More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3635 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  538  9.999999999999999e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2012  Methyltransferase type 11  51.35 
 
 
263 aa  270  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000802206  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  46.56 
 
 
263 aa  263  3e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  46.56 
 
 
263 aa  263  3e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  46.56 
 
 
263 aa  263  3e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  45.21 
 
 
268 aa  249  4e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  43.3 
 
 
258 aa  248  1e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  34.1 
 
 
262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1261  hypothetical protein  32.95 
 
 
250 aa  136  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  30 
 
 
264 aa  132  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0112  Methyltransferase type 11  31.66 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.387929 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  34.48 
 
 
258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  34.72 
 
 
337 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 
253 aa  123  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  31.38 
 
 
264 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  31.66 
 
 
268 aa  120  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  36.97 
 
 
259 aa  119  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  31.84 
 
 
252 aa  118  9e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  32.47 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.35 
 
 
260 aa  112  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0896  Methyltransferase type 11  33.65 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0267941  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  33.49 
 
 
251 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2149  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  35.68 
 
 
254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  35.35 
 
 
251 aa  108  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3333  Methyltransferase type 11  29.51 
 
 
257 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  26.58 
 
 
255 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  30.6 
 
 
258 aa  102  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  35.95 
 
 
270 aa  100  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  26.94 
 
 
254 aa  97.4  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  28.23 
 
 
263 aa  94.4  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  25.94 
 
 
258 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0785  methyltransferase type 11  30.57 
 
 
267 aa  92.4  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  28.05 
 
 
255 aa  92  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01566  conserved hypothetical protein  31.06 
 
 
279 aa  90.5  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145995  normal  0.121317 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3158  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.25 
 
 
252 aa  91.3  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  27.44 
 
 
246 aa  89.7  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3852  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.71 
 
 
269 aa  89.4  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.223127  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.47 
 
 
260 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1816  Trans-aconitate 2-methyltransferase  25.91 
 
 
259 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000117275 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 
247 aa  86.7  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8614  Trans-aconitate 2-methyltransferase  27.24 
 
 
250 aa  87  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13820  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.15 
 
 
255 aa  86.3  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328183  normal  0.535788 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2075  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.6 
 
 
287 aa  85.9  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.864232  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  31.32 
 
 
270 aa  85.5  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  26.23 
 
 
253 aa  84.3  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  23.77 
 
 
257 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  25.75 
 
 
307 aa  84  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.63 
 
 
258 aa  83.2  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0608  Trans-aconitate 2-methyltransferase  25.88 
 
 
262 aa  82.8  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.63 
 
 
258 aa  82.8  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0277  methyltransferase type 11  27.98 
 
 
244 aa  82  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0992  Trans-aconitate 2-methyltransferase  25.09 
 
 
294 aa  81.6  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17170  trans-aconitate methyltransferase  26.51 
 
 
255 aa  81.6  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00821566  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0730  hypothetical protein  25.29 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.16 
 
 
259 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10301  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.1 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0338576  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0316  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.71 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.224637  normal  0.898974 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0358  hypothetical protein  35.11 
 
 
258 aa  79.7  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0334  hypothetical protein  34.35 
 
 
258 aa  79.3  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4126  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.24 
 
 
256 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2430  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.18 
 
 
268 aa  78.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0374  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.57 
 
 
254 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603842  normal  0.758289 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4574  Trans-aconitate 2-methyltransferase  26 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0386  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.57 
 
 
254 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0397352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0395  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.57 
 
 
254 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2747  hypothetical protein  30.67 
 
 
266 aa  76.6  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2620  hypothetical protein  30.67 
 
 
266 aa  76.6  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0425  trans-aconitate 2-methyltransferase  23.94 
 
 
254 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.500195  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  30.86 
 
 
285 aa  75.5  0.0000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2481  trans-aconitate 2-methyltransferase  22.26 
 
 
256 aa  75.5  0.0000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0101749  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.82 
 
 
258 aa  75.1  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2132  trans-aconitate 2-methyltransferase  23.22 
 
 
252 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523623  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2136  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.63 
 
 
256 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000208135  decreased coverage  0.00294275 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01476  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.15 
 
 
252 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2127  Trans-aconitate 2-methyltransferase  24.15 
 
 
252 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7237  methyltransferase type 11  38.26 
 
 
269 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0859301  normal  0.799948 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3885  methyltransferase type 11  37.1 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2139  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.15 
 
 
252 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01487  hypothetical protein  24.15 
 
 
252 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2109  hypothetical protein  25 
 
 
253 aa  73.9  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.66 
 
 
260 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  23.4 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.335531  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2134  hypothetical protein  25.42 
 
 
253 aa  72.8  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0077  trans-aconitate methyltransferase  33.09 
 
 
258 aa  72.4  0.000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4839  putative methyltransferase  37.3 
 
 
271 aa  72.4  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4335  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.85 
 
 
254 aa  72.4  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  31.86 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  35.51 
 
 
209 aa  72  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1601  trans-aconitate 2-methyltransferase  23.77 
 
 
252 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.767111  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6020  Trans-aconitate 2-methyltransferase  23.69 
 
 
252 aa  71.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2909  trans-aconitate 2-methyltransferase  21.93 
 
 
256 aa  71.2  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0465109  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1653  trans-aconitate 2-methyltransferase  22.47 
 
 
252 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.217982  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1276  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.1 
 
 
271 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.281343  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  31.78 
 
 
213 aa  70.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3451  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.15 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  41.18 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2874  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.45 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  28.21 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>