More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0043 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0043  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
200 aa  412  1e-114  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0052  beta-lactamase domain-containing protein  65.48 
 
 
200 aa  274  7e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0415  beta-lactamase domain protein  65.83 
 
 
199 aa  260  1e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.354703  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2460  beta-lactamase-like  59.26 
 
 
191 aa  226  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0199  diphthine synthase  49.21 
 
 
200 aa  182  3e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000243979  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  42.31 
 
 
213 aa  159  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  41.15 
 
 
211 aa  153  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  39.33 
 
 
231 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  39.52 
 
 
214 aa  111  6e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  38.33 
 
 
231 aa  107  9.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  40.69 
 
 
205 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  35.18 
 
 
210 aa  102  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  35.64 
 
 
210 aa  100  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  38.78 
 
 
210 aa  99  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  45.28 
 
 
208 aa  98.6  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  38.02 
 
 
205 aa  97.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2640  beta-lactamase domain protein  32.16 
 
 
206 aa  96.3  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  41.29 
 
 
205 aa  95.5  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  41.67 
 
 
207 aa  94.7  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  39.47 
 
 
211 aa  94.7  8e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  36.63 
 
 
209 aa  94.4  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  40.32 
 
 
213 aa  94  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  36.69 
 
 
251 aa  93.2  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  36.5 
 
 
201 aa  93.6  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  39.23 
 
 
206 aa  92.4  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  29.38 
 
 
208 aa  92.8  3e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  37.01 
 
 
209 aa  92.4  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2403  metallo-beta-lactamase family protein  38.12 
 
 
213 aa  92  5e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1958  beta-lactamase domain-containing protein  37.72 
 
 
209 aa  91.3  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  36.22 
 
 
198 aa  90.1  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 
207 aa  89.7  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  43.71 
 
 
211 aa  89  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  36.14 
 
 
217 aa  89  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1949  beta-lactamase domain protein  34.57 
 
 
208 aa  88.6  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  32.9 
 
 
212 aa  86.7  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  36.99 
 
 
216 aa  86.7  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  35.37 
 
 
226 aa  86.3  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  37.18 
 
 
217 aa  85.9  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1608  beta-lactamase domain-containing protein  37.84 
 
 
206 aa  85.9  4e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.130416  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  40.69 
 
 
206 aa  85.9  4e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  35.38 
 
 
209 aa  85.1  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0406  metallo-beta-lactamase superfamily protein  35.29 
 
 
209 aa  85.1  6e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.735657  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  36.55 
 
 
211 aa  84  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  34.2 
 
 
213 aa  84  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1117  beta-lactamase domain-containing protein  34.01 
 
 
205 aa  84  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1123  beta-lactamase domain-containing protein  36.56 
 
 
204 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  32.02 
 
 
207 aa  84  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0834  beta-lactamase domain-containing protein  36.04 
 
 
205 aa  84  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  34.35 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0463  beta-lactamase domain protein  32.62 
 
 
192 aa  82.8  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00512512  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  39.86 
 
 
209 aa  82  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  33.99 
 
 
214 aa  82.4  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  38.04 
 
 
209 aa  82  0.000000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  34.87 
 
 
209 aa  81.6  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0539  beta-lactamase domain-containing protein  32.61 
 
 
205 aa  82  0.000000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0772  beta-lactamase domain protein  37.93 
 
 
214 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0797  beta-lactamase domain-containing protein  37.93 
 
 
238 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  34.84 
 
 
212 aa  81.3  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  40.52 
 
 
217 aa  81.3  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  32.46 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  38.06 
 
 
229 aa  81.3  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 
215 aa  81.3  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1817  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000015217  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  35.47 
 
 
218 aa  79.7  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  36.77 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  39.62 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  32.99 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00776  probable metallo-beta-lactamase  35.29 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2513  beta-lactamase domain protein  30.05 
 
 
192 aa  79  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  32.11 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  33.97 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  36.65 
 
 
218 aa  79  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.47 
 
 
216 aa  78.6  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  36.08 
 
 
214 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1560  beta-lactamase domain-containing protein  33.5 
 
 
205 aa  78.2  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0811  beta-lactamase domain-containing protein  36.55 
 
 
214 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0630  hypothetical protein  35.37 
 
 
214 aa  78.2  0.00000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  34.83 
 
 
217 aa  78.2  0.00000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  32.99 
 
 
206 aa  77.8  0.00000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  35.48 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4417  beta-lactamase domain-containing protein  35.17 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.834565  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2047  DNA polymerase III epsilon subunit  36.73 
 
 
200 aa  77.4  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0204926  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  31.41 
 
 
219 aa  77.8  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  35.26 
 
 
237 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  36.54 
 
 
215 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  35.26 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  34.38 
 
 
210 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  35.9 
 
 
215 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  35.9 
 
 
215 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  35.9 
 
 
215 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.26 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.26 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  36.54 
 
 
215 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2884  beta-lactamase domain protein  29.03 
 
 
191 aa  77  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  36.54 
 
 
215 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  36.54 
 
 
215 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.26 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.26 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  34.88 
 
 
218 aa  77  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  36.54 
 
 
215 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>