More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0029 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0029  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
132 aa  269  9e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.740591  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2729  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  49.21 
 
 
125 aa  122  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.396003  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0359  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.62 
 
 
137 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.389244  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2649  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.9 
 
 
124 aa  106  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1735  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  49.48 
 
 
120 aa  104  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.19658  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0802  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  51.04 
 
 
143 aa  103  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1087  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  48.94 
 
 
126 aa  101  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199515  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1746  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  43.24 
 
 
126 aa  97.4  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117316  normal  0.169635 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1619  ech hydrogenase subunit F  38.33 
 
 
124 aa  97.1  8e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3019  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  46.39 
 
 
128 aa  95.1  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3366  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.16 
 
 
124 aa  94.4  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1575  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.31 
 
 
118 aa  94  7e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.378738 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13390  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I-like protein  42.57 
 
 
300 aa  92.8  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07270  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I-like protein  42.27 
 
 
144 aa  92.8  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.194831  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1668  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  47.62 
 
 
133 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0147  ech hydrogenase subunit F  35.92 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1523  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.2 
 
 
131 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4119  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.53 
 
 
104 aa  75.9  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0840817  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2506  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.53 
 
 
130 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3176  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.69 
 
 
167 aa  67  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4489  NADH dehydrogenase subunit I  34.91 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1877  NADH dehydrogenase subunit I  35.19 
 
 
174 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0786  ech hydrogenase subunit F  42.31 
 
 
114 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1526  NADH dehydrogenase subunit I  36.79 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01791  NADH dehydrogenase subunit I  34.71 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01881  NADH dehydrogenase subunit I  32.77 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02321  NADH dehydrogenase subunit I  36.79 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0161  NADH dehydrogenase subunit I  34.71 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.646634  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3130  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.14 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01771  NADH dehydrogenase subunit I  34.71 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.351878  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1011  NADH dehydrogenase subunit I  36.79 
 
 
193 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1040  NADH dehydrogenase subunit I  36.79 
 
 
193 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000326556 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0289  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.86 
 
 
171 aa  64.3  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1542  NADH dehydrogenase subunit I  35.85 
 
 
174 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.383544  normal  0.0726132 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1344  NADH dehydrogenase subunit I  36.79 
 
 
202 aa  64.3  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2528  NADH dehydrogenase subunit I  40 
 
 
200 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1572  NADH dehydrogenase subunit I  35.85 
 
 
174 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1596  NADH dehydrogenase subunit I  35.85 
 
 
174 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557888  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1869  NADH-quinone oxidoreductase chain I  30.87 
 
 
177 aa  64.3  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26891  NADH dehydrogenase subunit I  34.82 
 
 
218 aa  63.5  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0868  hydrogenase, EchF subunit, putative  41.03 
 
 
114 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.246901  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_771  hydrogenase, EchF subunit  41.03 
 
 
114 aa  62.8  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01761  NADH dehydrogenase subunit I  35.85 
 
 
215 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273282  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2715  NADH dehydrogenase subunit I  31.36 
 
 
194 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6086  NADH dehydrogenase subunit I  27.42 
 
 
211 aa  62.8  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00224994  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0281  NADH dehydrogenase subunit I  35.85 
 
 
210 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2411  NADH dehydrogenase subunit I  35.85 
 
 
215 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2185  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  40.43 
 
 
184 aa  63.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.233255 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13174  NADH dehydrogenase subunit I  35.51 
 
 
218 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3216  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  30.08 
 
 
168 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0346  NADH dehydrogenase I, I subunit  35.78 
 
 
132 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4455  NADH dehydrogenase subunit I  30.97 
 
 
211 aa  62.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.833546 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4002  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.09 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.89067e-17 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0546  NADH dehydrogenase subunit I  29.2 
 
 
217 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175795  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3918  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.09 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4410  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32.71 
 
 
194 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7683  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  27.97 
 
 
203 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1128  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.94 
 
 
140 aa  62  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4057  NADH dehydrogenase subunit I  30.97 
 
 
211 aa  62.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.819652  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0547  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.33 
 
 
226 aa  61.6  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1667  NADH dehydrogenase subunit I  33.96 
 
 
193 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1578  NADH dehydrogenase subunit I  30.51 
 
 
209 aa  61.6  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.116678  normal  0.902926 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2714  hydrogenase 4 subunit H  32.08 
 
 
189 aa  61.6  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.594807  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0401  NADH-plastoquinone oxidoreductase subunit I  31.36 
 
 
194 aa  61.2  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0592  Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)-like protein  29.91 
 
 
171 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1536  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  29.51 
 
 
170 aa  61.2  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  30.33 
 
 
165 aa  60.8  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4236  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.94 
 
 
132 aa  60.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114859  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2225  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.97 
 
 
119 aa  60.5  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0275  NADH dehydrogenase subunit I  33.94 
 
 
199 aa  60.5  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0554  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.74 
 
 
127 aa  60.5  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2276  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.96 
 
 
132 aa  60.5  0.000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0276213  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1757  NADH dehydrogenase subunit I  29.92 
 
 
163 aa  60.5  0.000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.62 
 
 
247 aa  60.1  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5093  NADH dehydrogenase subunit I  29.91 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5420  NADH dehydrogenase subunit I  29.91 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5145  NADH dehydrogenase subunit I  29.91 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4977  NADH dehydrogenase subunit I  29.91 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4995  NADH dehydrogenase subunit I  29.91 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0211  NADH dehydrogenase subunit I  33 
 
 
176 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5537  NADH dehydrogenase subunit I  29.91 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5386  NADH dehydrogenase subunit I  29.91 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1901e-17 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0257  NADH-plastoquinone oxidoreductase subunit I  34.44 
 
 
207 aa  59.3  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1275  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  29.86 
 
 
199 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  29.51 
 
 
165 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3522  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.36 
 
 
128 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5416  NADH dehydrogenase subunit I  29.91 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5471  NADH dehydrogenase subunit I  29.91 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5534  NADH dehydrogenase subunit I  29.91 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0249659 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05703  hypothetical protein similar to : Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (Broad)  30.69 
 
 
224 aa  58.9  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.803618 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0394  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  28.08 
 
 
175 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1251  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.08 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2687  NADH dehydrogenase subunit I  30.77 
 
 
183 aa  58.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0721276  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3347  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.94 
 
 
131 aa  58.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.715886  normal  0.525186 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0982  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  30.25 
 
 
214 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2049  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.98 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0933914 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1284  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.96 
 
 
239 aa  58.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2564  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  34.96 
 
 
239 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1279  hydrogenase 4 subunit H  30.19 
 
 
189 aa  58.5  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.641192  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0204  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.53 
 
 
149 aa  58.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.891239  normal  0.656565 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>