249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3353 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3353  flavoprotein A  100 
 
 
403 aa  824  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00104416  normal  0.102932 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2383  beta-lactamase-like protein  53.79 
 
 
404 aa  452  1e-126  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3253  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.09 
 
 
397 aa  392  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2654  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.55 
 
 
396 aa  382  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1287  Beta-lactamase-like  46.35 
 
 
399 aa  373  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  7.05459e-05 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2795  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  46.45 
 
 
395 aa  366  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.7389e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  45.62 
 
 
387 aa  363  2e-99  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2265  beta-lactamase domain protein  46.23 
 
 
407 aa  363  3e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3243  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  45.94 
 
 
404 aa  362  6e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.39456  hitchhiker  8.71777e-05 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  43.11 
 
 
392 aa  360  3e-98  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0432  beta-lactamase domain-containing protein  47.24 
 
 
404 aa  357  2e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.253728  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2821  beta-lactamase domain-containing protein  43.91 
 
 
404 aa  357  2e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  5.96505e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0482  beta-lactamase domain-containing protein  47.8 
 
 
387 aa  356  5e-97  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1509  beta-lactamase domain-containing protein  44.85 
 
 
387 aa  356  5e-97  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0425  beta-lactamase domain-containing protein  45.36 
 
 
387 aa  355  8e-97  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22500  beta-lactamase domain protein  47.01 
 
 
391 aa  355  1e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  4.16658e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3294  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  44.67 
 
 
404 aa  353  4e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2516  beta-lactamase domain protein  41.21 
 
 
405 aa  344  1e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.264357  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0202  beta-lactamase domain-containing protein  41.03 
 
 
402 aa  343  2e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0138  beta-lactamase domain protein  42.61 
 
 
401 aa  344  2e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.392817 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3195  rubredoxin-oxygen oxidoreductase  40.05 
 
 
418 aa  344  2e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00034081  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0262  beta-lactamase domain-containing protein  45.01 
 
 
387 aa  343  3e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2479  beta-lactamase domain protein  40.71 
 
 
402 aa  340  3e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1153  beta-lactamase domain-containing protein  46.12 
 
 
405 aa  330  2e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.187317  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0012  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.61 
 
 
400 aa  326  4e-88  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.143481  normal  0.0465587 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2480  beta-lactamase domain protein  42.75 
 
 
394 aa  325  6e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.877522  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1187  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  42.53 
 
 
396 aa  325  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.11538e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0063  beta-lactamase domain protein  40.85 
 
 
400 aa  323  3e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2012  beta-lactamase domain protein  38.5 
 
 
402 aa  317  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  1.25952e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0386  beta-lactamase domain-containing protein  43 
 
 
407 aa  311  2e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.458991 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2871  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  40 
 
 
397 aa  308  2e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.36277e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0457  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.7 
 
 
406 aa  306  5e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3642  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  39.59 
 
 
392 aa  304  2e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0450  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.47 
 
 
407 aa  302  6e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1203  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  38.75 
 
 
405 aa  296  4e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2180  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  38.85 
 
 
397 aa  295  7e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0456  beta-lactamase domain-containing protein  42.54 
 
 
407 aa  295  1e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1021  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  39.14 
 
 
505 aa  295  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.527208  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3699  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  39.85 
 
 
402 aa  294  2e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3260  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  38.99 
 
 
494 aa  294  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0437217  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4053  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  39.24 
 
 
498 aa  290  3e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001301  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  38.31 
 
 
500 aa  290  4e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.410803  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3652  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  37.88 
 
 
493 aa  288  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1581  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  37.66 
 
 
401 aa  288  2e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2199  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  38.99 
 
 
499 aa  286  5e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3033  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  38.99 
 
 
485 aa  286  5e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.583429  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2846  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  38.42 
 
 
479 aa  285  1e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02560  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  38.42 
 
 
479 aa  285  1e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.54657  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2994  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  38.42 
 
 
479 aa  285  1e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2833  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  38.42 
 
