33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0092 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0092  putative RNA-binding protein  100 
 
 		 170 aa  348  2e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0231  putative RNA-binding protein  58.79 
 
 		 165 aa  209  2e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.422543  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0148  putative RNA-binding protein  56.36 
 
 		 165 aa  198  3e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.026046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3058  putative RNA-binding protein  53.94 
 
 		 165 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0397  putative RNA-binding protein  56.36 
 
 		 165 aa  194  5.000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0688131 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0182  putative RNA-binding protein  38.99 
 
 		 161 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0187  putative RNA-binding protein  42.59 
 
 		 182 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.164095  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0233  putative RNA-binding protein  39.1 
 
 		 161 aa  112  3e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.161468  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3096  PUA domain containing protein  38.85 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0751  putative RNA-binding protein  37.29 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0461148  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1481  PUA domain containing protein  39.24 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1070  putative RNA-binding protein  44.25 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0894  putative RNA-binding protein  41.59 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1052  putative RNA-binding protein  41.59 
 
 		 159 aa  99  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1622  putative RNA-binding protein  41.59 
 
 		 159 aa  96.7  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0427  PUA domain containing protein  35.62 
 
 		 159 aa  94  9e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0141  putative RNA-binding protein  33.94 
 
 		 167 aa  90.5  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0035  putative RNA-binding protein  36.25 
 
 		 160 aa  88.6  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0118889 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0681  putative RNA-binding protein  33.53 
 
 		 172 aa  84.3  7e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.384245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0597  putative RNA-binding protein  33.77 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1654  putative RNA-binding protein  31.97 
 
 		 172 aa  81.3  0.000000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00738213 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1989  putative RNA-binding protein  33.33 
 
 		 174 aa  80.9  0.000000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0310  PUA domain-containing protein  38.54 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0859  PUA domain containing protein  34.17 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0695  PUA domain-containing protein  34.94 
 
 		 158 aa  60.5  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1050  PUA domain-containing protein  29.17 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0861537  decreased coverage  0.00000000242397 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43572  predicted protein  31.36 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.291748 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53664  predicted protein  27.91 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.24175  normal  0.0700588 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0193  putative RNA-binding protein  27.5 
 
 		 155 aa  52  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0504341 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16787  predicted protein  22.51 
 
 		 205 aa  49.3  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0973  Protein of unknown function DUF1947  28.42 
 
 		 152 aa  48.5  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01450  hypothetical protein  24.63 
 
 		 253 aa  47.8  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.236397  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10175  PUA RNA binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09810)  24 
 
 		 194 aa  41.2  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.316973 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>