More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3242 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3242  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  100 
 
 		 258 aa  532  1e-150  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0851525 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2145  exodeoxyribonuclease III  61.54 
 
 		 251 aa  341  5e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0441  exodeoxyribonuclease III (xth)  51.72 
 
 		 264 aa  287  1e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0174  exodeoxyribonuclease III  52.19 
 
 		 253 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.100757  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0353  exodeoxyribonuclease III Xth  52.19 
 
 		 255 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.740813  normal  0.996047 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0823  exodeoxyribonuclease III  51.59 
 
 		 255 aa  284  1.0000000000000001e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1247  exodeoxyribonuclease III Xth  52 
 
 		 255 aa  284  1.0000000000000001e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0130  exodeoxyribonuclease III  53.73 
 
 		 257 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1064  exodeoxyribonuclease III  50.79 
 
 		 255 aa  280  1e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0288989 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0551  exodeoxyribonuclease III  51.19 
 
 		 336 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2558  exodeoxyribonuclease III  52.16 
 
 		 262 aa  268  5e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1258  exodeoxyribonuclease III Xth  49.01 
 
 		 257 aa  266  2e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1734  exodeoxyribonuclease III  49.01 
 
 		 256 aa  266  2.9999999999999995e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00350824  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0541  exodeoxyribonuclease III  52.36 
 
 		 254 aa  265  5.999999999999999e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.50716  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0377  exodeoxyribonuclease III Xth  49.2 
 
 		 255 aa  264  1e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0269  exodeoxyribonuclease III  48.4 
 
 		 254 aa  261  6.999999999999999e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0832  exodeoxyribonuclease III Xth  47.62 
 
 		 253 aa  261  1e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808552  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1629  exodeoxyribonuclease III  52.19 
 
 		 251 aa  260  1e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0458  exodeoxyribonuclease III Xth  48.81 
 
 		 251 aa  260  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273086  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0541  exodeoxyribonuclease III  51.2 
 
 		 255 aa  259  2e-68  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.008532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3484  exodeoxyribonuclease III  51.18 
 
 		 252 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.385947  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1210  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  50.42 
 
 		 237 aa  258  5.0000000000000005e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0491626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3584  exodeoxyribonuclease III  51.18 
 
 		 252 aa  258  7e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3750  exodeoxyribonuclease III  51.18 
 
 		 252 aa  258  7e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000021797 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3868  exodeoxyribonuclease III  51.18 
 
 		 252 aa  258  7e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2456  exodeoxyribonuclease III  50.99 
 
 		 259 aa  258  8e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0949  exodeoxyribonuclease III  49.8 
 
 		 251 aa  257  1e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1722  exodeoxyribonuclease III  52.36 
 
 		 252 aa  258  1e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1192  exodeoxyribonuclease III  49.6 
 
 		 250 aa  256  3e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0173462  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3839  exodeoxyribonuclease III  50.39 
 
 		 252 aa  255  4e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1497  exodeoxyribonuclease III Xth  49.21 
 
 		 253 aa  255  4e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0254  exodeoxyribonuclease III Xth  49 
 
 		 249 aa  255  6e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.345857  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3507  exodeoxyribonuclease III Xth  50.79 
 
 		 252 aa  254  7e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122233  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0696  exodeoxyribonuclease III Xth  50 
 
 		 257 aa  254  8e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0151551  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1460  exodeoxyribonuclease III  50 
 
 		 252 aa  254  9e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000456655 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1377  exodeoxyribonuclease III  49.21 
 
 		 250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00689884  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1647  exodeoxyribonuclease III Xth  49.19 
 
 		 249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4586  exodeoxyribonuclease III Xth  47.41 
 
 		 250 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000013952  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1434  exodeoxyribonuclease III Xth  47.22 
 
 		 248 aa  251  6e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0982  exodeoxyribonuclease III  47.62 
 
 		 250 aa  251  7e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1799  exodeoxyribonuclease III  51.78 
 
 		 252 aa  251  1e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.123762  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0582  exodeoxyribonuclease III Xth  47.58 
 
 		 249 aa  249  3e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.24337  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1451  exodeoxyribonuclease III Xth  47.39 
 
 		 254 aa  249  3e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.991336  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3496  exodeoxyribonuclease III  49.61 
 
 		 252 aa  249  4e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181471  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3322  exodeoxyribonuclease III Xth  48.21 
 
 		 253 aa  246  3e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000530541  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0890  exodeoxyribonuclease III Xth  45.82 
 
 		 254 aa  245  4.9999999999999997e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0339  exodeoxyribonuclease III Xth  46.61 
 
 		 257 aa  244  6.999999999999999e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361272  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0282  exodeoxyribonuclease III  50 
 
