186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3152 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  100 
 
 
431 aa  859    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  41.18 
 
 
1094 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.28 
 
 
510 aa  121  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.75 
 
 
399 aa  105  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  35.15 
 
 
958 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.38 
 
 
395 aa  105  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  34.56 
 
 
493 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  34.13 
 
 
644 aa  104  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.7 
 
 
1343 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.42 
 
 
323 aa  100  6e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1825  hypothetical protein  42.48 
 
 
298 aa  95.1  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  34.3 
 
 
1148 aa  94.4  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.42 
 
 
1412 aa  94.4  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.13 
 
 
1139 aa  93.6  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0240  hypothetical protein  43.4 
 
 
342 aa  93.6  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000162309  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.83 
 
 
192 aa  93.2  9e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  32.77 
 
 
1224 aa  89.7  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.43 
 
 
490 aa  89.4  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  32.08 
 
 
501 aa  87.8  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  30 
 
 
370 aa  84.7  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.95 
 
 
302 aa  84.7  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  31.13 
 
 
517 aa  84  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.75 
 
 
1181 aa  82.4  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.48 
 
 
524 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.98 
 
 
208 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.16 
 
 
232 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.59 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  31.1 
 
 
959 aa  75.9  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.45 
 
 
1438 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.84 
 
 
831 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  32.56 
 
 
1133 aa  72.8  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.03 
 
 
313 aa  73.2  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.35 
 
 
251 aa  71.2  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  32.34 
 
 
593 aa  70.9  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.86 
 
 
1041 aa  70.1  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.23 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2265  HEAT domain containing protein  34.46 
 
 
402 aa  69.7  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0591737 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.24 
 
 
390 aa  69.3  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  32.9 
 
 
886 aa  67.8  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.07 
 
 
176 aa  67.8  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1507  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 
445 aa  67.8  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4537  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.39 
 
 
400 aa  67  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5719  HEAT domain containing protein  30.12 
 
 
299 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  32.16 
 
 
1194 aa  67  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.08 
 
 
667 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.23 
 
 
666 aa  65.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0142  hypothetical protein  34.41 
 
 
233 aa  66.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  33.33 
 
 
838 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0125  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.58 
 
 
178 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1896  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.17 
 
 
298 aa  64.3  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1874  HEAT repeat-containing PBS lyase  47.76 
 
 
311 aa  64.3  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  31.15 
 
 
546 aa  63.9  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.75 
 
 
157 aa  63.5  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4453  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.82 
 
 
326 aa  63.2  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155685  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4511  HEAT domain containing protein  29.78 
 
 
286 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.715352  normal  0.801323 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2426  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.6 
 
 
464 aa  62.4  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.02 
 
 
221 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6151  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.68 
 
 
321 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4600  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.02 
 
 
214 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708981  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1520  hypothetical protein  30.62 
 
 
345 aa  61.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.806192  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.61 
 
 
223 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  28.79 
 
 
319 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3638  HEAT domain containing protein  30.66 
 
 
395 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.942525  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  27.18 
 
 
1216 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  29.07 
 
 
319 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2826  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.43 
 
 
157 aa  60.1  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0978  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.3 
 
 
334 aa  60.1  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0644536  normal  0.854239 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4198  HEAT domain containing protein  33.64 
 
 
321 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2128  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.18 
 
 
175 aa  59.3  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.146426  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2470  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.66 
 
 
395 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4484  heat domain-containing protein  31.71 
 
 
246 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.272856  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1170  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.31 
 
 
150 aa  58.2  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1669  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.62 
 
 
173 aa  58.2  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2402  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.92 
 
 
466 aa  57.8  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1415  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.03 
 
 
220 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0542  HEAT domain containing protein  32.67 
 
 
250 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1381  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.03 
 
 
220 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.85 
 
 
670 aa  57  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1888  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.43 
 
 
220 aa  56.6  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.628238 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0469  HEAT domain containing protein  30.2 
 
 
374 aa  56.2  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.421538 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0746  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.48 
 
 
646 aa  56.2  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  28.57 
 
 
1328 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1323  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.03 
 
 
212 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0342  HEAT repeat-containing PBS lyase  53.57 
 
 
101 aa  54.7  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.649618 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1378  HEAT domain containing protein  28.92 
 
 
643 aa  54.3  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.905373  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0761  HEAT domain containing protein  25.96 
 
 
646 aa  54.3  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.181899 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1838  hypothetical protein  30.3 
 
 
361 aa  54.3  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000286465  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4110  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.26 
 
 
515 aa  54.3  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0298438  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4077  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.55 
 
 
515 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.910859  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5289  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.41 
 
 
331 aa  53.5  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2408  hypothetical protein  28.95 
 
 
225 aa  53.5  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29957  normal  0.291609 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4548  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.24 
 
 
226 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2803  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.13 
 
 
320 aa  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.873153 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0719  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.94 
 
 
423 aa  52.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4762  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.32 
 
 
223 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122338  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  32.82 
 
 
773 aa  52.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5730  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.16 
 
 
201 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0251  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.17 
 
 
408 aa  51.2  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.169018  normal  0.0104715 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1404  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.08 
 
 
252 aa  51.2  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284551  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2463  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.61 
 
 
224 aa  50.8  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>