More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3567 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  100 
 
 
284 aa  587  1e-166  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  50.7 
 
 
288 aa  316  3e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2002  hypothetical protein  48.94 
 
 
289 aa  299  3e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.419802 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2505  Methyltransferase type 11  51.37 
 
 
267 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618552  normal  0.420988 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  40.78 
 
 
284 aa  236  3e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  37.59 
 
 
294 aa  207  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1916  putative SAM-dependent methyltransferase  34.3 
 
 
299 aa  174  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0327  putative SAM-dependent methyltransferase  32.85 
 
 
323 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1216  hypothetical protein  33.6 
 
 
286 aa  156  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.43284  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  30.71 
 
 
292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1008  hypothetical protein  25.88 
 
 
270 aa  101  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.823192 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0487  Methyltransferase type 11  26.43 
 
 
270 aa  99  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000866959 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1510  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.58 
 
 
275 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2634  hypothetical protein  23.68 
 
 
268 aa  86.7  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.167376  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1781  SAM (and some other nucleotide) binding motif  31.98 
 
 
286 aa  83.6  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183763  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0122  SAM-binding motif-containing protein  30.96 
 
 
286 aa  82.4  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0046  methyltransferase type 12  30.85 
 
 
283 aa  80.1  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.165361  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  30.22 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0245  ribosomal RNA adenine dimethylase  31.16 
 
 
278 aa  75.9  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14559  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0960  methyltransferase  34.45 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0091  hypothetical protein  33.08 
 
 
240 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0346514  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1471  methyltransferase type 11  31.68 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0487894  normal  0.185117 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0817  methyltransferase  33.83 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0150  methyltransferase  36.49 
 
 
269 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.520005  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  27.24 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2016  methyltransferase  33.57 
 
 
283 aa  71.6  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1924  methyltransferase type 12  36.8 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.302412  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2275  methyltransferase type 12  28.63 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0992  Methyltransferase type 11  25.37 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.358942  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1090  methyltransferase  33.11 
 
 
283 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000294134  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01690  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.05 
 
 
291 aa  67  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.160618  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1590  Methyltransferase type 11  35.54 
 
 
298 aa  67  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0369722  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1127  methyltransferase type 12  27.94 
 
 
302 aa  67  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287777  hitchhiker  0.00000151267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2033  methyltransferase  31.45 
 
 
302 aa  65.9  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.931745  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1982  hypothetical protein  24.36 
 
 
268 aa  65.9  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  27.59 
 
 
274 aa  65.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1320  putative methyltransferase  35.85 
 
 
291 aa  65.1  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0429  methyltransferase type 12  28.41 
 
 
275 aa  65.1  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0326  hypothetical protein  26.91 
 
 
276 aa  64.3  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1317  ribosomal RNA adenine dimethylase  29.81 
 
 
279 aa  63.9  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222413  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3701  methyltransferase type 12  32.87 
 
 
279 aa  63.5  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09260  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.94 
 
 
352 aa  62.8  0.000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.505356  normal  0.0667798 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0514  methyltransferase domain-containing protein  29.79 
 
 
242 aa  62.4  0.000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2360  methyltransferase type 12  31.08 
 
 
319 aa  62.4  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.328542  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0206  hypothetical protein  22.27 
 
 
268 aa  61.6  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0297191  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  37.66 
 
 
266 aa  60.8  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
258 aa  61.2  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1447  hypothetical protein  31.06 
 
 
280 aa  61.2  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.814616  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1288  serine protease  26.24 
 
 
279 aa  60.1  0.00000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00462648  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2737  methyltransferase  32.47 
 
 
278 aa  60.1  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000116085  decreased coverage  0.0000479797 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1797  flagellar basal-body rod protein  30 
 
 
241 aa  59.7  0.00000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.119466  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0058  methyltransferase type 11  37.25 
 
 
287 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0207  hypothetical protein  22.65 
 
 
287 aa  59.7  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172227  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3676  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.67 
 
 
230 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0791082 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0352  Methyltransferase type 11  26.74 
 
 
249 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1672  hypothetical protein  40.45 
 
 
268 aa  58.5  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.51834  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0474  hypothetical protein  35.87 
 
 
252 aa  56.6  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  36.84 
 
 
246 aa  56.6  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1585  Methyltransferase type 12  35.71 
 
 
255 aa  56.6  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.589292  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0288  hypothetical protein  26.67 
 
 
239 aa  56.2  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  33.77 
 
 
244 aa  55.1  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2361  methyltransferase type 12  26.82 
 
 
291 aa  55.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1983  hypothetical protein  24.74 
 
 
295 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0040  hypothetical protein  27.08 
 
 
232 aa  55.1  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1721  hypothetical protein  27.08 
 
 
239 aa  55.1  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1469  methyltransferase type 11  29.93 
 
 
280 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000470965  normal  0.0590447 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0311  hypothetical protein  25.69 
 
 
237 aa  54.7  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.322092  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04480  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.31 
 
 
263 aa  54.3  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.110079  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  33.71 
 
 
276 aa  54.7  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0543  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
247 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0079  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.36 
 
 
253 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0762202 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  37.66 
 
 
220 aa  53.9  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0005  Methyltransferase type 11  33.67 
 
 
293 aa  53.5  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0234268 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  29.6 
 
 
312 aa  53.5  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0403  putative methyltransferase  31.06 
 
 
210 aa  52.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00297063  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  31.31 
 
 
219 aa  53.1  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0812  hypothetical protein  26.98 
 
 
271 aa  52.8  0.000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001478  SAM-dependent methyltransferase  29.05 
 
 
191 aa  52.8  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.544466  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  27.86 
 
 
202 aa  52.4  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.96 
 
 
250 aa  52.4  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0040  hypothetical protein  26.01 
 
 
274 aa  52.4  0.000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.25968  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1722  hypothetical protein  23.74 
 
 
279 aa  52.4  0.000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1495  hypothetical protein  24.62 
 
 
273 aa  52  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000420591  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  28.97 
 
 
268 aa  52  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 
262 aa  52  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1285  methyltransferase type 12  24.62 
 
 
273 aa  52  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0369  methyltransferase type 12  25 
 
 
254 aa  51.2  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.151072  normal  0.249023 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  30.95 
 
 
220 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  30.95 
 
 
220 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  30.95 
 
 
220 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  30.95 
 
 
220 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  30.95 
 
 
220 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  38.3 
 
 
263 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0607  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.83 
 
 
253 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.18812  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0415  methyltransferase type 11  44.68 
 
 
278 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.670256 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7150  methyltransferase  30.1 
 
 
249 aa  51.2  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.458716  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  30.95 
 
 
220 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0438  methyltransferase type 11  44.68 
 
 
278 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0218483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0428  methyltransferase type 11  44.68 
 
 
278 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05419  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.5 
 
 
232 aa  50.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>