195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0014 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 
189 aa  392  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.49 
 
 
186 aa  194  6e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  47.62 
 
 
215 aa  189  3e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0678  flavoredoxin  48.26 
 
 
184 aa  181  7e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.616599 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1592  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  46.07 
 
 
193 aa  169  2e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0995  hypothetical protein  40.46 
 
 
185 aa  164  5e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418174  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  44.68 
 
 
186 aa  162  4e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1555  flavin reductase domain-containing protein  44.62 
 
 
186 aa  161  5e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.31 
 
 
186 aa  146  2e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  37.37 
 
 
216 aa  143  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  7.09652e-06 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0437  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.36 
 
 
185 aa  132  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0883  hypothetical protein  40.91 
 
 
165 aa  129  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0253557  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  32.79 
 
 
191 aa  115  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0187  flavoredoxin  36.51 
 
 
190 aa  113  1e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871882  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.07 
 
 
194 aa  111  8e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.71 
 
 
189 aa  110  1e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.03 
 
 
190 aa  110  2e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.79 
 
 
190 aa  109  2e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  35.36 
 
 
189 aa  108  4e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  32.47 
 
 
200 aa  108  7e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  5.00824e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  36.26 
 
 
189 aa  107  9e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  34.81 
 
 
189 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.16 
 
 
190 aa  105  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.39 
 
 
190 aa  105  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  4.23527e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  32.28 
 
 
209 aa  105  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  36.72 
 
 
189 aa  104  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  34.07 
 
 
188 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  32.78 
 
 
188 aa  101  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.26 
 
 
186 aa  99  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  4.89831e-08 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.15 
 
 
195 aa  99  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.52 
 
 
192 aa  98.6  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.11 
 
 
189 aa  97.4  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  32.58 
 
 
190 aa  95.9  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.32 
 
 
195 aa  92  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  31.67 
 
 
189 aa  90.9  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  29.55 
 
 
200 aa  89  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.45 
 
 
197 aa  85.5  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2978  flavin reductase-like, FMN-binding  31.37 
 
 
205 aa  82  5e-15  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  31.71 
 
 
192 aa  81.6  6e-15  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  31.71 
 
 
192 aa  81.6  6e-15  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  27.22 
 
 
195 aa  81.3  8e-15  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  29.86 
 
 
192 aa  79.7  2e-14  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0687  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.44 
 
 
192 aa  79  4e-14  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  34.35 
 
 
176 aa  76.6  2e-13  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1222  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.37 
 
 
215 aa  77  2e-13  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.996876  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  29.32 
 
 
160 aa  75.9  3e-13  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2083  flavin reductase-like, FMN-binding  32.68 
 
 
208 aa  75.9  4e-13  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.58 
 
 
176 aa  75.5  5e-13  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0720  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.82 
 
 
195 aa  75.1  5e-13  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  30.07 
 
 
202 aa  75.1  6e-13  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0249  putative flavin reductase  31.36 
 
 
195 aa  74.3  1e-12  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688531  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  29.77 
 
 
178 aa  73.6  2e-12  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  32.09 
 
 
178 aa  73.2  2e-12  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7131  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.36 
 
 
194 aa  73.2  2e-12  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2393  flavin reductase-like  30.07 
 
 
194 aa  72.8  3e-12  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791312  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1931  flavin reductase domain-containing protein  30.22 
 
 
197 aa  72.4  3e-12  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0605182 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  29.32 
 
 
184 aa  72  4e-12  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  4.40007e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0249  flavoredoxin, putative  28.04 
 
 
187 aa  71.6  6e-12  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  3.03002e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00650  conserved protein of DIM6/NTAB family  28.29 
 
 
194 aa  71.2  8e-12  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  29.85 
 
 
177 aa  70.9  9e-12  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4577  flavin reductase domain-containing protein  28.92 
 
 
189 aa  70.1  2e-11  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.81 
 
 
185 aa  70.1  2e-11  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  25.69 
 
 
188 aa  69.3  3e-11  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2659  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  29.41 
 
 
194 aa  69.3  3e-11  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.125103  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2781  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.33 
 
 
167 aa  68.9  5e-11  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.73643e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  30.37 
 
 
176 aa  67.8  8e-11  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0606  flavin reductase family protein  29.41 
 
 
201 aa  67.8  1e-10  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3891  flavin reductase domain-containing protein  30.12 
 
 
194 aa  67.4  1e-10  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824714  normal  0.0240386 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1998  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  29.41 
 
 
201 aa  67.8  1e-10  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1242  flavin reductase domain-containing protein  31.61 
 
 
192 aa  67.4  1e-10  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.877507  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0699  hypothetical protein  29.41 
 
 
201 aa  67.8  1e-10  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0883  flavin reductase-like, FMN-binding  30.97 
 
 
196 aa  66.2  2e-10  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.519156  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4765  flavin reductase-like, FMN-binding  30.07 
 
 
199 aa  66.6  2e-10  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3128  flavin reductase domain-containing protein  29.55 
 
 
185 aa  67  2e-10  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.87 
 
 
186 aa  66.6  2e-10  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1365  flavin reductase domain-containing protein  30.97 
 
 
196 aa  66.2  2e-10  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1343  flavin reductase domain-containing protein  30.97 
 
 
196 aa  65.9  3e-10  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  29.5 
 
 
177 aa  65.9  3e-10  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.41 
 
 
189 aa  65.1  5e-10  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25740  conserved protein of DIM6/NTAB family  25.28 
 
 
187 aa  65.5  5e-10  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2155  flavin reductase domain-containing protein  26.97 
 
 
192 aa  64.3  9e-10  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2046  hypothetical protein  31.21 
 
 
194 aa  64.3  1e-09  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.179971  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3753  flavin reductase-like, FMN-binding  27.27 
 
 
186 aa  63.2  2e-09  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722732  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.71 
 
 
186 aa  63.5  2e-09  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.365491  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3226  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.76 
 
 
185 aa  63.2  2e-09  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4508  flavin reductase-like, FMN-binding  30.32 
 
 
194 aa  62.8  3e-09  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.372543 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.66 
 
 
193 aa  62.4  4e-09  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.66 
 
 
225 aa  62  5e-09  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.575581 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  27.27 
 
 
183 aa  60.8  1e-08  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5217  flavin reductase domain-containing protein  30.15 
 
 
182 aa  60.5  2e-08  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1230  flavin reductase domain-containing protein  27.03 
 
 
177 aa  59.3  3e-08  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.407466  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4078  flavin reductase domain-containing protein  27.14 
 
 
204 aa  58.9  5e-08  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0980  flavin reductase domain-containing protein  29.3 
 
 
194 aa  58.5  5e-08  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2185  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.56 
 
 
189 aa  58.5  6e-08  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00717772  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01420  hypothetical protein  31.3 
 
 
189 aa  58.2  8e-08  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1546  flavin reductase domain-containing protein  30.56 
 
 
189 aa  57.8  8e-08  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.917994  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1643  flavin reductase domain-containing protein  31.3 
 
 
189 aa  58.2  8e-08  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01432  hypothetical protein  31.3 
 
 
189 aa  58.2  8e-08  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2194  flavin reductase domain-containing protein  31.3 
 
 
189 aa  57.4  1e-07  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1712  flavin reductase domain-containing protein  31.3 
 
 
189 aa  56.6  2e-07  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.0473113 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>