More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3430 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  74.55 
 
 
448 aa  704    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3430  potassium transporter peripheral membrane component  100 
 
 
448 aa  900    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0375932  normal  0.146617 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1310  potassium transporter peripheral membrane component  61.38 
 
 
444 aa  569  1e-161  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  38.05 
 
 
449 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0819  potassium transporter peripheral membrane component  38.17 
 
 
437 aa  291  2e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  36.76 
 
 
445 aa  291  2e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  35.7 
 
 
450 aa  287  2.9999999999999996e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  36.73 
 
 
450 aa  285  8e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2030  potassium transporter peripheral membrane component  36.06 
 
 
465 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0693486  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1970  potassium transporter peripheral membrane component  35.54 
 
 
453 aa  274  3e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.616677  normal  0.0915611 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3218  potassium transporter peripheral membrane component  34.14 
 
 
454 aa  268  1e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.715113  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0734  TrkA-N domain protein  33.85 
 
 
450 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0699  TrkA-N domain protein  33.56 
 
 
444 aa  261  1e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2085  TrkA-N domain protein  33.48 
 
 
444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1877  potassium transporter peripheral membrane component  33.18 
 
 
445 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.113601 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1186  potassium transporter peripheral membrane component  33.41 
 
 
445 aa  254  3e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.596494  decreased coverage  0.00000028569 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2479  TrkA-N domain protein  32.05 
 
 
445 aa  245  9.999999999999999e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1209  potassium transporter peripheral membrane component  33.85 
 
 
448 aa  239  5.999999999999999e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356485  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  31.42 
 
 
443 aa  237  3e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2455  potassium transporter peripheral membrane component  32.67 
 
 
452 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.341783  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  31.22 
 
 
458 aa  236  6e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5096  TrkA-N domain protein  30.92 
 
 
448 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4126  potassium transporter peripheral membrane component  30.57 
 
 
458 aa  228  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.215607  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3606  potassium transporter peripheral membrane component  31.82 
 
 
458 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4082  potassium transporter peripheral membrane component  31.7 
 
 
467 aa  228  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3678  potassium transporter peripheral membrane component  31.82 
 
 
458 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3605  potassium transporter peripheral membrane component  31.82 
 
 
458 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267887  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3713  potassium transporter peripheral membrane component  31.82 
 
 
458 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.461523 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3776  potassium transporter peripheral membrane component  31.82 
 
 
458 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03140  potassium transporter peripheral membrane component  31.82 
 
 
458 aa  227  3e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.946548  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0424  TrkA-N domain protein  31.82 
 
 
458 aa  227  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0424  potassium transporter peripheral membrane component  31.82 
 
 
458 aa  227  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000421391 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3585  potassium transporter peripheral membrane component  31.82 
 
 
458 aa  227  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.931761  normal  0.13042 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3483  potassium transporter peripheral membrane component  31.82 
 
 
458 aa  227  3e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0624843  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3674  potassium transporter peripheral membrane component  31.82 
 
 
458 aa  227  3e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4612  potassium transporter peripheral membrane component  31.82 
 
 
458 aa  227  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00524775  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3772  potassium transporter peripheral membrane component  31.82 
 
 
458 aa  227  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.241443  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03091  hypothetical protein  31.82 
 
 
458 aa  227  3e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4396  potassium transporter peripheral membrane component  32.83 
 
 
458 aa  227  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0641614  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3721  potassium transporter peripheral membrane component  31.82 
 
 
458 aa  225  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.455601  hitchhiker  0.00773793 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1491  potassium transporter peripheral membrane component  30.35 
 
 
458 aa  223  6e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2841  potassium transporter peripheral membrane component  30.35 
 
 
458 aa  222  8e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340173  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1453  potassium transporter peripheral membrane component  30.35 
 
 
458 aa  222  8e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.687964  normal  0.06884 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1041  TrkA domain-containing protein  31.95 
 
 
452 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0020  potassium transporter peripheral membrane component  32.03 
 
 
457 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0201  potassium transporter peripheral membrane component  31 
 
 
457 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0211158  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  31.45 
 
 
458 aa  221  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1615  potassium transporter peripheral membrane component  31.88 
 
 
458 aa  220  3e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002054  Trk system potassium uptake protein TrkA  31.3 
 
 
458 aa  219  5e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  32.1 
 
 
458 aa  219  7.999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1469  TrkA-N domain protein  32.96 
 
 
454 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1062  TrkA-N domain-containing protein  30.97 
 
