146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3153 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3153  hypothetical protein  100 
 
 		 637 aa  1276    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0308733  normal  0.0661061 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3154  hypothetical protein  62.46 
 
 		 631 aa  735    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.164464  hitchhiker  0.00920589 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2161  Pyrrolo-quinoline quinone  24.32 
 
 		 454 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.905715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2698  putative quinoprotein  24.62 
 
 		 448 aa  81.3  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.578773  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1355  Pyrrolo-quinoline quinone  24.62 
 
 		 454 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  0.026391 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  25.63 
 
 		 407 aa  75.1  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  21.15 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  22.89 
 
 		 1241 aa  68.9  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  22.64 
 
 		 1328 aa  65.1  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  23.48 
 
 		 432 aa  64.7  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0990  Pyrrolo-quinoline quinone  22.92 
 
 		 441 aa  62  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  22.96 
 
 		 795 aa  62.4  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  24.2 
 
 		 652 aa  61.2  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  22.84 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  23.34 
 
 		 463 aa  60.5  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  23.03 
 
 		 475 aa  60.1  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  23.88 
 
 		 382 aa  60.1  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0750  PQQ repeat-containing protein  23.1 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.137969  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1570  Pyrrolo-quinoline quinone  23.83 
 
 		 568 aa  58.5  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0635613  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  22.62 
 
 		 1812 aa  58.5  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  22.16 
 
 		 431 aa  58.2  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  23.12 
 
 		 556 aa  57  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  23.4 
 
 		 653 aa  57  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2190  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  21.25 
 
 		 380 aa  56.6  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3622  Pyrrolo-quinoline quinone  25 
 
 		 422 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  22.29 
 
 		 774 aa  55.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0667  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  20.89 
 
 		 385 aa  55.5  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  32.14 
 
 		 963 aa  54.7  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2355  Pyrrolo-quinoline quinone  26.56 
 
 		 730 aa  53.9  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0680369  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0262  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  33.13 
 
 		 737 aa  53.9  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0206165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  22.11 
 
 		 383 aa  53.5  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3251  serine/threonine protein kinase  25.66 
 
 		 861 aa  53.5  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0225262 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  22.25 
 
 		 384 aa  52.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1314  hypothetical protein  22.19 
 
 		 380 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  22.25 
 
 		 384 aa  52.4  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  21.48 
 
 		 423 aa  51.2  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2083  Pyrrolo-quinoline quinone  21.2 
 
 		 392 aa  50.8  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397286  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14910  hypothetical protein  21.9 
 
 		 380 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  22.84 
 
 		 705 aa  50.8  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2696  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  27.67 
 
 		 726 aa  50.4  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1740  Pyrrolo-quinoline quinone  24.23 
 
 		 451 aa  50.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  23.12 
 
 		 458 aa  50.1  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.549176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  24.33 
 
 		 445 aa  50.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3493  Pyrrolo-quinoline quinone  20.28 
 
 		 461 aa  50.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546086 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40260  YfgL-like phosphoquinolipoprotein kinase  20.5 
 
 		 384 aa  50.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0902958  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  20.34 
 
 		 901 aa  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3085  Pyrrolo-quinoline quinone  20.49 
 
 		 455 aa  49.7  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00761305  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.9 
 
 		 385 aa  49.3  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2870  Pyrrolo-quinoline quinone  23.79 
 
 		 705 aa  49.7  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.489222  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2199  Pyrrolo-quinoline quinone  22.85 
 
 		 447 aa  49.3  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.839815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  21.95 
 
 		 445 aa  49.3  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2202  Pyrrolo-quinoline quinone  24.17 
 
 		 363 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1656  PQQ repeat-containing protein  23.47 
 
 		 363 aa  48.9  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1437  PQQ repeat-containing protein  22.97 
 
 		 384 aa  48.5  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.234341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3110  Pyrrolo-quinoline quinone  25.39 
 
 		 726 aa  48.9  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2290  Pyrrolo-quinoline quinone  24.17 
 
 		 363 aa  48.9  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1288  Pyrrolo-quinoline quinone  23.11 
 
 		 388 aa  48.9  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.38604  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0982  Pyrrolo-quinoline quinone  21.99 
 
 		 437 aa  48.9  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.18795  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  27.18 
 
 		 484 aa  48.5  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  25.1 
 
 		 371 aa  48.5  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0427  Pyrrolo-quinoline quinone  26.56 
 
 		 706 aa  48.5  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.196079 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4972  Pyrrolo-quinoline quinone  23.45 
 
 		 608 aa  48.5  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.779778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1595  putative alcohol dehydrogenase  23.84 
 
 		 561 aa  48.5  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3497  Pyrrolo-quinoline quinone  20.11 
 
 		 379 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  20.93 
 
 		 687 aa  48.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  22.91 
 
 		 395 aa  48.1  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.70821 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2985  PQQ-dependent enzyme-like protein  23.23 
 
 		 618 aa  48.1  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.926915  normal  0.513639 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1741  Pyrrolo-quinoline quinone  22.89 
 
 		 570 aa  48.1  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2251  PQQ enzyme repeat domain protein  22.91 
 
 		 395 aa  48.1  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  25.5 
 
 		 371 aa  48.1  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  23.03 
 
 		 450 aa  48.1  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  24 
 
 		 514 aa  47.8  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0508  PQQ repeat-containing protein  38.18 
 
 		 384 aa  47.8  0.0006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.525334  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1130  Pyrrolo-quinoline quinone  21.07 
 
 		 389 aa  47.8  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1875  Pyrrolo-quinoline quinone  21.94 
 
 		 381 aa  47.8  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.210661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5502  putative alcohol dehydrogenase  24.33 
 
 		 712 aa  47.8  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.210225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1466  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  24.24 
 
 		 381 aa  47.8  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2497  Pyrrolo-quinoline quinone  19.6 
 
 		 475 aa  47.8  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1417  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  23.71 
 
 		 386 aa  47.8  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0124773 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  19.79 
 
 		 392 aa  47.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3125  Pyrrolo-quinoline quinone  22.37 
 
 		 444 aa  47.4  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.687826 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  22.01 
 
 		 365 aa  47.4  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  19.82 
 
 		 616 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  23.75 
 
 		 396 aa  46.6  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  23.56 
 
 		 797 aa  47  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2426  Pyrrolo-quinoline quinone  30.92 
 
 		 440 aa  46.6  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1500  Pyrrolo-quinoline quinone  24.86 
 
 		 407 aa  46.6  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0717216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1441  Pyrrolo-quinoline quinone  22.73 
 
 		 708 aa  47  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121309 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3352  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  27.67 
 
 		 707 aa  46.6  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32899  normal  0.291074 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2046  hypothetical protein  21.1 
 
 		 400 aa  46.6  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500116  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3601  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  28.3 
 
 		 724 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05630  FOG: WD40-like repeat  22.62 
 
 		 475 aa  47  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.687981  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1342  putative lipoprotein  24.16 
 
 		 381 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2351  PQQ repeat-containing protein  24.16 
 
 		 381 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5302  Pyrrolo-quinoline quinone  27.33 
 
 		 721 aa  46.2  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1597  transcription accessory protein, TEX  20.64 
 
 		 386 aa  46.2  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207769  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3506  WD40-like protein repeat-like protein  21.17 
 
 		 434 aa  46.2  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16267  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0065  putative lipoprotein  24.16 
 
 		 381 aa  46.2  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0585728  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2225  PQQ repeat-containing protein  24.16 
 
 		 381 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1104  putative lipoprotein  24.16 
 
 		 381 aa  46.2  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>