 
479 aa  285  1e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0125184 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  38.42 
 
 
479 aa  285  1e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02525  hypothetical protein  38.42 
 
 
479 aa  285  1e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459726  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0784  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  38.99 
 
 
503 aa  285  1e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1583  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  38.13 
 
 
504 aa  284  2e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.652829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0979  beta-lactamase domain protein  38.17 
 
 
479 aa  283  4e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00228257  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1002  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  38.17 
 
 
479 aa  283  4e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0118173  hitchhiker  0.000199326 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1554  beta-lactamase-like  41.5 
 
 
410 aa  282  9e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0457538  normal  0.358726 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3167  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  38.17 
 
 
479 aa  281  1e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3182  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  37.66 
 
 
482 aa  279  5e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3026  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  37.4 
 
 
479 aa  279  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  6.35155e-06 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0955  beta-lactamase domain-containing protein  41.09 
 
 
409 aa  278  9e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.86403  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3042  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  37.4 
 
 
479 aa  278  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0301118 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  37.69 
 
 
479 aa  278  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2991  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  37.4 
 
 
479 aa  278  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2942  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  36.27 
 
 
397 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0065497  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0321  beta-lactamase domain protein  38.58 
 
 
396 aa  277  2e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0944004  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3149  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  37.15 
 
 
479 aa  275  1e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.540983  normal  0.0409708 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2179  flavodoxin  37.88 
 
 
393 aa  263  3e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.438585  normal  0.181254 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1198  beta-lactamase domain-containing protein  40.77 
 
 
384 aa  263  4e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.523487  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  37.44 
 
 
397 aa  256  7e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.25791e-05  hitchhiker  6.1463e-07 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0876  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.17 
 
 
394 aa  239  8e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  3.51493e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0005  beta-lactamase domain protein  33.92 
 
 
407 aa  239  9e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1933  beta-lactamase domain-containing protein  38.89 
 
 
396 aa  238  1e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.837392  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  35.96 
 
 
400 aa  236  5e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  34.91 
 
 
396 aa  235  9e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.65819e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1451  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  35.26 
 
 
423 aa  234  2e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  34.52 
 
 
508 aa  233  5e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0004  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  33.25 
 
 
407 aa  232  7e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.351849  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  34.51 
 
 
884 aa  232  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0006  beta-lactamase domain protein  32.83 
 
 
425 aa  228  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0795  beta-lactamase-like  35.93 
 
 
395 aa  227  3e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0893314  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0371  beta-lactamase domain-containing protein  32.75 
 
 
395 aa  226  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.74578e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0005  beta-lactamase domain protein  32.92 
 
 
407 aa  226  4e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3191  hypothetical protein  33.5 
 
 
431 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1770  beta-lactamase domain protein  36.62 
 
 
393 aa  225  1e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3930  beta-lactamase domain-containing protein  34.01 
 
 
421 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452663  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2008  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  32.91 
 
 
407 aa  224  2e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0339  beta-lactamase domain-containing protein  34.57 
 
 
396 aa  221  1e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000206565  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  35.26 
 
 
399 aa  221  2e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  35.26 
 
 
399 aa  220  4e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3191  flavodoxin  33.59 
 
 
409 aa  220  4e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0415851  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0168  beta-lactamase domain protein  33.5 
 
 
395 aa  219  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000343113 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0026  beta-lactamase domain-containing protein  33.92 
 
 
407 aa  216  6e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2086  beta-lactamase domain-containing protein  36.83 
 
 
394 aa  216  7e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  33.33 
 
 
878 aa  214  2e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0005  beta-lactamase domain protein  30.81 
 
 
407 aa  214  2e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  33.33 
 
 
878 aa  214  3e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0186  beta-lactamase domain protein  33.58 
 
 
395 aa  214  3e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.617182  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1920  beta-lactamase domain protein  35.69 
 
 
393 aa  211  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1413  beta-lactamase domain-containing protein  35.31 
 
 
392 aa  210  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>