More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3512 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
302 aa  624  1e-178  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  66.89 
 
 
301 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  56.48 
 
 
309 aa  379  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  60.26 
 
 
303 aa  377  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  54.97 
 
 
303 aa  372  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  58.82 
 
 
306 aa  372  1e-102  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  57.14 
 
 
305 aa  366  1e-100  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  57.81 
 
 
312 aa  367  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  56.44 
 
 
314 aa  353  2.9999999999999997e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  54.85 
 
 
309 aa  351  1e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  52.81 
 
 
303 aa  349  3e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  54.79 
 
 
312 aa  349  4e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  53.29 
 
 
315 aa  348  8e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  52.48 
 
 
303 aa  346  3e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  53.16 
 
 
302 aa  345  7e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  55.26 
 
 
309 aa  342  5e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  54.28 
 
 
320 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  53.8 
 
 
313 aa  341  7e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1113  ornithine carbamoyltransferase  52.16 
 
 
302 aa  340  2e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 
305 aa  333  3e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  53.82 
 
 
307 aa  332  4e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  55.15 
 
 
312 aa  331  7.000000000000001e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  54.67 
 
 
308 aa  331  9e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 
303 aa  330  2e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  53.95 
 
 
305 aa  327  1.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  53.29 
 
 
316 aa  326  2.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1756  ornithine carbamoyltransferase  52 
 
 
323 aa  326  2.0000000000000001e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  51.66 
 
 
305 aa  326  3e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 
305 aa  325  4.0000000000000003e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  53.29 
 
 
316 aa  325  5e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  48.51 
 
 
303 aa  323  2e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  52.3 
 
 
316 aa  323  2e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  52.63 
 
 
316 aa  323  2e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  52.63 
 
 
316 aa  323  2e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  52.3 
 
 
316 aa  322  4e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  52.3 
 
 
316 aa  322  4e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1599  ornithine carbamoyltransferase  55.12 
 
 
312 aa  322  5e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0323  ornithine carbamoyltransferase  51.18 
 
 
309 aa  320  9.999999999999999e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  52.3 
 
 
316 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  51.97 
 
 
316 aa  319  3e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1497  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 
297 aa  317  1e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.651165  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  48.18 
 
 
303 aa  318  1e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0340  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 
304 aa  317  1e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0354  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 
304 aa  317  1e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.140894  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1572  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 
304 aa  317  2e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.951096 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2825  ornithine carbamoyltransferase  50.66 
 
 
316 aa  316  3e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3961  ornithine carbamoyltransferase  51.32 
 
 
316 aa  316  3e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000564713  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 
355 aa  315  5e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 
301 aa  313  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1054  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 
304 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  48.31 
 
 
304 aa  311  1e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  48.67 
 
 
306 aa  311  1e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 
312 aa  311  1e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  48.49 
 
 
300 aa  311  1e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 
298 aa  310  2e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  48.83 
 
 
302 aa  309  2.9999999999999997e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  51.31 
 
 
304 aa  309  4e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  49 
 
 
303 aa  307  2.0000000000000002e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0479  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
306 aa  306  3e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.133467  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1234  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 
304 aa  305  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.011055  normal  0.156338 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  49.15 
 
 
307 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2339  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 
309 aa  305  8.000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.235287  hitchhiker  0.00582642 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  48.87 
 
 
313 aa  305  8.000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1819  ornithine carbamoyltransferase  48.84 
 
 
323 aa  304  1.0000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0182  ornithine carbamoyltransferase  47.21 
 
 
305 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.533049  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0794  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 
313 aa  301  7.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1323  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 
306 aa  301  9e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.46051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2405  ornithine carbamoyltransferase  48.23 
 
 
313 aa  300  2e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.324681  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1323  ornithine carbamoyltransferase  48.03 
 
 
338 aa  300  2e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  47.3 
 
 
304 aa  299  3e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0777  ornithine carbamoyltransferase  47 
 
 
296 aa  300  3e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.500854 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1461  ornithine carbamoyltransferase  46.33 
 
 
305 aa  298  6e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0246  ornithine carbamoyltransferase  47.46 
 
 
298 aa  297  1e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2197  ornithine carbamoyltransferase  46.71 
 
 
306 aa  296  4e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0957  ornithine carbamoyltransferase  45.67 
 
 
307 aa  295  5e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  48.14 
 
 
305 aa  294  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4333  ornithine carbamoyltransferase  47.3 
 
 
306 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2685  ornithine carbamoyltransferase  46.71 
 
 
309 aa  293  2e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.570167  normal  0.0624155 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0926  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 
318 aa  293  2e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.565714 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  47.8 
 
 
305 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  45.42 
 
 
321 aa  293  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  45.95 
 
 
306 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0157  ornithine carbamoyltransferase  47.35 
 
 
304 aa  292  4e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000760007  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  45.67 
 
 
300 aa  292  5e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1248  ornithine carbamoyltransferase  48.52 
 
 
338 aa  291  7e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1120  ornithine carbamoyltransferase  46.96 
 
 
306 aa  291  9e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105458  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1079  ornithine carbamoyltransferase  46.62 
 
 
306 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4164  ornithine carbamoyltransferase  47.46 
 
 
306 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1046  ornithine carbamoyltransferase  47.19 
 
 
330 aa  291  1e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2611  ornithine carbamoyltransferase  48.32 
 
 
299 aa  290  2e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.183412  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0885  ornithine carbamoyltransferase  48.68 
 
 
305 aa  290  3e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00577741  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1259  ornithine carbamoyltransferase  47.54 
 
 
312 aa  289  3e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0413416 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  47.46 
 
 
306 aa  289  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0397  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 
304 aa  289  4e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0463662 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1176  ornithine carbamoyltransferase  48.18 
 
 
311 aa  289  4e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1203  ornithine carbamoyltransferase  48.18 
 
 
317 aa  288  8e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0366728  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  44.75 
 
 
303 aa  288  8e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0775  ornithine carbamoyltransferase  46.03 
 
 
334 aa  288  9e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.592297  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2514  ornithine carbamoyltransferase  47.68 
 
 
305 aa  288  9e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0008  ornithine carbamoyltransferase  46.46 
 
 
302 aa  288  9e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>