51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0036 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0036  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
209 aa  404  1.0000000000000001e-112  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2516  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  53.5 
 
 
208 aa  215  2.9999999999999998e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1638  lysine exporter protein LysE/YggA  53.96 
 
 
227 aa  207  7e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1436  lysine exporter protein LysE/YggA  47.29 
 
 
208 aa  191  6e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1393  hypothetical protein  44.44 
 
 
218 aa  187  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  42.57 
 
 
205 aa  176  3e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000434422  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0888  lysine exporter protein LysE/YggA  33.82 
 
 
215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.668433  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0680  lysine exporter protein LysE/YggA  31 
 
 
217 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00731166  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0820  lysine exporter protein LysE/YggA  36.19 
 
 
219 aa  115  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000331206  hitchhiker  0.00549448 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0336  lysine exporter protein LysE/YggA  34.93 
 
 
225 aa  100  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0310124  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0663  lysine exporter protein LysE/YggA  34.74 
 
 
229 aa  92  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.92475  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13310  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.5 
 
 
214 aa  91.7  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00102117  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2082  lysine exporter protein (LysE/YggA)  30.71 
 
 
246 aa  88.6  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0309  lysine exporter protein LysE/YggA  28.29 
 
 
207 aa  79  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0570  lysine exporter protein LysE/YggA  32.37 
 
 
200 aa  76.3  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0391767  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_271  transporter, LysE family  28.5 
 
 
207 aa  74.7  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0323  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  24.91 
 
 
273 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.147172  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0329  amino acid transporter LysE  29.23 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0217  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.96 
 
 
222 aa  73.9  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0016043  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0646  lysine exporter protein LysE/YggA  28.23 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1430  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  22.87 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3244  LysE type translocator  21.72 
 
 
209 aa  64.3  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.549146  normal  0.0797961 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1858  lysine exporter protein LysE/YggA  26.7 
 
 
204 aa  63.5  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1264  lysine exporter protein LysE/YggA  28.83 
 
 
204 aa  63.2  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.49928  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1423  lysine exporter protein LysE/YggA  30.69 
 
 
229 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.598151  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0711  lysine exporter protein LysE/YggA  27.09 
 
 
191 aa  62  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.206617  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0655  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.09 
 
 
209 aa  60.1  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2754  amino acid transporter LysE  26.37 
 
 
212 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0279603  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2768  hypothetical protein  26.37 
 
 
212 aa  60.1  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0752223  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3066  hypothetical protein  26.37 
 
 
209 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0359182  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4333  lysine exporter protein LysE/YggA  25.87 
 
 
220 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.364996  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2018  lysine exporter protein LysE/YggA  24.54 
 
 
206 aa  52.4  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0708  lysine exporter protein LysE/YggA  33.76 
 
 
219 aa  52  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000114889 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3067  lysine exporter protein LysE/YggA  25.43 
 
 
198 aa  49.7  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000755929  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1225  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.39 
 
 
205 aa  49.3  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3051  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  23.08 
 
 
205 aa  49.3  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2468  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.2 
 
 
226 aa  48.5  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2660  LysE family translocator  23.19 
 
 
215 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.094148  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2982  LysE family translocator protein  23.19 
 
 
215 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0903  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.5 
 
 
226 aa  46.6  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1388  amino acid transporter LysE  27.46 
 
 
228 aa  45.1  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0501572  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.64 
 
 
186 aa  45.1  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3124  hypothetical protein  24.02 
 
 
208 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1030  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.12 
 
 
213 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0550484  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2905  hypothetical protein  24.02 
 
 
208 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2832  amino acid transporter LysE  23.5 
 
 
208 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3080  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.8 
 
 
217 aa  42.7  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.300791  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3126  hypothetical protein  23.5 
 
 
208 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2875  hypothetical protein  23.5 
 
 
208 aa  42.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000177691  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3148  hypothetical protein  23 
 
 
208 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1773  hypothetical protein  24.35 
 
 
210 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.499811  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>