More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0044 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0044  thiamine biosynthesis protein ThiC  100 
 
 
425 aa  865    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0416  thiamine biosynthesis protein ThiC  70.12 
 
 
432 aa  610  1e-173  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.741705  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0053  thiamine biosynthesis protein ThiC  72.29 
 
 
426 aa  598  1e-170  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0200  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.14 
 
 
421 aa  548  1e-155  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00649886  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2459  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.43 
 
 
424 aa  547  1e-154  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.678195 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2129  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.36 
 
 
428 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0765  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.75 
 
 
426 aa  402  1e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0315  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.45 
 
 
426 aa  404  1e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.326801  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1186  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.25 
 
 
426 aa  404  1e-111  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.618429  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1489  thiamine biosynthesis protein ThiC  50 
 
 
426 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0703  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.08 
 
 
429 aa  395  1e-109  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1189  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.64 
 
 
426 aa  389  1e-107  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0597  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.94 
 
 
428 aa  381  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1173  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.77 
 
 
427 aa  380  1e-104  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1595  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.5 
 
 
425 aa  367  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.753357  normal  0.11929 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0104  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.42 
 
 
426 aa  365  1e-100  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.64083  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1712  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.72 
 
 
426 aa  361  1e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1558  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.83 
 
 
424 aa  360  2e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.635884  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1977  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.36 
 
 
424 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0787  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.2 
 
 
425 aa  355  8.999999999999999e-97  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.346957  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0775  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.51 
 
 
431 aa  353  5e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1494  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.59 
 
 
427 aa  352  1e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0701  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.44 
 
 
431 aa  350  2e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1711  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.58 
 
 
425 aa  350  3e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_681  thiamine biosynthesis protein  48.51 
 
 
431 aa  348  8e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.383158  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4183  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.54 
 
 
435 aa  348  1e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2910  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.18 
 
 
436 aa  348  1e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.105361 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0668  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.9 
 
 
436 aa  345  6e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3852  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.84 
 
 
435 aa  345  7e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0670  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.66 
 
 
436 aa  345  1e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0141  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.23 
 
 
424 aa  344  2e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3677  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.27 
 
 
436 aa  344  2e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.286824  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2890  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.22 
 
 
432 aa  344  2e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000275023  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2764  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.04 
 
 
429 aa  344  2e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.458002  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2809  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.35 
 
 
435 aa  344  2e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2045  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.45 
 
 
436 aa  343  2.9999999999999997e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.99165  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0471  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.62 
 
 
435 aa  343  4e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0139  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.98 
 
 
424 aa  342  5.999999999999999e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2427  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.78 
 
 
426 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3809  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.88 
 
 
435 aa  341  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2018  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.68 
 
 
432 aa  339  5e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1401  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.84 
 
 
432 aa  338  8e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3463  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.93 
 
 
437 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2472  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.33 
 
 
481 aa  338  9.999999999999999e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.709563  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3893  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.41 
 
 
435 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.377066 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3529  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.6 
 
 
437 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3005  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.49 
 
 
435 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.933742  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2596  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.16 
 
 
432 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.545863  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1421  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.34 
 
 
425 aa  337  2.9999999999999997e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0604  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.22 
 
 
436 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1114  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.61 
 
 
431 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000374822  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2518  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.28 
 
 
432 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.453923  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0974  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.45 
 
 
432 aa  334  1e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000893445  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0367  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.96 
 
 
436 aa  333  2e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.299563 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2236  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.99 
 
 
430 aa  332  5e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0906  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.97 
 
 
435 aa  331  2e-89  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.598412  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0602  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.85 
 
 
432 aa  330  4e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0373  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.93 
 
 
420 aa  327  3e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000321341  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1359  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.88 
 
 
428 aa  325  1e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.046519  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0145  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.11 
 
 
434 aa  323  4e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1103  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.93 
 
 
453 aa  320  1.9999999999999998e-86  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000141621  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1661  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.9 
 
 
417 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2167  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.58 
 
 
468 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.188885  normal  0.78966 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1991  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.89 
 
 
436 aa  319  7.999999999999999e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3734  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.98 
 
 
473 aa  318  1e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0619415 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1680  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.07 
 
 
429 aa  318  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0628  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.5 
 
 
426 aa  317  3e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1684  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.04 
 
 
431 aa  317  3e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000247869  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0672  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.53 
 
 
449 aa  316  4e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.936222  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2297  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.99 
 
 
475 aa  317  4e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1278  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.32 
 
 
453 aa  315  7e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117733  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2304  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.98 
 
 
463 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2216  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.41 
 
 
463 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.455315  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01971  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.83 
 
 
459 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1643  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.41 
 
 
463 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1663  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.86 
 
 
429 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.275056  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1188  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.07 
 
 
466 aa  312  5.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3442  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.08 
 
 
460 aa  312  5.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.309449  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2662  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.08 
 
 
460 aa  312  5.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0123  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.64 
 
 
484 aa  312  6.999999999999999e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0039044 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1485  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.61 
 
 
430 aa  312  7.999999999999999e-84  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0167  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.89 
 
 
466 aa  312  9e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1742  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.62 
 
 
617 aa  312  9e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.780857  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20631  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.82 
 
 
466 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.017014  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0410  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.15 
 
 
450 aa  311  1e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130506  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2064  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.93 
 
 
441 aa  310  2.9999999999999997e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.27669  normal  0.0343903 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0478  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.12 
 
 
430 aa  310  2.9999999999999997e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1468  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.49 
 
 
431 aa  310  4e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000710454  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17361  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.64 
 
 
459 aa  310  4e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1704  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.32 
 
 
456 aa  309  6.999999999999999e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0503  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.36 
 
 
430 aa  308  9e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.176091  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1908  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.07 
 
 
459 aa  308  9e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137704 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17991  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.07 
 
 
456 aa  307  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18211  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.81 
 
 
456 aa  307  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443876  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1592  thiamine biosynthesis protein ThiC  38.94 
 
 
425 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000634578  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1486  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.88 
 
 
460 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.680107  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1332  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.66 
 
 
480 aa  306  4.0000000000000004e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18041  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.81 
 
 
456 aa  306  4.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2593  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.44 
 
 
503 aa  306  5.0000000000000004e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0543  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.66 
 
 
442 aa  305  7e-82  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.762964 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>