More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3175 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3175  ammonium transporter  100 
 
 
469 aa  929    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.640625  hitchhiker  0.0015046 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0555  ammonium transporter  45.97 
 
 
446 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0551  ammonium transporter  46.53 
 
 
444 aa  372  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.138976  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3492  ammonium transporter  45.92 
 
 
461 aa  368  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3791  ammonium transporter  47.76 
 
 
468 aa  369  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2528  ammonium transporter  46.1 
 
 
461 aa  354  2e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.26052  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2435  ammonium transporter  48.3 
 
 
471 aa  350  3e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.127565  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3049  ammonium transporter  45.67 
 
 
460 aa  344  1e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2984  ammonium transporter  47.91 
 
 
478 aa  343  4e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1902  ammonium transporter  47.91 
 
 
478 aa  343  5e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388203  hitchhiker  0.000364558 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0532  ammonium transporter  42.33 
 
 
435 aa  340  2e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000756367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0518  ammonium transporter  42.33 
 
 
435 aa  340  2e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000597851  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0486  ammonium transporter  47.59 
 
 
483 aa  334  2e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0113  ammonium transporter  46.56 
 
 
458 aa  333  5e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1229  ammonium transporter  40.66 
 
 
515 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1259  ammonium transporter  40.66 
 
 
515 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150003 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4312  ammonium transporter  40.59 
 
 
506 aa  330  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1018  ammonium transporter  43.19 
 
 
445 aa  329  6e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00157851  normal  0.490999 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1022  ammonium transporter  45.81 
 
 
449 aa  329  8e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0782  ammonium transporter  42.24 
 
 
511 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2955  ammonium transporter  39.01 
 
 
518 aa  323  4e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3305  ammonium transporter  44.06 
 
 
408 aa  321  1.9999999999999998e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.508137  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0442  ammonium transporter  41.76 
 
 
497 aa  312  7.999999999999999e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.757816 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3023  ammonium transporter  40.46 
 
 
525 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1796  ammonium transporter  42.3 
 
 
441 aa  310  5e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4446  ammonium transporter  41.78 
 
 
541 aa  306  4.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4745  ammonium transporter  40.49 
 
 
514 aa  306  6e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000955224 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0565  ammonium transporter  42.51 
 
 
422 aa  301  1e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000904674  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0499  ammonium transporter  40.13 
 
 
525 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1499  ammonium transporter  41.76 
 
 
584 aa  297  2e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907074  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0210  ammonium transporter  40 
 
 
439 aa  295  9e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1757  ammonium transporter  42.69 
 
 
437 aa  295  9e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.966665 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4247  ammonium transporter  39.36 
 
 
495 aa  293  4e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0572561  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2576  ammonium transporter  39.31 
 
 
433 aa  293  5e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3636  ammonium transporter  41.72 
 
 
509 aa  293  6e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.348655 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2218  ammonium transporter  42.33 
 
 
506 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1729  ammonium transporter  42.55 
 
 
507 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.427726  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02961  ammonium transporter  41.96 
 
 
486 aa  289  7e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02901  ammonium transporter  41.28 
 
 
476 aa  288  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1656  ammonium transporter  42.08 
 
 
507 aa  286  5e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0646033  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2018  ammonium transporter  38.93 
 
 
478 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.678584  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02851  ammonium transporter  41.89 
 
 
486 aa  284  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.64492  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02861  ammonium transporter  41.89 
 
 
486 aa  284  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0916  ammonium transporter  39.05 
 
 
462 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.685309  normal  0.315253 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1639  ammonium transporter  40.63 
 
 
489 aa  282  7.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.294546  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1360  Rh family protein/ammonium transporter  40.67 
 
 
471 aa  282  1e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.11644  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3993  adenylate/guanylate cyclase  40.48 
 
 
1209 aa  281  2e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.787867  normal  0.246996 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3089  ammonium transporter  40.69 
 
 
441 aa  281  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24801  ammonium transporter  42.19 
 
 
482 aa  280  5e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2650  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  40.95 
 
