More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0095 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0228  amidophosphoribosyltransferase  67.44 
 
 
478 aa  676    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.629689  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0095  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 
476 aa  977    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0394  amidophosphoribosyltransferase  72.07 
 
 
470 aa  728    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0144451 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3061  amidophosphoribosyltransferase  66.88 
 
 
629 aa  662    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0202  amidophosphoribosyltransferase  60.39 
 
 
467 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.19118  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3498  amidophosphoribosyltransferase  53.25 
 
 
477 aa  499  1e-140  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349457  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2179  amidophosphoribosyltransferase  52.75 
 
 
462 aa  495  1e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0230  amidophosphoribosyltransferase  53.11 
 
 
463 aa  489  1e-137  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0884272  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1389  amidophosphoribosyltransferase  51.49 
 
 
479 aa  486  1e-136  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.254172  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0150  hypothetical protein  53.66 
 
 
462 aa  485  1e-136  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0365375  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0672  amidophosphoribosyltransferase  52.85 
 
 
475 aa  472  1e-132  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.546073  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1477  amidophosphoribosyltransferase  50.85 
 
 
499 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2658  amidophosphoribosyltransferase  50.41 
 
 
490 aa  468  1.0000000000000001e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0292  amidophosphoribosyltransferase  48.58 
 
 
459 aa  462  1e-129  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.95663  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1160  amidophosphoribosyltransferase  49.36 
 
 
503 aa  461  9.999999999999999e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.904998  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2095  amidophosphoribosyltransferase  49.78 
 
 
480 aa  459  9.999999999999999e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.778059 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  49.22 
 
 
469 aa  452  1.0000000000000001e-126  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0468  amidophosphoribosyltransferase  48.55 
 
 
456 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.350158  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0439  amidophosphoribosyltransferase  48.99 
 
 
459 aa  449  1e-125  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1523  amidophosphoribosyltransferase  48.55 
 
 
459 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0119394  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0396  amidophosphoribosyltransferase  48.1 
 
 
459 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2365  amidophosphoribosyltransferase  48.78 
 
 
474 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  47.12 
 
 
475 aa  445  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000929805  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1196  amidophosphoribosyltransferase  47.11 
 
 
472 aa  428  1e-119  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2047  amidophosphoribosyltransferase  48.1 
 
 
465 aa  431  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.330153 
 
 
-
 
NC_002936  DET1415  amidophosphoribosyltransferase  46.67 
 
 
472 aa  426  1e-118  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  46.41 
 
 
488 aa  425  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  46.29 
 
 
474 aa  419  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0522  amidophosphoribosyltransferase  46 
 
 
465 aa  419  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1222  amidophosphoribosyltransferase  46.22 
 
 
472 aa  418  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.433131  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0731  amidophosphoribosyltransferase  46.76 
 
 
478 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1939  amidophosphoribosyltransferase  45.75 
 
 
466 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2068  amidophosphoribosyltransferase  45.57 
 
 
474 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1891  amidophosphoribosyltransferase  46.72 
 
 
477 aa  414  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2329  amidophosphoribosyltransferase  46.72 
 
 
477 aa  413  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.64237  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2109  amidophosphoribosyltransferase  46.56 
 
 
475 aa  411  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  45.96 
 
 
472 aa  411  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0334  amidophosphoribosyltransferase  43.78 
 
 
462 aa  410  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.708549  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0321  amidophosphoribosyltransferase  43.15 
 
 
461 aa  410  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1153  amidophosphoribosyltransferase  47.53 
 
 
474 aa  411  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2184  amidophosphoribosyltransferase  43.93 
 
 
487 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1766  amidophosphoribosyltransferase  45.43 
 
 
488 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0501857 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1636  amidophosphoribosyltransferase  45.1 
 
 
467 aa  402  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0674  amidophosphoribosyltransferase  45.13 
 
 
473 aa  402  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8991  amidophosphoribosyltransferase  45.98 
 
 
478 aa  403  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2702  amidophosphoribosyltransferase  45.43 
 
 
475 aa  403  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  44.3 
 
 
471 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0260  amidophosphoribosyltransferase  43.85 
 
