91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3271 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3271  hypothetical protein  100 
 
 		 705 aa  1439    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401117  normal  0.182114 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0992  McrB domain-containing protein  49.65 
 
 		 587 aa  241  2e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0192465  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4510  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.33 
 
 		 530 aa  196  9e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.842895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1704  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.67 
 
 		 754 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1010  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.57 
 
 		 765 aa  179  2e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000291313  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2403  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  31.6 
 
 		 822 aa  177  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1385  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.75 
 
 		 683 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2660  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  37.24 
 
 		 678 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.928505  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3198  ATPase  39.15 
 
 		 700 aa  171  5e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0922607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1298  ATPase  39.36 
 
 		 999 aa  170  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00022527  normal  0.161034 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3754  ATPase  32.06 
 
 		 805 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3469  hypothetical protein  42.8 
 
 		 851 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0603195  normal  0.212909 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04176  hypothetical protein  36.45 
 
 		 459 aa  162  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04212  5-methylcytosine-specific restriction enzyme McrBC, subunit McrB  36.45 
 
 		 459 aa  162  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0134  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  44.05 
 
 		 662 aa  160  6e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.805752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.14 
 
 		 465 aa  160  7e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1590  AAA_5 ATPase  50.58 
 
 		 834 aa  156  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.85228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0951  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.22 
 
 		 590 aa  154  5.9999999999999996e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.96 
 
 		 502 aa  153  8.999999999999999e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00614825  hitchhiker  0.000290238 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1214  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.39 
 
 		 732 aa  153  1e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.581782 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4532  ATPase  38.5 
 
 		 691 aa  153  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.228072  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0004  hypothetical protein  30.27 
 
 		 845 aa  153  1e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00169415  unclonable  0.0000000310884 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3299  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.32 
 
 		 729 aa  152  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2864  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.48 
 
 		 568 aa  152  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.79325 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0174  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  46.02 
 
 		 603 aa  151  5e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3331  ATPase  37.99 
 
 		 685 aa  150  8e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1282  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.09 
 
 		 421 aa  150  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000106487  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0862  ATPase  36.73 
 
 		 743 aa  148  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445688  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3670  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.95 
 
 		 685 aa  148  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0975  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.73 
 
 		 743 aa  147  9e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0514038 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  35.25 
 
 		 609 aa  146  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  35.25 
 
 		 609 aa  146  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3308  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.67 
 
 		 723 aa  144  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.506634 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4502  ATPase  32.74 
 
 		 734 aa  143  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466398  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0226  endonuclease  30.48 
 
 		 498 aa  141  3e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6961  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.14 
 
 		 626 aa  141  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00535787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3583  ATPase  33.81 
 
 		 539 aa  139  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7438  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  48.08 
 
 		 696 aa  139  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0252  ATPase  30.11 
 
 		 498 aa  137  7.000000000000001e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.712243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3503  AAA_5 ATPase  30.62 
 
 		 666 aa  137  8e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1239  hypothetical protein  44.75 
 
 		 687 aa  136  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.793158  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0880  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  33.22 
 
 		 638 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0193575  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0939  ATPase  36.3 
 
 		 810 aa  136  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77127  unclonable  0.0000328299 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0152  putative McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit  48.32 
 
 		 598 aa  135  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.264336  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0025  ATPase  33.58 
 
 		 629 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2910  ATPase  45.28 
 
 		 900 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4769  ATPase  34.93 
 
 		 899 aa  134  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.361924 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2840  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  33.1 
 
 		 741 aa  134  6e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.241934 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2031  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  32.11 
 
 		 481 aa  132  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0504678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6933  ATPase  34.14 
 
 		 781 aa  132  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7822  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  34.55 
 
 		 698 aa  131  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1980  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  48.94 
 
 		 605 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.221935  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0784  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.07 
 
 		 398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4727  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  45.18 
 
 		 722 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.162949  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  34.41 
 
 		 853 aa  129  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1359  ATPase  40.31 
 
 		 655 aa  129  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4620  ATPase  45.75 
 
 		 862 aa  127  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00433872  decreased coverage  0.0000000142009 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1653  hypothetical protein  40.57 
 
 		 517 aa  125  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0379372  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3725  ATPas  44.08 
 
 		 517 aa  124  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2235  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.83 
 
 		 585 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.89284  hitchhiker  0.0000945382 
 
 
-
 
NC_002950  PG0971  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  41.48 
 
 		 571 aa  112  3e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.361616 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0822  polysulfide reductase chain C (sulfur reductase chain C)  33.49 
 
 		 412 aa  105  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000697352  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2668  ATPase  27.92 
 
 		 303 aa  93.6  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00285802  normal  0.904781 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0536  ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  28.38 
 
 		 653 aa  92  3e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638897 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3008  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.68 
 
 		 449 aa  90.5  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506367 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1909  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.26 
 
 		 795 aa  85.1  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1562  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.39 
 
 		 603 aa  77.8  0.0000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4335  R1.LlaJI  26.75 
 
 		 352 aa  76.6  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0970612  hitchhiker  0.000000213908 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1973  ATPase  28.71 
 
 		 450 aa  72.8  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0978731  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1009  type II restriction-modification system restriction subunit  24.91 
 
 		 513 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.61014e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0817  ATPase  25.79 
 
 		 513 aa  71.6  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11951  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0231  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.17 
 
 		 510 aa  70.9  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0293694 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0700  ATPase  28.1 
 
 		 714 aa  69.7  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1597  ATPase  28.1 
 
 		 714 aa  69.7  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0251124  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0015  putative 5-methylcytosine-specific restriction enzyme B  27.05 
 
 		 597 aa  66.2  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1956  ATPase  27.69 
 
 		 938 aa  65.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512123  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2266  ATPase  32.35 
 
 		 803 aa  62.4  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3352  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.74 
 
 		 748 aa  60.1  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3015  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.86 
 
 		 530 aa  59.3  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0379  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.8 
 
 		 410 aa  59.7  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0958  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.49 
 
 		 651 aa  55.8  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000872782  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0788  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.35 
 
 		 668 aa  50.4  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130676 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1053  ATPase  26.67 
 
 		 523 aa  50.1  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.603764 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0225  conserved hypothetical protein, putative endonuclease  57.5 
 
 		 208 aa  49.3  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.131581  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1024  ATPase  21.97 
 
 		 668 aa  48.1  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1291  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.7 
 
 		 559 aa  46.6  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.902776  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2172  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.01 
 
 		 559 aa  46.6  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1096  hypothetical protein  25.7 
 
 		 844 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0970  ATPase, AAA family  25.14 
 
 		 844 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0069  ATPase  30 
 
 		 475 aa  45.1  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.977375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0045  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  23.28 
 
 		 578 aa  43.9  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207513 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>