 
1016 aa  280  6e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0326651 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0919  ammonium transporter  40.18 
 
 
481 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.546186  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3988  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  39.1 
 
 
1018 aa  278  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0276  ammonium transporter  41.4 
 
 
489 aa  278  2e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2589  ammonium transporter  41.03 
 
 
409 aa  278  2e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0973  ammonium transporter  38.36 
 
 
441 aa  276  5e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000814045  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1530  ammonium transporter  38.96 
 
 
512 aa  276  6e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.595871  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0265  ammonium transporter  41.03 
 
 
487 aa  274  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  38.79 
 
 
1322 aa  274  3e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0847  Rh family protein/ammonium transporter  41.22 
 
 
416 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105757  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3240  Rh family protein/ammonium transporter  40.27 
 
 
416 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.212447  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03411  ammonium transporter  38.86 
 
 
496 aa  270  4e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1629  ammonium transporter  38.86 
 
 
496 aa  270  4e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0760  ammonium transporter  40.27 
 
 
408 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.33 
 
 
1262 aa  269  7e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03436  hypothetical protein  40.45 
 
 
409 aa  268  1e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4477  ammonium transporter  37.99 
 
 
488 aa  268  1e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341446  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0624  Rh family protein/ammonium transporter  40.04 
 
 
416 aa  268  1e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1341  ammonium transporter  41.46 
 
 
442 aa  267  2.9999999999999995e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000498095  unclonable  0.00000143333 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6567  ammonium transporter  35.91 
 
 
474 aa  267  2.9999999999999995e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.510498 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3361  Rh family protein/ammonium transporter  39.37 
 
 
416 aa  266  5e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0592  Rh family protein/ammonium transporter  39.37 
 
 
416 aa  266  5e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3707  ammonium transporter  39.37 
 
 
416 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00259002  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3649  ammonium transporter  39.37 
 
 
416 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243704  hitchhiker  0.000385246 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0798  ammonium transporter  39.37 
 
 
416 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0469975  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1138  ammonium transporter  40.76 
 
 
442 aa  265  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3531  Rh family protein/ammonium transporter  38.91 
 
 
416 aa  265  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2954  ammonium transporter  38.85 
 
 
488 aa  264  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3831  ammonium transporter  39.37 
 
 
416 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0618394  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0766  ammonium transporter  37.09 
 
 
644 aa  261  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1163  ammonium transporter  39.47 
 
 
441 aa  260  3e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000433758  normal  0.156813 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0834  Rh family protein/ammonium transporter  40.18 
 
 
416 aa  260  3e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.809964  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0663  ammonium transporter  38.17 
 
 
407 aa  260  3e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002573  ammonium transporter  41 
 
 
381 aa  261  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000132513  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3657  ammonium transporter  39.96 
 
 
421 aa  259  6e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28535  Amt family transporter: ammonium  38.62 
 
 
433 aa  259  7e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3571  ammonium transporter  36.31 
 
 
446 aa  259  8e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3120  ammonium transporter  36.89 
 
 
414 aa  259  1e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0260  ammonium transporter  40.18 
 
 
416 aa  256  5e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.647918  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0247  ammonium transporter  38.91 
 
 
490 aa  256  5e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0651  Rh-like protein/ammonium transporter  39.73 
 
 
416 aa  256  5e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.479861  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2248  ammonium transporter  39.81 
 
 
433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0144  ammonium transporter  38.28 
 
 
437 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0980  Rh family protein/ammonium transporter  40.72 
 
 
417 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.7151 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0187  ammonium transporter  39.01 
 
 
452 aa  253  4.0000000000000004e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0642  putative ammonium transporter  38.65 
 
 
426 aa  253  6e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0079  ammonium transporter  37.03 
 
 
416 aa  251  1e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.376757  normal  0.798164 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54981  predicted protein  37.71 
 
 
539 aa  251  2e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0934  Rh family protein/ammonium transporter  40.27 
 
 
416 aa  250  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1500  ammonium transporter  39.51 
 
 
414 aa  250  4e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3599  ammonium transporter  37.75 
 
 
417 aa  250  4e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>