 		 259 aa  244  6.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0785  exodeoxyribonuclease III Xth  48.79 
 
 		 251 aa  244  9e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0305  exodeoxyribonuclease III  49.61 
 
 		 259 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.859926  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0254  exodeoxyribonuclease III  48.82 
 
 		 259 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3497  exodeoxyribonuclease III  43.2 
 
 		 254 aa  242  3e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0881  exodeoxyribonuclease III Xth  45.49 
 
 		 268 aa  240  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0109  exodeoxyribonuclease III Xth  45.06 
 
 		 261 aa  240  2e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0626468  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01760  exodeoxyribonuclease  44.27 
 
 		 254 aa  239  2e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0045  exodeoxyribonuclease III  48.81 
 
 		 252 aa  240  2e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2986  exodeoxyribonuclease III Xth  45.45 
 
 		 254 aa  239  4e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6423  exodeoxyribonuclease III Xth  40.83 
 
 		 301 aa  235  4e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4271  exodeoxyribonuclease III Xth  44.05 
 
 		 256 aa  235  6e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11640  exodeoxyribonuclease III  42.21 
 
 		 262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0958  exodeoxyribonuclease III Xth  46.43 
 
 		 253 aa  232  3e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0521  exodeoxyribonuclease III Xth  42.46 
 
 		 254 aa  232  5e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000060728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0089  exodeoxyribonuclease III  48.43 
 
 		 252 aa  228  5e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0647861  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2415  exodeoxyribonuclease III Xth  42.52 
 
 		 270 aa  226  2e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0194  AP endonuclease  42.69 
 
 		 258 aa  224  9e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0120  exodeoxyribonuclease III Xth  39.86 
 
 		 285 aa  224  1e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0321  exodeoxyribonuclease III  42.29 
 
 		 257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.323864  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0702  hypothetical protein  43.03 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0684  hypothetical protein  43.03 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0224  exodeoxyribonuclease III  41.5 
 
 		 259 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.465844  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2379  exodeoxyribonuclease III  41.9 
 
 		 256 aa  219  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124522  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0186  exodeoxyribonuclease III  41.9 
 
 		 256 aa  219  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0167  exodeoxyribonuclease III  41.9 
 
 		 256 aa  219  5e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.580227  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2299  exodeoxyribonuclease III  41.9 
 
 		 256 aa  219  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.87728  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0371  exodeoxyribonuclease III  41.9 
 
 		 256 aa  219  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6456  exodeoxyribonuclease III xth  41.11 
 
 		 257 aa  219  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0175  exodeoxyribonuclease III  41.9 
 
 		 256 aa  219  5e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2780  exodeoxyribonuclease III  41.9 
 
 		 256 aa  219  5e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0110  exodeoxyribonuclease III Xth  42.91 
 
 		 259 aa  218  7e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0939885 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0149  exodeoxyribonuclease III (xth)  43.08 
 
 		 258 aa  218  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2271  exodeoxyribonuclease III Xth  43.7 
 
 		 252 aa  217  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1689  exonuclease III  39.68 
 
 		 268 aa  216  2e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000145715  hitchhiker  0.000000000000014729 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0151  exodeoxyribonuclease III  41.11 
 
 		 256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0403  exodeoxyribonuclease III  40.08 
 
 		 259 aa  215  5e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3102  exodeoxyribonuclease III Xth  41.11 
 
 		 256 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0350  exodeoxyribonuclease III Xth  41.22 
 
 		 269 aa  215  7e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0362795  normal  0.625114 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1311  exodeoxyribonuclease III Xth  42.57 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0039  exodeoxyribonuclease III Xth  42.23 
 
 		 256 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3160  exodeoxyribonuclease III Xth  40.32 
 
 		 257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0485064  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3043  exodeoxyribonuclease III Xth  40.32 
 
 		 257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0254  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  40.55 
 
 		 259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1784  exodeoxyribonuclease III  39.68 
 
 		 259 aa  212  3.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2008  exodeoxyribonuclease III Xth  40.78 
 
 		 260 aa  212  4.9999999999999996e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1725  exodeoxyribonuclease III Xth  40.78 
 
 		 260 aa  212  4.9999999999999996e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.569641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2491  exodeoxyribonuclease III (xth)  40.32 
 
 		 257 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.510804  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3121  exodeoxyribonuclease III Xth  40.32 
 
 		 257 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3105  exodeoxyribonuclease III Xth  40.32 
 
 		 257 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  40.94 
 
 		 257 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0685  exodeoxyribonuclease III Xth  40 
 
 		 260 aa  211  9e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0057  exodeoxyribonuclease III Xth  40 
 
 		 259 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>