275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0115 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 
395 aa  781    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.84 
 
 
390 aa  243  3e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.76 
 
 
510 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  38.29 
 
 
1094 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.74 
 
 
1343 aa  175  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  34.47 
 
 
1148 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  32.56 
 
 
958 aa  164  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.1 
 
 
1438 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.68 
 
 
1412 aa  145  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  31.78 
 
 
1224 aa  142  8e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  42.07 
 
 
399 aa  137  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  30.82 
 
 
644 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.47 
 
 
490 aa  126  6e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  32.9 
 
 
493 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  29.74 
 
 
959 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.93 
 
 
1139 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.43 
 
 
1181 aa  119  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  29.15 
 
 
546 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.7 
 
 
524 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.43 
 
 
302 aa  113  5e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  29.64 
 
 
1328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  37.38 
 
 
431 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  31.8 
 
 
501 aa  102  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  33.79 
 
 
517 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.31 
 
 
323 aa  100  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  33.9 
 
 
886 aa  100  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.64 
 
 
370 aa  94  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6151  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.42 
 
 
321 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.69 
 
 
1041 aa  91.7  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4600  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.71 
 
 
214 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708981  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.36 
 
 
192 aa  90.9  4e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  28.65 
 
 
1133 aa  90.1  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  42.34 
 
 
208 aa  89.7  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  28.94 
 
 
838 aa  90.1  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.13 
 
 
221 aa  89.7  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  33 
 
 
320 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.58 
 
 
313 aa  88.6  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.44 
 
 
666 aa  87.4  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.75 
 
 
180 aa  87  6e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.98 
 
 
251 aa  86.7  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0251  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.28 
 
 
408 aa  86.3  9e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.169018  normal  0.0104715 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.71 
 
 
200 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  31.7 
 
 
1194 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  29.8 
 
 
593 aa  85.5  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.75 
 
 
831 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4198  HEAT domain containing protein  33.47 
 
 
321 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.11 
 
 
670 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2803  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.48 
 
 
320 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.873153 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5719  HEAT domain containing protein  34.44 
 
 
299 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0125  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.15 
 
 
178 aa  79.7  0.00000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3638  HEAT domain containing protein  26.23 
 
 
395 aa  79.7  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.942525  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2470  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.23 
 
 
395 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2128  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.29 
 
 
175 aa  78.6  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.146426  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2463  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.76 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0940  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.66 
 
 
408 aa  76.6  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.56 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  30.66 
 
 
319 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1940  SH3 type 3 domain-containing protein  32.84 
 
 
522 aa  75.9  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  30.66 
 
 
319 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0676  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.9 
 
 
320 aa  74.7  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.401005 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5289  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.21 
 
 
331 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34930  putative phycobiliprotein  31.96 
 
 
321 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771282  normal  0.964295 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0987  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.72 
 
 
285 aa  73.9  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.27 
 
 
667 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5008  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.03 
 
 
321 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.66 
 
 
232 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0996  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.18 
 
 
1110 aa  70.5  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.399368  normal  0.160233 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0515  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  39.04 
 
 
170 aa  70.9  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3674  HEAT domain containing protein  30.22 
 
 
323 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.631029  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1480  HEAT repeat-containing protein  30.35 
 
 
325 aa  70.5  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0072  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.38 
 
 
442 aa  70.1  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0156  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.77 
 
 
284 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00291683 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0761  HEAT domain containing protein  25.45 
 
 
646 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.181899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4537  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.9 
 
 
400 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3041  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.91 
 
 
284 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  27.91 
 
 
773 aa  69.3  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0746  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.08 
 
 
646 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3079  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.91 
 
 
284 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2265  HEAT domain containing protein  27.11 
 
 
402 aa  69.3  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0591737 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4882  hypothetical protein  33.2 
 
 
316 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453587  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0978  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.65 
 
 
334 aa  68.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0644536  normal  0.854239 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.28 
 
 
176 aa  68.2  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1669  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.07 
 
 
173 aa  68.6  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0754  hypothetical protein  32.02 
 
 
199 aa  67.4  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250438  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1313  hypothetical protein  23.41 
 
 
361 aa  67.4  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1962  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.24 
 
 
331 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4511  HEAT domain containing protein  28.69 
 
 
286 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.715352  normal  0.801323 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  30.65 
 
 
1216 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.5 
 
 
377 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0581284  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2859  HEAT domain containing protein  29.44 
 
 
428 aa  64.7  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335978  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0286  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.54 
 
 
545 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933039  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1889  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.93 
 
 
331 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.826607  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0756  HEAT repeat-containing protein  31.72 
 
 
541 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000382478  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1896  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.73 
 
 
298 aa  64.7  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2826  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.21 
 
 
157 aa  64.3  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2190  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.78 
 
 
411 aa  64.7  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3723  HEAT domain containing protein  31.87 
 
 
249 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3776  HEAT domain containing protein  31.02 
 
 
249 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000557068  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22351  HEAT repeat-containing protein  29.49 
 
 
315 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1977  heat domain-containing protein  29.21 
 
 
331 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>