33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3268 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3268  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  666    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0855187 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3706  hypothetical protein  57.56 
 
 		 771 aa  358  8e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  51.31 
 
 		 819 aa  301  7.000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  33.24 
 
 		 938 aa  155  7e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  31.2 
 
 		 675 aa  125  9e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  28.49 
 
 		 669 aa  120  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1484  hypothetical protein  28.65 
 
 		 374 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.481166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  33.02 
 
 		 713 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  29.25 
 
 		 581 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2751  cell surface protein  25.82 
 
 		 728 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.270179  hitchhiker  0.0050065 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  32.26 
 
 		 560 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  30.26 
 
 		 960 aa  110  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  29.86 
 
 		 658 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  30.94 
 
 		 1001 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0125  hypothetical protein  29.43 
 
 		 379 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00889143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  26.61 
 
 		 971 aa  96.7  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3324  hypothetical protein  28.95 
 
 		 324 aa  95.9  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0125921  normal  0.0119157 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3727  hypothetical protein  28.21 
 
 		 331 aa  90.9  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0834  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like  24.32 
 
 		 1202 aa  90.5  4e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00874286  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1578  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  29.19 
 
 		 448 aa  86.3  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.486208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  26.02 
 
 		 679 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  26.45 
 
 		 685 aa  74.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0597  hypothetical protein  24.56 
 
 		 815 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  23.19 
 
 		 769 aa  67  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  24.84 
 
 		 403 aa  63.5  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  26.71 
 
 		 996 aa  61.6  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2440  PKD  23.97 
 
 		 1042 aa  58.9  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120372  normal  0.562563 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  23.6 
 
 		 1361 aa  57.4  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0494  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  27.67 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  22.81 
 
 		 1279 aa  57  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3623  hypothetical protein  28.02 
 
 		 514 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  54.29 
 
 		 810 aa  46.2  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0492  hypothetical protein  26.47 
 
 		 195 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.652654  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>