33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3383 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3383  30S ribosomal protein S6e  100 
 
 		 139 aa  277  4e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000095126  normal  0.0185484 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0224  30S ribosomal protein S6e  59.56 
 
 		 135 aa  159  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.508946  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0802  Ribosomal protein S6e  51.24 
 
 		 129 aa  131  1.9999999999999998e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0670  ribosomal protein S6e  55 
 
 		 131 aa  130  7.999999999999999e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0127674  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0462  30S ribosomal protein S6e  48.48 
 
 		 132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.206866  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2295  30S ribosomal protein S6e  47.58 
 
 		 143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0522  30S ribosomal protein S6e  51.28 
 
 		 118 aa  124  5e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0338  30S ribosomal protein S6e  49.19 
 
 		 132 aa  123  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.437813 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0200  30S ribosomal protein S6e  49.6 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101575  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2488  30S ribosomal protein S6e  50.83 
 
 		 135 aa  121  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0383  30S ribosomal protein S6e  53.51 
 
 		 124 aa  121  4e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0454  30S ribosomal protein S6e  52.63 
 
 		 124 aa  120  7e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1519  30S ribosomal protein S6e  50.78 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.371322  normal  0.814112 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1465  30S ribosomal protein S6e  52.21 
 
 		 124 aa  118  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0255  Ribosomal protein S6e  44.8 
 
 		 130 aa  117  6e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.472307  hitchhiker  0.00887394 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3407  Ribosomal protein S6e  45.45 
 
 		 134 aa  116  9e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1318  Ribosomal protein S6e  44.44 
 
 		 134 aa  110  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0937  30S ribosomal protein S6e  37.1 
 
 		 127 aa  110  7.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2128  Ribosomal protein S6e  43.86 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.864621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0422  ribosomal protein S6e  45.95 
 
 		 131 aa  100  5e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0071  30S ribosomal protein S6e  41.73 
 
 		 137 aa  97.8  4e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0626  30S ribosomal protein S6e  43.22 
 
 		 148 aa  88.2  3e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.798108  normal  0.959135 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1589  30S ribosomal protein S6e  43.22 
 
 		 148 aa  87.4  5e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.416866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0134  30S ribosomal protein S6e  38.98 
 
 		 150 aa  85.5  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0618  30S ribosomal protein S6e  43.22 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.407123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0821  30S ribosomal protein S6e  40.68 
 
 		 151 aa  84  6e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1388  Ribosomal protein S6e  42 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2244  30S ribosomal protein S6e  40.4 
 
 		 212 aa  77  0.00000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.587547  hitchhiker  0.00206613 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_85801  ribosomal protein S6A (S10A) (rp9) (YS4)  33.08 
 
 		 236 aa  63.5  0.0000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.950125  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02780  40s ribosomal protein s6-b, putative  33.85 
 
 		 237 aa  57.4  0.00000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18559  predicted protein  28.46 
 
 		 245 aa  54.3  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0884469  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01964  40S ribosomal protein S6 (AFU_orthologue; AFUA_4G10800)  33.08 
 
 		 237 aa  45.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2296  hypothetical protein  44.44 
 
 		 75 aa  45.1  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>