273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0010 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
226 aa  468  1.0000000000000001e-131  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1058  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  54.34 
 
 
231 aa  275  3e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3394  uncharacterized Fe-S protein  53.78 
 
 
229 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.145168  normal  0.150282 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.07 
 
 
268 aa  99.4  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.822479  normal  0.0323586 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0454  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.51 
 
 
263 aa  89  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0098  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.75 
 
 
247 aa  87.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0190566 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0355  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.16 
 
 
265 aa  85.5  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101767  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0166  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.9 
 
 
226 aa  85.5  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0199  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.09 
 
 
243 aa  82  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.342722  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1280  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.23 
 
 
236 aa  82  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.972743  normal  0.606633 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0271  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.66 
 
 
238 aa  80.1  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1968  reductive dehalogenase  29.58 
 
 
399 aa  79  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.821094  normal  0.460125 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2064  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.18 
 
 
229 aa  79  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0106474  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0583  hypothetical protein  31.53 
 
 
259 aa  77  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.159382  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2204  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.01 
 
 
233 aa  75.9  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000614225  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2568  Fe-S protein-like protein  34.62 
 
 
220 aa  72.8  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1046  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.72 
 
 
263 aa  72  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1916  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.9 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0176  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.67 
 
 
282 aa  69.7  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0030917  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3141  iron-sulfur cluster-binding protein  30.11 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.4 
 
 
227 aa  68.2  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0696  reductive dehalogenase  27.49 
 
 
550 aa  67.4  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000940573  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02610  hypothetical protein  28.87 
 
 
275 aa  66.6  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144951  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2589  hypothetical protein  30.81 
 
 
267 aa  65.1  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0840  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  37.01 
 
 
238 aa  63.5  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.283027  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2872  reductive dehalogenase  34.71 
 
 
514 aa  62.8  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.111424  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2870  reductive dehalogenase  34.71 
 
 
514 aa  62.4  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0453791  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2103  hypothetical protein  37.17 
 
 
507 aa  62  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66471  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3280  domain of unknown function DUF1730  33.33 
 
 
404 aa  62  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.387433  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0507  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.22 
 
 
386 aa  62  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1368  iron-sulfur cluster binding protein  26.88 
 
 
380 aa  61.6  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0693  reductive dehalogenase  27.75 
 
 
352 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2620  reductive dehalogenase  31.78 
 
 
345 aa  60.1  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0460  putative iron-sulfur cluster binding protein  27.91 
 
 
380 aa  60.1  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0468  putative iron-sulfur cluster binding protein  31.36 
 
 
380 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.385519  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1298  hypothetical protein  30.63 
 
 
380 aa  58.9  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000112138  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0600  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  31.36 
 
 
380 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0245724  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0514  iron-sulfur cluster-binding protein  31.36 
 
 
380 aa  58.9  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0457  hypothetical protein  31.36 
 
 
380 aa  58.5  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00117546  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0453  hypothetical protein  31.36 
 
 
380 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0546  putative iron-sulfur cluster-binding protein  31.36 
 
 
380 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9308099999999996e-42 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0545  iron-sulfur cluster-binding protein  31.36 
 
 
380 aa  58.9  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00111549  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0621  putative iron-sulfur cluster-binding protein  31.36 
 
 
380 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3176  hypothetical protein  33.33 
 
 
380 aa  57.8  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0137  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.66 
 
 
251 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0243  iron-sulfur cluster-binding protein  32.31 
 
 
275 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00409826 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0582  putative iron-sulfur cluster-binding protein  30.51 
 
 
380 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3598  hypothetical protein  28.91 
 
 
383 aa  57  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4756  putative iron-sulfur cluster-binding protein  30.51 
 
 
380 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0149452  hitchhiker  2.27135e-16 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0329  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  26.8 
 
 
640 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.48075  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0503  iron-sulfur cluster binding protein  29.91 
 
 
389 aa  55.8  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0258  iron-sulfur cluster-binding protein  31.54 
 
 
273 aa  55.5  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0353  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  29.52 
 
