More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0069 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0069  signal transduction protein  100 
 
 
158 aa  315  2e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0152  signal transduction protein  58.06 
 
 
160 aa  187  7e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2651  putative signal transduction protein with CBS domains  57.52 
 
 
161 aa  184  5e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3228  XRE family transcriptional regulator  52.56 
 
 
158 aa  167  6e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  46.84 
 
 
158 aa  157  5e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  41.18 
 
 
154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  37.66 
 
 
154 aa  117  9e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  37.5 
 
 
153 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1395  signal transduction protein  36.84 
 
 
153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  36.18 
 
 
153 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  34.87 
 
 
153 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  32.89 
 
 
155 aa  105  3e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  35.1 
 
 
209 aa  91.3  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 
149 aa  84.7  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 
148 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  37.42 
 
 
153 aa  82.8  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  33.99 
 
 
249 aa  78.2  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  31.9 
 
 
161 aa  77.8  0.00000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  33.33 
 
 
153 aa  77  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  36.31 
 
 
246 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  34.87 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  34.42 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  31.37 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  33.55 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  33.55 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  34.44 
 
 
426 aa  74.7  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  30.57 
 
 
229 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  34 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  34.81 
 
 
243 aa  72  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  33.33 
 
 
212 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  33.33 
 
 
152 aa  71.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  37.09 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  30.92 
 
 
154 aa  71.2  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  32.68 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2102  signal transduction protein  32.05 
 
 
292 aa  70.9  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  32.67 
 
 
215 aa  70.5  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  29.19 
 
 
215 aa  70.5  0.000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  29.11 
 
 
150 aa  70.5  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0774  CBS  28.93 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  31.85 
 
 
247 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  29.19 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  31.58 
 
 
214 aa  68.2  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  30.57 
 
 
230 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  28.77 
 
 
148 aa  68.6  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  31.21 
 
 
229 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  29.94 
 
 
154 aa  67.4  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2208  CBS domain-containing protein  29.61 
 
 
221 aa  67.4  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000650498  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  33.54 
 
 
243 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  26.71 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  29.53 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  30.63 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  30.26 
 
 
219 aa  65.1  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  33.33 
 
 
216 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.05 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3667  cyclic nucleotide-binding protein  26.45 
 
 
606 aa  65.1  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.773951  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  29.33 
 
 
227 aa  65.5  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  32.24 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  29.61 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  28.66 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  27.22 
 
 
226 aa  65.1  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  31.85 
 
 
230 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  26.67 
 
 
291 aa  64.7  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  30.52 
 
 
348 aa  64.7  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  28.86 
 
 
688 aa  64.7  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  33.33 
 
 
216 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  30.07 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  29.53 
 
 
688 aa  64.3  0.0000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  30.67 
 
 
149 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  27.69 
 
 
313 aa  64.3  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  29.3 
 
 
230 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  32.24 
 
 
214 aa  64.3  0.0000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  27.03 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  27.63 
 
 
149 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1879  CBS  28.48 
 
 
157 aa  63.5  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  29.61 
 
 
279 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  30.26 
 
 
279 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1725  signal-transduction protein  30.13 
 
 
155 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.467768 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  32.45 
 
 
191 aa  63.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  31.79 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1108  CBS domain containing membrane protein  28.48 
 
 
221 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  28.95 
 
 
769 aa  63.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  30.52 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  30.38 
 
 
151 aa  62.8  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  28.1 
 
 
120 aa  62.4  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  28.08 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  28.76 
 
 
242 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1585  CBS domain containing protein  29.75 
 
 
217 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1895  CBS domain-containing protein  30.34 
 
 
133 aa  62  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  29.19 
 
 
241 aa  62  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  30.57 
 
 
231 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1915  CBS domain-containing protein  32.03 
 
 
223 aa  62.4  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.451224  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  27.4 
 
 
152 aa  62  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  27.4 
 
 
149 aa  62.4  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.28 
 
 
243 aa  62  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  30.92 
 
 
220 aa  61.6  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  27.92 
 
 
143 aa  61.6  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  31.33 
 
 
233 aa  60.8  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  27.37 
 
 
313 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0035  signal-transduction protein  30.19 
 
 
138 aa  61.2  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000525301  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  32.31 
 
 
160 aa  60.8  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>