More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0002 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0002  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
163 aa  333  5.999999999999999e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0002  transcriptional regulator, AsnC family  65.64 
 
 
163 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00778678 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0002  AsnC family transcriptional regulator  60.12 
 
 
163 aa  214  2.9999999999999998e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355793  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2472  AsnC family transcriptional regulator  58.9 
 
 
163 aa  200  7e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3464  AsnC family transcriptional regulator  44.79 
 
 
163 aa  157  7e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00420636 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0002  AsnC family transcriptional regulator  46.94 
 
 
163 aa  150  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1189  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 
167 aa  149  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000169629  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2100  AsnC family transcriptional regulator  42.59 
 
 
163 aa  147  7e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0186  AsnC family transcriptional regulator  41.4 
 
 
162 aa  147  9e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000683645  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0047  transcriptional regulator, AsnC family  41.88 
 
 
162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00562884  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1123  transcriptional regulator, AsnC family  43.51 
 
 
160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3193  AsnC family transcriptional regulator  44.81 
 
 
159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.680188  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1532  transcriptional regulator, AsnC family  46.15 
 
 
161 aa  145  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0879  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
159 aa  145  3e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1152  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
160 aa  143  8.000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0149  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 
160 aa  140  8e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1341  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 
160 aa  140  9e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2663  transcriptional regulator, AsnC family  40.52 
 
 
164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00226227  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1415  transcriptional regulator, AsnC family  40.26 
 
 
162 aa  138  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.959948  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2209  transcriptional regulator, AsnC family  41.45 
 
 
159 aa  137  6e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.928029  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2183  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
162 aa  137  8.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00948662  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2404  transcriptional regulator, AsnC family  40.26 
 
 
165 aa  134  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000668055  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0362  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 
159 aa  134  7.000000000000001e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1206  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 
162 aa  133  8e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3528  transcriptional regulator, AsnC family  44.23 
 
 
161 aa  132  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0541368  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3008  transcriptional regulator, AsnC family  37.74 
 
 
178 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0706  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 
160 aa  130  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0700  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 
160 aa  130  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.567855  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2150  transcriptional regulator, AsnC family  39.87 
 
 
164 aa  124  5e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.171869 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2857  transcriptional regulator, AsnC family  41.36 
 
 
162 aa  122  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.301241  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4724  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 
165 aa  122  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3513  AsnC family transcriptional regulator  39.19 
 
 
164 aa  121  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2862  transcriptional regulator, AsnC family  36.55 
 
 
166 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5041  AsnC family transcriptional regulator  36.31 
 
 
165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4772  AsnC family transcriptional regulator  36.31 
 
 
168 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4612  AsnC family transcriptional regulator  36.31 
 
 
168 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5134  AsnC family transcriptional regulator  36.31 
 
 
168 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5013  transcriptional regulator, AsnC family  36.31 
 
 
165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4634  AsnC family transcriptional regulator  36.31 
 
 
168 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5034  transcriptional regulator, AsnC family  36.31 
 
 
165 aa  117  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0638366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0200  transcriptional regulator, AsnC family  36.31 
 
 
165 aa  117  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5046  transcriptional regulator, AsnC family  35.67 
 
 
165 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1320  transcriptional regulator, AsnC family  35 
 
 
162 aa  116  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3534  transcriptional regulator, AsnC family  38.06 
 
 
162 aa  116  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1770  transcriptional regulator, AsnC family  36.84 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000758756  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2838  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 
162 aa  95.9  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258755 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0104  transcriptional regulator, AsnC family  31.39 
 
 
148 aa  70.9  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274571  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3837  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261619  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  26.9 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2886  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1942  AsnC family transcriptional regulator  27.81 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0292999  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1745  transcriptional regulator, AsnC family  27.81 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  26.95 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  29.66 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  28.97 
 
 
151 aa  67  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  24.66 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  29.73 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0738  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2647  AsnC family transcriptional regulator  27.56 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  26.9 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1068  leucine regulator  28.29 
 
 
153 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000926215 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  26.24 
 
 
158 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1665  AsnC family transcriptional regulator  26.03 
 
 
156 aa  63.9  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1101  regulator for leucine  28.29 
 
 
153 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1009  regulator for leucine  28.29 
 
 
153 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000013184  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1036  leucine regulator  28.29 
 
 
153 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  hitchhiker  0.000390599 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0571  transcriptional regulator, AsnC family  26.71 
 
 
154 aa  63.2  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  26.03 
 
 
157 aa  63.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3095  AsnC family transcriptional regulator  25.33 
 
 
174 aa  62  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679009  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  24.66 
 
 
163 aa  62  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1324  AsnC family transcriptional regulator  24.83 
 
 
150 aa  61.6  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.719808  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0663  transcriptional regulator, AsnC family  30.56 
 
 
153 aa  61.6  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  27.89 
 
 
155 aa  61.2  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  23.97 
 
 
155 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  26.22 
 
 
170 aa  60.8  0.000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  23.97 
 
 
155 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  22.7 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0079  AsnC family transcriptional regulator  25.17 
 
 
161 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0097  AsnC family transcriptional regulator  25.17 
 
 
161 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2047  transcriptional regulator, AsnC family  25.53 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3260  AsnC family transcriptional regulator  25.17 
 
 
161 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0590  transcriptional regulator, AsnC family  29.75 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0078  AsnC family transcriptional regulator  25.17 
 
 
161 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746042  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3718  AsnC family transcriptional regulator  25.34 
 
 
154 aa  59.7  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.068144 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  25.34 
 
 
157 aa  60.1  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2976  AsnC family transcriptional regulator  25.17 
 
 
161 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0070  AsnC family transcriptional regulator  25.17 
 
 
161 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2969  AsnC family transcriptional regulator  24.67 
 
 
174 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  22.6 
 
 
152 aa  60.5  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0079  AsnC family transcriptional regulator  25.17 
 
 
161 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123654  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1319  transcription regulator AsnC  24.67 
 
 
174 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2279  AsnC family transcriptional regulator  24 
 
 
174 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3860  AsnC family transcriptional regulator  28.85 
 
 
156 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2165  AsnC family transcriptional regulator  26.21 
 
 
151 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  26.39 
 
 
164 aa  58.9  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0837  AsnC family transcriptional regulator  26.21 
 
 
158 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0388954  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  23.29 
 
 
155 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19100  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.33 
 
 
155 aa  58.5  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000170576  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0703  AsnC family transcriptional regulator  23.29 
 
 
159 aa  58.5  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0327834  normal  0.632434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>