 
445 aa  219  8.999999999999998e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.121384  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3792  potassium transporter peripheral membrane component  31.89 
 
 
458 aa  219  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2242  potassium transporter peripheral membrane component  31.88 
 
 
458 aa  218  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0521644  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0769  TrkA-N domain protein  30.18 
 
 
445 aa  216  4e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.601936 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1681  potassium transporter peripheral membrane component  31.29 
 
 
458 aa  217  4e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0353  potassium transporter peripheral membrane component  31.24 
 
 
458 aa  216  5e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1093  potassium transporter peripheral membrane component  30.57 
 
 
458 aa  216  7e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1072  potassium transporter peripheral membrane component  30.35 
 
 
458 aa  216  8e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3971  potassium transporter peripheral membrane component  31.67 
 
 
458 aa  215  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0755481  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3885  potassium transporter peripheral membrane component  31.82 
 
 
458 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0054195  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0612  potassium transporter peripheral membrane component  31.82 
 
 
458 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0369792  normal  0.0559785 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0313  potassium transporter peripheral membrane component  31.82 
 
 
458 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.888467  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0030  potassium transporter peripheral membrane component  29.81 
 
 
454 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0081  potassium transporter peripheral membrane component  31.45 
 
 
458 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0187  potassium transporter peripheral membrane component  30.26 
 
 
465 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2209  potassium transporter peripheral membrane component  30.57 
 
 
458 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00394  potassium transporter peripheral membrane component  31.24 
 
 
458 aa  213  4.9999999999999996e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_29  cation transport protein, Trk system  29.59 
 
 
454 aa  213  5.999999999999999e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1114  potassium transporter peripheral membrane component  30.13 
 
 
458 aa  212  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1569  potassium transporter peripheral membrane component  29.91 
 
 
458 aa  212  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0202479  normal  0.0449671 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  31.09 
 
 
459 aa  212  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0017  potassium transporter peripheral membrane component  30.07 
 
 
457 aa  210  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  30.07 
 
 
457 aa  209  6e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0018  potassium transporter peripheral membrane component  30.77 
 
 
477 aa  209  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.265003  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2622  potassium transporter peripheral membrane component  30.87 
 
 
458 aa  207  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.637696 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0072  potassium transporter peripheral membrane component  31.02 
 
 
458 aa  206  6e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2476  potassium transporter peripheral membrane component  30.43 
 
 
458 aa  206  8e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0032  potassium transporter peripheral membrane component  31.43 
 
 
469 aa  206  8e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0670474 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  29.78 
 
 
458 aa  206  8e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  28.76 
 
 
457 aa  206  8e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0312  potassium transporter peripheral membrane component  29.76 
 
 
449 aa  206  1e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0720169  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5999  potassium transporter peripheral membrane component  30 
 
 
485 aa  205  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0135992 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0029  potassium transporter peripheral membrane component  29.31 
 
 
454 aa  205  2e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3673  TrkA-N domain protein  29.06 
 
 
444 aa  204  3e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728396  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1590  potassium transporter peripheral membrane component  28.7 
 
 
449 aa  203  4e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00906485  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0081  potassium transporter peripheral membrane component  29.63 
 
 
457 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685696  normal  0.107342 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0038  potassium transporter peripheral membrane component  31.17 
 
 
458 aa  203  4e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0028  potassium transporter peripheral membrane component  31.85 
 
 
469 aa  203  4e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0017  potassium transporter peripheral membrane component  29.78 
 
 
458 aa  202  8e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3261  potassium transporter peripheral membrane component  29.55 
 
 
484 aa  202  9e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.386779  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0065  potassium transporter peripheral membrane component  29.41 
 
 
457 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948816  unclonable  0.000000448887 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0016  potassium transporter peripheral membrane component  29.13 
 
 
457 aa  202  9e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3912  potassium transporter peripheral membrane component  29.55 
 
 
484 aa  202  9e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00140  potassium transporter peripheral membrane component  30 
 
 
457 aa  202  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35944  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0026  potassium transporter peripheral membrane component  31.63 
 
 
469 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.570638  hitchhiker  0.00237688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0024  potassium transporter peripheral membrane component  31.63 
 
 
469 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.738729  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0032  potassium transporter peripheral membrane component  31.63 
 
 
469 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.21174  hitchhiker  0.00000689203 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0040  potassium transporter peripheral membrane component  29.3 
 
 
467 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0081  potassium transporter peripheral membrane component  29.41 
 
 
457 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  hitchhiker  0.0000000000177319 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>