More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3349 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  100 
 
 
188 aa  390  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  64.17 
 
 
188 aa  261  6e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  64.52 
 
 
190 aa  254  6e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  65.05 
 
 
194 aa  254  7e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  62.03 
 
 
189 aa  251  4e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  60.75 
 
 
192 aa  251  4e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  60.43 
 
 
189 aa  248  5e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  60.75 
 
 
191 aa  245  2e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  59.36 
 
 
190 aa  246  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  4.23527e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  59.36 
 
 
189 aa  246  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  58.06 
 
 
200 aa  244  6e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  5.00824e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  60.43 
 
 
189 aa  241  4e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  60.22 
 
 
190 aa  240  1e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  57.22 
 
 
190 aa  240  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  57.75 
 
 
189 aa  233  2e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0187  flavoredoxin  58.6 
 
 
190 aa  229  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871882  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  56.99 
 
 
190 aa  228  3e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  52.15 
 
 
189 aa  212  2e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  49.19 
 
 
189 aa  201  5e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  50 
 
 
195 aa  201  5e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  39.11 
 
 
209 aa  142  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  41.94 
 
 
186 aa  140  1e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  38.42 
 
 
216 aa  137  8e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  7.09652e-06 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25740  conserved protein of DIM6/NTAB family  39.46 
 
 
187 aa  136  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.5 
 
 
186 aa  133  2e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.64 
 
 
195 aa  126  2e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00650  conserved protein of DIM6/NTAB family  32.97 
 
 
194 aa  125  3e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  38.32 
 
 
200 aa  121  7e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0678  flavoredoxin  41.62 
 
 
184 aa  120  2e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.616599 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1555  flavin reductase domain-containing protein  36.02 
 
 
186 aa  114  7e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0995  hypothetical protein  35 
 
 
185 aa  110  1e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418174  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.33 
 
 
186 aa  108  4e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  4.89831e-08 
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  33.89 
 
 
195 aa  107  7e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0249  flavoredoxin, putative  32.26 
 
 
187 aa  104  7e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  3.03002e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.89 
 
 
186 aa  103  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  32.78 
 
 
189 aa  101  7e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  33.33 
 
 
192 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  33.33 
 
 
192 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0437  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.76 
 
 
185 aa  89.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.49 
 
 
215 aa  90.1  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0883  hypothetical protein  32.14 
 
 
165 aa  81.3  9e-15  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0253557  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1592  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  29.82 
 
 
193 aa  80.5  1e-14  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.96 
 
 
197 aa  78.2  7e-14  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1752  flavin reductase domain-containing protein  31.25 
 
 
152 aa  76.3  2e-13  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.503981  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  30 
 
 
185 aa  76.3  3e-13  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2559  hypothetical protein  26.4 
 
 
183 aa  72.4  3e-12  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  29.92 
 
 
176 aa  69.7  2e-11  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1253  flavin reductase-like, FMN-binding protein  31.17 
 
 
164 aa  68.2  6e-11  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.516374  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11280  putative flavoredoxin  31.65 
 
 
168 aa  67  2e-10  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00035262  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  32.03 
 
 
177 aa  66.6  2e-10  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2530  hypothetical protein  37.14 
 
 
169 aa  65.9  3e-10  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0339415  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  28.39 
 
 
204 aa  65.5  4e-10  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00640  conserved protein of DIM6/NTAB family  36.89 
 
 
171 aa  64.7  7e-10  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  24.85 
 
 
212 aa  63.9  1e-09  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.13 
 
 
176 aa  64.3  1e-09  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0762  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.19 
 
 
203 aa  63.5  1e-09  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  26.47 
 
 
183 aa  64.3  1e-09  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.25 
 
 
160 aa  63.9  1e-09  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  23.7 
 
 
209 aa  63.2  2e-09  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.3 
 
 
189 aa  62.8  3e-09  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3951  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.29 
 
 
168 aa  62.4  4e-09  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00405255 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0792  flavin reductase domain-containing protein  33.85 
 
 
149 aa  62.4  4e-09  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1270  flavin reductase domain-containing protein  29.59 
 
 
181 aa  62  5e-09  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.285703  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  28.06 
 
 
178 aa  61.6  6e-09  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0769  flavin reductase domain-containing protein  33.05 
 
 
149 aa  60.8  1e-08  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2037  hypothetical protein  27.33 
 
 
202 aa  60.1  2e-08  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.902665  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1032  hypothetical protein  30.06 
 
 
203 aa  60.1  2e-08  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.863891  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  25.44 
 
 
207 aa  60.1  2e-08  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5507  hypothetical protein  29.19 
 
 
203 aa  59.3  3e-08  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  6.5263e-08  unclonable  4.40126e-26 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3128  flavin reductase domain-containing protein  27.21 
 
 
185 aa  59.3  3e-08  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5444  hypothetical protein  29.19 
 
 
203 aa  58.9  4e-08  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  28 
 
 
292 aa  58.9  4e-08  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3276  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.97 
 
 
295 aa  58.9  4e-08  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2781  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  26.24 
 
 
167 aa  58.9  5e-08  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.73643e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1230  flavin reductase domain-containing protein  26.99 
 
 
177 aa  58.5  5e-08  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.407466  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  28.79 
 
 
178 aa  58.5  5e-08  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0354  hypothetical protein  30.22 
 
 
159 aa  58.5  6e-08  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  1.26383e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0372  hypothetical protein  30.22 
 
 
157 aa  58.5  6e-08  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0202858  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03932  hypothetical protein  27.78 
 
 
209 aa  58.5  6e-08  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3148  flavin reductase-like, FMN-binding  26.9 
 
 
219 aa  58.2  7e-08  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2205  flavin reductase-like, FMN-binding  29.93 
 
 
162 aa  58.2  8e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.361259  normal  0.347764 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1579  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.43 
 
 
176 aa  57.8  8e-08  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5500  hypothetical protein  29.19 
 
 
203 aa  58.2  8e-08  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  3.71904e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  27.81 
 
 
199 aa  57.8  9e-08  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3293  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  29.68 
 
 
216 aa  57.8  1e-07  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.902968  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0364  nitrilotriacetate monooxygenase component B  27.69 
 
 
205 aa  57.4  1e-07  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0500  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.65 
 
 
294 aa  57.4  1e-07  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4048  hypothetical protein  28.66 
 
 
226 aa  57.4  1e-07  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.293698  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1187  hypothetical protein  29.27 
 
 
180 aa  57.8  1e-07  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0511  hypothetical protein  29.65 
 
 
253 aa  57  1e-07  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140824  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0162  flavin reductase-like protein  28.37 
 
 
167 aa  57  1e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  28.35 
 
 
176 aa  57.4  1e-07  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  31.29 
 
 
203 aa  57.4  1e-07  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0001  flavin reductase domain-containing protein  30.33 
 
 
171 aa  56.6  2e-07  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117623  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1068  hypothetical protein  29.45 
 
 
203 aa  57  2e-07  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5413  hypothetical protein  30.18 
 
 
203 aa  57  2e-07  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.81917e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5120  putative flavin reductase  26.71 
 
 
203 aa  56.6  2e-07  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5171  hypothetical protein  30.18 
 
 
203 aa  57  2e-07  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  5.52892e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  31.62 
 
 
180 aa  57  2e-07  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5565  hypothetical protein  30.18 
 
 
203 aa  57  2e-07  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  2.9994e-10  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>