More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3236 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3236  xylene monooxygenase electron transfer component  100 
 
 
232 aa  470  1e-132  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150181  normal  0.120889 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2378  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  48.9 
 
 
232 aa  226  2e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000975827  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1003  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  42.79 
 
 
232 aa  208  5e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0767171 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1085  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  34.91 
 
 
702 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6898  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.76 
 
 
677 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6652  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.5 
 
 
688 aa  132  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640624  normal  0.369043 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.18 
 
 
669 aa  131  9e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.47 
 
 
383 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2468  oxidoreductase FAD-binding region  30.9 
 
 
625 aa  129  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.82591  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2337  hypothetical protein  33.19 
 
 
627 aa  128  9.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00340  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  31.65 
 
 
585 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0195  oxidoreductase  33.62 
 
 
597 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.74 
 
 
585 aa  125  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0093  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  31.9 
 
 
670 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.303734 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1068  oxidoreductase FAD-binding subunit  31 
 
 
384 aa  124  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.570837  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1052  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.76 
 
 
397 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.705726  normal  0.0721497 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3391  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  29.82 
 
 
242 aa  121  9e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00300696  normal  0.0908673 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.74 
 
 
363 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1054  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.74 
 
 
248 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.543826  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4230  FHA domain containing protein  32.5 
 
 
606 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4292  FHA domain containing protein  32.5 
 
 
606 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.168951  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3608  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.07 
 
 
403 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1104  hypothetical protein  31.48 
 
 
234 aa  115  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0241757  normal  0.525247 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1005  oxidoreductase FAD-binding protein  31.96 
 
 
368 aa  115  5e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  31.51 
 
 
379 aa  115  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.04 
 
 
382 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4489  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.61 
 
 
382 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.320814  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5014  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.61 
 
 
382 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240099  normal  0.858048 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4136  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.26 
 
 
367 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1175  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.33 
 
 
371 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3096  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.37 
 
 
387 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.592741  normal  0.0476829 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6856  ferredoxin  31.36 
 
 
381 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0402  iron-sulfur cluster-binding protein  31.17 
 
 
366 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501485  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3291  oxidoreductase FAD-binding region  32.61 
 
 
382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.61 
 
 
382 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.61 
 
 
382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  32.61 
 
 
381 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  32.61 
 
 
380 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  32.61 
 
 
380 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  32.61 
 
 
382 aa  112  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1217  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.86 
 
 
406 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.640214  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4775  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  31.17 
 
 
366 aa  112  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.56 
 
 
375 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2665  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.82 
 
 
396 aa  112  7.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0337  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.44 
 
 
366 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00256748  normal  0.662502 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0316  oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.44 
 
 
368 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.482566  decreased coverage  0.00002417 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.13 
 
 
381 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.17 
 
 
385 aa  111  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4891  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.87 
 
 
390 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0931607  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0702  putative ferredoxin, 2Fe-2S  32.17 
 
 
380 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.54952  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1971  putative ferredoxin, 2Fe-2S  32.17 
 
 
380 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.851205  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4844  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30 
 
 
356 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0431343 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0998  putative ferredoxin, 2Fe-2S  32.17 
 
 
380 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0388253  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1294  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.28 
 
 
388 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  31.74 
 
 
382 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0479  putative ferredoxin, 2Fe-2S  32.17 
 
 
381 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.63 
 
 
375 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0339  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.44 
 
 
366 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0495555  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4303  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  32.4 
 
 
217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.313624  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2831  ferredoxin  29.82 
 
 
358 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0794308  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1070  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.66 
 
 
361 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  30.88 
 
 
605 aa  109  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6200  putative ferredoxin  30.3 
 
 
366 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71420  putative ferredoxin  30.3 
 
 
366 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2520  ferredoxin  31.49 
 
 
366 aa  109  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0569  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.47 
 
 
281 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2913  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.09 
 
 
380 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2831  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.09 
 
 
376 aa  108  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.926186  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1860  iron-sulfur cluster-binding protein  32.17 
 
 
379 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4814  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  32.57 
 
 
386 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.501777  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5215  oxidoreductase FAD-binding region  30.3 
 
 
366 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11132  hitchhiker  0.00973319 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  31.37 
 
 
605 aa  107  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2874  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  31.28 
 
 
447 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5071  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.26 
 
 
414 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407916  hitchhiker  0.00354835 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  31.03 
 
 
662 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3010  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.67 
 
 
380 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.94 
 
 
375 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2855  ferredoxin  31.46 
 
 
394 aa  106  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4030  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  27.66 
 
 
365 aa  106  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1056  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.88 
 
 
374 aa  105  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0816  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  33.18 
 
 
276 aa  104  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.71645  hitchhiker  0.000650415 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1261  ferredoxin  28.15 
 
 
365 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.48547  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2658  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.63 
 
 
272 aa  102  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00198507  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2618  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  28.82 
 
 
340 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5128  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.91 
 
 
351 aa  102  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243235  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1577  putative ferredoxin oxidoreductase protein  31.34 
 
 
418 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2702  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  28.82 
 
 
340 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1166  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.81 
 
 
367 aa  102  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1590  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  28.82 
 
 
352 aa  102  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0935  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.74 
 
 
251 aa  101  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5674  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  28.14 
 
 
332 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0484  ferredoxin  28.45 
 
 
364 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3739  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  32.32 
 
 
419 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1329  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.76 
 
 
277 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1593  putative ferredoxin NAD(+) reductase  25.11 
 
 
332 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655318  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3723  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.18 
 
 
358 aa  100  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1364  iron-sulfur cluster-binding protein  30.23 
 
 
325 aa  99.4  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0896  iron-sulfur cluster-binding protein  28.69 
 
 
356 aa  99.4  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2328  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.05 
 
 
465 aa  99  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0049  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.34 
 
 
453 aa  98.6  8e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.19928  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>