110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0078 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0078  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 135 aa  268  2e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  65.74 
 
 		 112 aa  153  6e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0306  Carboxymuconolactone decarboxylase  59.82 
 
 		 114 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.739579 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0121  hypothetical protein  61.39 
 
 		 110 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0163  carboxymuconolactone decarboxylase  60.55 
 
 		 116 aa  123  8.000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2454  hypothetical protein  36.7 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0137937  normal  0.425603 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2472  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.59 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0332  carboxymuconolactone decarboxylase  35.23 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.711458  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0404  carboxymuconolactone decarboxylase  39.56 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0518  hypothetical protein  35.44 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0094  carboxymuconolactone decarboxylase  29.41 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0425129  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0431  carboxymuconolactone decarboxylase  40.79 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1515  carboxymuconolactone decarboxylase  40.79 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0707  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.65 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4471  alkylhydroperoxidase  37.65 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0476  carboxymuconolactone decarboxylase  37.36 
 
 		 104 aa  53.5  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.311058  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11795  hypothetical protein  32.94 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000134545  hitchhiker  0.00000380763 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3671  carboxymuconolactone decarboxylase  31.25 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0429086 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2375  alkylhydroperoxidase-like protein  32.22 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.583402  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1641  alkylhydroperoxidase  34.62 
 
 		 120 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306548 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0548  hypothetical protein  29.7 
 
 		 144 aa  47.4  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.142286 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01174  Alkylhydroperoxidase  36.07 
 
 		 115 aa  47.4  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.767687  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0261  alkylhydroperoxidase family protein  26.17 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2661  carboxymuconolactone decarboxylase  32.53 
 
 		 125 aa  47.4  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1911  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.43 
 
 		 112 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0493  alkylhydroperoxidase  25.62 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.884775  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2518  carboxymuconolactone decarboxylase  26.37 
 
 		 116 aa  47  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.541729  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2677  alkylhydroperoxidase  36.36 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2504  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.58 
 
 		 129 aa  47  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1473  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.38 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.362759  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0939  carboxymuconolactone decarboxylase  39.68 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.947177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0406  hypothetical protein  36.07 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1812  alkylhydroperoxidase  26.53 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4447  alkylhydroperoxidase  42.42 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1895  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.53 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00163146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1806  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.33 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0074  alkylhydroperoxidase  29.17 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3718  putative carboxymuconolactone decarboxylase  37.7 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2368  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.38 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000359783  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1151  hypothetical protein  31.37 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3215  carboxymuconolactone decarboxylase  32 
 
 		 124 aa  45.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1046  alkylhydroperoxidase  29 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2296  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 123 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0265397  normal  0.659303 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2568  carboxymuconolactone decarboxylase  29.33 
 
 		 132 aa  44.3  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136392 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1129  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.32 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2572  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.1 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.423134 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3552  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.92 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5222  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.1 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2388  alkylhydroperoxidase  39.39 
 
 		 115 aa  43.9  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0786304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6230  alkylhydroperoxidase  36.07 
 
 		 115 aa  43.5  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534978  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1381  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.7 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760953  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2249  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  37.7 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0833929  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.7 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2126  carboxymuconolactone decarboxylase  37.7 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191574  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2058  alkylhydroperoxidase  27.96 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.567856  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2734  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.888805  hitchhiker  0.0000628107 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.7 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0210047  normal  0.0491818 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0332  alkylhydroperoxidase  28.57 
 
 		 144 aa  42.7  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4433  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.7 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145648  hitchhiker  0.00893399 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.7 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0594936 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3252  carboxymuconolactone decarboxylase  32.79 
 
 		 133 aa  42.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2178  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.92 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783696  hitchhiker  5.56678e-19 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2753  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.21 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.671955  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1458  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.71 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0830  carboxymuconolactone decarboxylase  34.92 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1901  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3419  alkylhydroperoxidase  35.21 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0197505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2974  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.79 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2061  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.7 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2454  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.7 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.835529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1190  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.99 
 
 		 115 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1720  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.52 
 
 		 113 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.8171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2644  hypothetical protein  22.12 
 
 		 128 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0396958 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1275  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.43 
 
 		 130 aa  41.6  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.537713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0571  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 134 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1912  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 126 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.955365  normal  0.169242 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5100  hypothetical protein  34.92 
 
 		 128 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4188  carboxymuconolactone decarboxylase  30.3 
 
 		 152 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.412642 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38170  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.07 
 
 		 130 aa  41.2  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.230767  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  29.55 
 
 		 392 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3382  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.25 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3257  carboxymuconolactone decarboxylase  30.67 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.146193  normal  0.0594926 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3703  carboxymuconolactone decarboxylase  32.79 
 
 		 128 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2441  alkylhydroperoxidase  24.55 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0681  carboxymuconolactone decarboxylase  31.51 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7078  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.87 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0342158  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01252  conserved hypothetical protein  29.33 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58220  hypothetical protein  34.92 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.876359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1382  alkylhydroperoxidase  32.53 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3032  alkylhydroperoxidase  35.94 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0673  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.79 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0717  carboxymuconolactone decarboxylase  25.4 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.226817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0305  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.39 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4897  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.54 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1303  alkylhydroperoxidase  32.84 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3266  alkylhydroperoxidase  41.54 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6910  alkylhydroperoxidase  41.54 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0757  alkylhydroperoxidase  39.39 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4434  alkylhydroperoxidase  41.54 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0689  alkylhydroperoxidase  39.39 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.262808  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>