More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0003 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  100 
 
 
385 aa  794    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  73.56 
 
 
388 aa  590  1e-167  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  69.01 
 
 
400 aa  559  1e-158  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0003  aminotransferase, class I and II  67.27 
 
 
386 aa  533  1e-150  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.987312  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  64.86 
 
 
387 aa  526  1e-148  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  55.47 
 
 
390 aa  464  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  54.83 
 
 
391 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  54.57 
 
 
396 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  54.57 
 
 
396 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  54.57 
 
 
396 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  54.83 
 
 
396 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  54.57 
 
 
396 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  57.18 
 
 
396 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  54.83 
 
 
396 aa  451  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  54.05 
 
 
396 aa  449  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  54.57 
 
 
396 aa  451  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  54.31 
 
 
396 aa  449  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  54.31 
 
 
396 aa  450  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  57.7 
 
 
393 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  53 
 
 
396 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  55.47 
 
 
390 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  51.94 
 
 
407 aa  437  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1205  putative aspartate aminotransferase  53.66 
 
 
397 aa  436  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  55.38 
 
 
399 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  55.64 
 
 
393 aa  433  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2403  aminotransferase class I and II  51.7 
 
 
387 aa  432  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0215397  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  53.74 
 
 
405 aa  428  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  53.28 
 
 
404 aa  427  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  49.34 
 
 
387 aa  425  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  52.24 
 
 
388 aa  425  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  50.26 
 
 
392 aa  424  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  50.26 
 
 
392 aa  424  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  50.13 
 
 
390 aa  418  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  51.43 
 
 
391 aa  416  9.999999999999999e-116  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1533  aminotransferase class I and II  53.16 
 
 
385 aa  412  1e-114  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  50.91 
 
 
386 aa  409  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0048  aminotransferase class I and II  50.39 
 
 
401 aa  409  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00536151  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  50.26 
 
 
398 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  49.74 
 
 
398 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  49.22 
 
 
398 aa  401  1e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  49.47 
 
 
402 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  48.44 
 
 
386 aa  389  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  48.3 
 
 
395 aa  389  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2858  aminotransferase class I and II  50.66 
 
 
381 aa  388  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.961149  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  50.26 
 
 
410 aa  382  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  50.65 
 
 
393 aa  384  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  49.87 
 
 
387 aa  382  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1319  aminotransferase class I and II  50.79 
 
 
380 aa  379  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0755058 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3529  aminotransferase class I and II  49.87 
 
 
385 aa  380  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2149  aminotransferase class I and II  49.87 
 
 
383 aa  381  1e-104  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.152538 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3535  aminotransferase class I and II  48.41 
 
 
381 aa  375  1e-103  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  50 
 
 
388 aa  372  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  49.08 
 
 
386 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  46.86 
 
 
388 aa  364  2e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  40.99 
 
 
387 aa  323  4e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  40.73 
 
 
385 aa  322  6e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  40.99 
 
 
387 aa  322  8e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  40.73 
 
 
387 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  40.73 
 
 
387 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  40.99 
 
 
387 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  40.73 
 
 
387 aa  319  5e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  40.73 
 
 
387 aa  319  5e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  40.21 
 
 
387 aa  319  6e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  40.58 
 
 
387 aa  319  6e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2710  aminotransferase A  40.31 
 
 
387 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  44.23 
 
 
379 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  43.04 
 
 
370 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  45.84 
 
 
367 aa  300  2e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  40.21 
 
 
380 aa  298  1e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1874  aspartate aminotransferase  39.89 
 
 
380 aa  296  4e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  40.26 
 
 
386 aa  295  7e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  42.46 
 
 
375 aa  293  3e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2163  aminotransferase, classes I and II  39.08 
 
 
380 aa  292  7e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1232  aminotransferase  39.02 
 
 
399 aa  292  8e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0316  aminotransferase A  37.08 
 
 
398 aa  291  1e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.125137  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0921  aminotransferase  39.47 
 
 
401 aa  291  1e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000271022  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0931  aminotransferase A  38.38 
 
 
382 aa  288  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  39.6 
 
 
380 aa  286  4e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1809  aminotransferase A  39.43 
 
 
385 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2836  aminotransferase class I and II  39.74 
 
 
387 aa  281  1e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.04752  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  40.41 
 
 
392 aa  281  2e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0056  aspartate aminotransferase  39.9 
 
 
379 aa  276  3e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  38.79 
 
 
375 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1131  aminotransferase class I and II  34.9 
 
 
384 aa  273  3e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220252  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1108  aminotransferase, class I and II  34.9 
 
 
384 aa  273  3e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00053469  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  39.07 
 
 
397 aa  273  5.000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  39.07 
 
 
397 aa  272  6e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  37.53 
 
 
394 aa  271  1e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  36.72 
 
 
385 aa  270  2e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3133  aminotransferase  41.11 
 
 
370 aa  270  4e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.367697  normal  0.475875 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  37.71 
 
 
387 aa  269  5e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0617  aminotransferase  35.19 
 
 
394 aa  268  8.999999999999999e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1200  aminotransferase  37.5 
 
 
393 aa  268  1e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.241319  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2478  aspartate aminotransferase  39.27 
 
 
377 aa  268  2e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0046  aromatic amino acid aminotransferase  37.93 
 
 
391 aa  268  2e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0104565  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0044  aromatic amino acid aminotransferase  37.73 
 
 
395 aa  266  4e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1200  aminotransferase, class I and II  40.42 
 
 
371 aa  266  5e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162477  normal  0.0266801 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1377  aromatic amino acid aminotransferase  39.37 
 
 
400 aa  265  8.999999999999999e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.907839  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  39.69 
 
 
393 aa  265  1e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  37.28 
 
 
412 aa  265  1e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>