 
640 aa  55.8  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.200551  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0689  reductive dehalogenase  25.97 
 
 
463 aa  55.5  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0341  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  29.52 
 
 
640 aa  55.5  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2385  hypothetical protein  34.26 
 
 
349 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2662  domain of unknown function DUF1730  34.23 
 
 
392 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0913  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.78 
 
 
445 aa  55.1  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1382  hypothetical protein  41.98 
 
 
257 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1152  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.39 
 
 
354 aa  54.7  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.592617  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1392  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  31.9 
 
 
376 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1302  iron-sulfur cluster binding protein, putative  27.18 
 
 
373 aa  54.3  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1337  hypothetical protein  34.26 
 
 
393 aa  54.3  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3132  hypothetical protein  34.21 
 
 
363 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240229  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1581  hypothetical protein  24.62 
 
 
359 aa  53.9  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4019  hypothetical protein  26.52 
 
 
408 aa  53.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170373  normal  0.66585 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3578  reductive dehalogenase  25.61 
 
 
1070 aa  53.9  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.960062  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1496  hypothetical protein  35.54 
 
 
218 aa  53.1  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11041  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2342  protein of unknown function DUF1730  31.48 
 
 
356 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.932969 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3974  reductive dehalogenase  32.35 
 
 
1069 aa  53.1  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2411  iron-sulfur cluster binding protein  35.53 
 
 
383 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400236  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2997  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.83 
 
 
442 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_002936  DET1545  reductive dehalogenase, putative  34.19 
 
 
500 aa  53.1  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0517  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  27.93 
 
 
374 aa  52.8  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3314  iron-sulfur cluster binding protein  31.48 
 
 
392 aa  52.8  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.117611  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2044  hypothetical protein  30.17 
 
 
330 aa  52.4  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.281563  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2817  iron-sulfur cluster binding protein  34.38 
 
 
385 aa  52.4  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309396  normal  0.804371 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2669  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25 
 
 
450 aa  52.8  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.848409  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1081  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.82 
 
 
290 aa  52.4  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1362  domain of unknown function DUF1730  29.41 
 
 
385 aa  52.4  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.245497  hitchhiker  0.0074911 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1944  putative iron-sulfur cluster binding protein  32.76 
 
 
375 aa  52.4  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.331429  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1910  putative iron-sulfur cluster binding protein  32.76 
 
 
375 aa  52.4  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263925  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2782  putative ferredoxin, 4Fe-4S binding protein  32.41 
 
 
372 aa  52.4  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1436  reductive dehalogenase  42.86 
 
 
523 aa  52.4  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5422  domain of unknown function DUF1730  33.33 
 
 
389 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.98716  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05220  uncharacterized Fe-S protein  35.14 
 
 
277 aa  52  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00061  hypothetical protein  25 
 
 
314 aa  52  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.454167  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0807  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  30.53 
 
 
270 aa  51.6  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.439359 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4182  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25.1 
 
 
360 aa  51.6  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327368  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2541  putative iron-sulfur 4Fe-4S ferredoxin protein  34.21 
 
 
360 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1045  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  32.41 
 
 
398 aa  51.6  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0900  iron-sulfur cluster binding protein  31.87 
 
 
360 aa  51.2  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4691  iron-sulfur cluster binding protein  31.58 
 
 
354 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0983  putative iron-sulfur cluster-binding protein  32.41 
 
 
404 aa  51.6  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0440  domain of unknown function DUF1730  30.84 
 
 
353 aa  51.6  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00797528  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0891  4Fe-4S cluster binding protein  32.41 
 
 
363 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0619732  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2753  iron-sulfur cluster-binding protein  30.56 
 
 
369 aa  51.6  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006724  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0985  putative iron-sulfur cluster binding protein  31.87 
 
 
361 aa  51.6  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.188512  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0597  putative iron-sulfur cluster binding protein  31.48 
 
 
364 aa  51.2  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1030  iron-sulfur cluster binding protein  29.63 
 
 
373 aa  51.6  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0665154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>