40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0042 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0042  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  300  6.000000000000001e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.899596  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0396  endonuclease III  51.47 
 
 
174 aa  149  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0198  hypothetical protein  48.57 
 
 
144 aa  135  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000406548  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0414  protein of unknown function DUF123  50.71 
 
 
144 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.434904  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2461  hypothetical protein  47.06 
 
 
148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0051  hypothetical protein  56.2 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3196  protein of unknown function DUF123  52.1 
 
 
141 aa  100  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0898  protein of unknown function DUF123  41.88 
 
 
137 aa  87.4  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0253075  normal  0.780245 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0507  hypothetical protein  37.93 
 
 
139 aa  85.5  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0319472  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0479  protein of unknown function DUF123  38.21 
 
 
134 aa  82.4  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1312  hypothetical protein  32.67 
 
 
162 aa  77.8  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.474029 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1462  protein of unknown function DUF123  35.59 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1071  hypothetical protein  40.5 
 
 
356 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.661198  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1555  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  40.5 
 
 
356 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.272014 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0654  protein of unknown function DUF123  35.9 
 
 
136 aa  72  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0625  hypothetical protein  33.88 
 
 
119 aa  71.6  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0628  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  33.88 
 
 
357 aa  70.9  0.000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0356  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  40 
 
 
356 aa  70.1  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0334689  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0858  hypothetical protein  40.94 
 
 
165 aa  68.9  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3380  protein of unknown function DUF123  39.02 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.798744  normal  0.147915 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1691  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35.29 
 
 
356 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0747  hypothetical protein  34.59 
 
 
168 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0646  hypothetical protein  36.64 
 
 
154 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.269467  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2695  hypothetical protein  38.02 
 
 
188 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02280  hypothetical protein  36.36 
 
 
138 aa  60.5  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273401  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1232  hypothetical protein  35.07 
 
 
164 aa  60.1  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0278  protein of unknown function DUF123  37.72 
 
 
125 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0991873  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0578  protein of unknown function DUF123  31.45 
 
 
133 aa  54.7  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0776  protein of unknown function DUF123  37.38 
 
 
158 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1807  hypothetical protein  33.01 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0796576  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1123  hypothetical protein  44.74 
 
 
146 aa  50.8  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1038  hypothetical protein  38.1 
 
 
146 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.4343 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1424  hypothetical protein  28.57 
 
 
138 aa  48.1  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.149794  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2572  hypothetical protein  36.94 
 
 
126 aa  47.4  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0871  hypothetical protein  36.84 
 
 
131 aa  47  0.00009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0265  hypothetical protein  28.97 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0984626  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0815  hypothetical protein  27.35 
 
 
127 aa  46.2  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0067  hypothetical protein  41.76 
 
 
145 aa  44.7  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0267  hypothetical protein  28.77 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0194677  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0792  hypothetical protein  32.77 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0013461 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>