More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0086 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0086  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  100 
 
 
542 aa  1110    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.970646  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0402  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.87 
 
 
562 aa  784    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.309781 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3053  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  63.69 
 
 
540 aa  711    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0221  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.36 
 
 
543 aa  734    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.143686  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0140  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  59.81 
 
 
542 aa  673    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1397  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  50.3 
 
 
539 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0401599  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  50.2 
 
 
539 aa  457  1e-127  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0522  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  49.8 
 
 
539 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0588  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  47.24 
 
 
546 aa  442  1e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0245  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  46.6 
 
 
552 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0011  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  48.4 
 
 
589 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3453  succinate dehydrogenase  43.55 
 
 
576 aa  379  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1384  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.78 
 
 
608 aa  365  2e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2530  Succinate dehydrogenase (ubiquinone)  42.61 
 
 
609 aa  364  3e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1354  succinate dehydrogenase  41.62 
 
 
582 aa  363  3e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27750  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.67 
 
 
638 aa  362  8e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0951337 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0394  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.46 
 
 
644 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134767  normal  0.884636 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12591  succinate dehydrogenase  41.23 
 
 
584 aa  353  4e-96  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0949259  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5984  L-aspartate oxidase  40.6 
 
 
574 aa  351  2e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.937659 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4026  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.55 
 
 
646 aa  351  2e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.941346  normal  0.159045 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0284  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.75 
 
 
627 aa  351  2e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10251  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.96 
 
 
646 aa  348  1e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12651  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  40.7 
 
 
570 aa  348  2e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0253  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.34 
 
 
648 aa  348  2e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128459  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0263  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.34 
 
 
648 aa  348  2e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.115771 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0243  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.16 
 
 
648 aa  347  3e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1426  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.31 
 
 
623 aa  346  6e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0924  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  44.2 
 
 
626 aa  344  2e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2214  Succinate dehydrogenase  41.53 
 
 
646 aa  344  2e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1865  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.45 
 
 
598 aa  342  1e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.710471 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1440  Succinate dehydrogenase  43.36 
 
 
598 aa  341  2e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2093  Succinate dehydrogenase  40.54 
 
 
576 aa  341  2.9999999999999998e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3548  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.14 
 
 
621 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.364565  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3926  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  39.89 
 
 
680 aa  332  8e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3565  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.56 
 
 
644 aa  331  2e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.606678  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1116  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  39.37 
 
 
643 aa  329  8e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1797  Succinate dehydrogenase  41.3 
 
 
598 aa  326  6e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315032  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3050  succinate dehydrogenase  41.6 
 
 
633 aa  325  9e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145782  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4150  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.55 
 
 
637 aa  325  1e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.052342  normal  0.010572 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2512  succinate dehydrogenase  39.29 
 
 
591 aa  322  9.000000000000001e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.069415  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4578  Succinate dehydrogenase  39.2 
 
 
575 aa  320  3.9999999999999996e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8670  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  37.7 
 
 
579 aa  318  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5518  Succinate dehydrogenase  37.92 
 
 
641 aa  317  3e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3768  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.81 
 
 
637 aa  317  5e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0873813 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  38.2 
 
 
568 aa  316  5e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5615  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  39.33 
 
 
579 aa  315  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0747  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.26 
 
 
681 aa  313  4.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.533277  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8464  Succinate dehydrogenase  40.18 
 
 
630 aa  308  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2474  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.86 
 
 
575 aa  306  8.000000000000001e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00000557801  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  39.44 
 
 
533 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0677  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.71 
 
 
566 aa  302  9e-81  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0486405  hitchhiker  0.0000605931 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1206  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  38.06 
 
 
596 aa  301  2e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  39.22 
 
 
515 aa  301  2e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1687  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.14 
 
 
575 aa  299  7e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0263858 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1030  succinate dehydrogenase/fumarate reductase subunit A  37.94 
 
 
570 aa  298  1e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.144954  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  39.92 
 
 
568 aa  297  4e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0174  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  39.45 
 
 
542 aa  295  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0476634  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  36.61 
 
 
532 aa  294  3e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.84 
 
 
578 aa  293  5e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  39.03 
 
 
515 aa  293  6e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.32 
 
 
575 aa  293  6e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2863  succinate dehydrogenase subunit A  39.19 
 
 
594 aa  292  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3969  L-aspartate oxidase  36.06 
 
 
585 aa  290  5.0000000000000004e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  38.49 
 
 
522 aa  289  9e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0170  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.19 
 
 
566 aa  288  2e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1995  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.65 
 
 
567 aa  288  2e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0177  succinate dehydrogenase subunit A  38.7 
 
 
567 aa  288  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  39.22 
 
 
528 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  37.16 
 
 
542 aa  286  5.999999999999999e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1882  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.07 
 
 
575 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.764609  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1856  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.07 
 
 
575 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3884  L-aspartate oxidase  36.33 
 
 
587 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.207594 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3147  putative succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.14 
 
 
587 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  39.92 
 
 
541 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00131  fumarate reductase flavoprotein subunit  36.81 
 
 
606 aa  283  4.0000000000000003e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1869  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.1 
 
 
598 aa  284  4.0000000000000003e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.462567  normal  0.466053 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002237  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.58 
 
 
599 aa  283  5.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2323  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.23 
 
 
592 aa  283  6.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3632  L-aspartate oxidase  38.15 
 
 
535 aa  283  7.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3706  L-aspartate oxidase  38.15 
 
 
535 aa  283  8.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166219  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.8 
 
 
567 aa  281  2e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2484  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.61 
 
 
592 aa  281  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.076646 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0105  L-aspartate oxidase  37.65 
 
 
533 aa  281  2e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2029  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  36.98 
 
 
596 aa  281  3e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.21  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0679  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.83 
 
 
584 aa  280  4e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00348299  normal  0.0897043 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1990  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.46 
 
 
609 aa  280  7e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.902859  normal  0.104925 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0729  L-aspartate oxidase  36.45 
 
 
533 aa  279  9e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000384944  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2309  L-aspartate oxidase  38.19 
 
 
507 aa  278  1e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114896  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2788  fumarate reductase flavoprotein subunit  36.55 
 
 
617 aa  278  1e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2362  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  39.46 
 
 
595 aa  279  1e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0127  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.71 
 
 
567 aa  278  2e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.864238  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2514  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  35.45 
 
 
585 aa  278  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.136164  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3566  L-aspartate oxidase  37.57 
 
 
535 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0410  L-aspartate oxidase  38.89 
 
 
532 aa  278  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.632554  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4278  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.68 
 
 
605 aa  278  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2344  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.84 
 
 
567 aa  278  2e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2230  fumarate reductase flavoprotein subunit  36.21 
 
 
602 aa  277  3e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2168  succinate dehydrogenase subunit A  37.78 
 
 
596 aa  277  4e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.274751 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0635  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.54 
 
 
566 aa  276  5e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0393941  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3894  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.51 
 
 
605 aa  276  5e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197251  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>