 
470 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0824  amidophosphoribosyltransferase  46.21 
 
 
488 aa  402  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0997  amidophosphoribosyltransferase  44.87 
 
 
482 aa  401  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.421996  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0672  amidophosphoribosyltransferase  44.91 
 
 
473 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0309  amidophosphoribosyltransferase  47.87 
 
 
473 aa  399  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3343  amidophosphoribosyltransferase  45.68 
 
 
502 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  43.85 
 
 
471 aa  395  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4354  amidophosphoribosyltransferase  46.14 
 
 
484 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.463043 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  43.85 
 
 
471 aa  395  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  44.07 
 
 
471 aa  398  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4387  amidophosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
500 aa  397  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  43.62 
 
 
471 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  43.62 
 
 
471 aa  394  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  43.62 
 
 
471 aa  394  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1326  amidophosphoribosyltransferase  44.64 
 
 
468 aa  394  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  43.62 
 
 
471 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  43.62 
 
 
471 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0341  amidophosphoribosyltransferase  43.62 
 
 
471 aa  392  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  44.07 
 
 
471 aa  394  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3212  amidophosphoribosyltransferase  43.43 
 
 
463 aa  392  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.903412  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0265  amidophosphoribosyltransferase  43.76 
 
 
476 aa  395  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4571  amidophosphoribosyltransferase  43.21 
 
 
468 aa  390  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.470676  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1136  amidophosphoribosyltransferase  43.38 
 
 
470 aa  391  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0004  amidophosphoribosyltransferase  42.08 
 
 
493 aa  390  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.645305  normal  0.0907172 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4318  amidophosphoribosyltransferase  43.04 
 
 
496 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1102  amidophosphoribosyltransferase  44.1 
 
 
466 aa  388  1e-107  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3044  amidophosphoribosyltransferase  44.22 
 
 
478 aa  389  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0228  amidophosphoribosyltransferase  43.75 
 
 
470 aa  392  1e-107  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000396195  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2747  amidophosphoribosyltransferase  43.24 
 
 
484 aa  385  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0404  amidophosphoribosyltransferase  43.11 
 
 
488 aa  388  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305555  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0760  amidophosphoribosyltransferase  42.15 
 
 
454 aa  388  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08960  amidophosphoribosyltransferase  43.39 
 
 
496 aa  387  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1110  amidophosphoribosyltransferase  45.39 
 
 
447 aa  388  1e-106  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04200  amidophosphoribosyltransferase  42.79 
 
 
496 aa  385  1e-106  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.289108  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2072  amidophosphoribosyltransferase  42.62 
 
 
506 aa  385  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4361  amidophosphoribosyltransferase  43.47 
 
 
485 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4338  amidophosphoribosyltransferase  43.47 
 
 
485 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0398  amidophosphoribosyltransferase  42.2 
 
 
480 aa  383  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0141  amidophosphoribosyltransferase  44.74 
 
 
484 aa  382  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4217  amidophosphoribosyltransferase  42.17 
 
 
494 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4621  amidophosphoribosyltransferase  42.64 
 
 
482 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.059877  normal  0.48412 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1634  amidophosphoribosyltransferase  43.47 
 
 
511 aa  383  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4178  amidophosphoribosyltransferase  42.17 
 
 
494 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0296  amidophosphoribosyltransferase  43.17 
 
 
505 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2807  amidophosphoribosyltransferase  40.98 
 
 
462 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1722  amidophosphoribosyltransferase  44.52 
 
 
481 aa  381  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.56305  normal  0.196104 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4206  amidophosphoribosyltransferase  43.25 
 
 
485 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.975393  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2064  amidophosphoribosyltransferase  44.52 
 
 
475 aa  382  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3743  amidophosphoribosyltransferase  43.46 
 
 
466 aa  380  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4541  amidophosphoribosyltransferase  42.27 
 
 
511 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3588  amidophosphoribosyltransferase  43.44 
 
 
503 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.51846 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4628  amidophosphoribosyltransferase  42.27 
 
 
511 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5114  amidophosphoribosyltransferase  43.04 
 
 
510 aa  380  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0638191  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>