TIM barrel  25.53 
 
 		 256 aa  45.8  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4598  xylose isomerase-like TIM barrel  32.08 
 
 		 277 aa  45.4  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0949  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.72 
 
 		 272 aa  45.4  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2404  xylose isomerase domain-containing protein  27.54 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1978  xylose isomerase domain-containing protein  26.96 
 
 		 274 aa  43.5  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2972  xylose isomerase domain-containing protein  26.37 
 
 		 255 aa  42.4  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3105  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.29 
 
 		 257 aa  42.4  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>