138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3145 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3145  hypothetical protein  100 
 
 		 1096 aa  2210    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.404826  normal  0.106206 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1758  hypothetical protein  54.41 
 
 		 668 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2011  hypothetical protein  55.1 
 
 		 681 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3706  hypothetical protein  51.64 
 
 		 771 aa  345  2e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1690  S-layer-related protein  35.79 
 
 		 677 aa  332  3e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.351956  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  56.84 
 
 		 940 aa  314  4.999999999999999e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1815  hypothetical protein  46.93 
 
 		 617 aa  296  1e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1816  hypothetical protein  35.55 
 
 		 505 aa  277  6e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0271443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2198  hypothetical protein  54.58 
 
 		 747 aa  241  5.999999999999999e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0450097  normal  0.656514 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2016  hypothetical protein  30.37 
 
 		 868 aa  231  4e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0853096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  55.86 
 
 		 635 aa  231  8e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0677  S-layer-like domain-containing protein  29.21 
 
 		 720 aa  221  5e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0713079  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2129  S-layer-like domain-containing protein  30.93 
 
 		 1304 aa  217  9.999999999999999e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00431402  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0149  S-layer-like domain-containing protein  27.89 
 
 		 1113 aa  214  5.999999999999999e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00285183  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1034  hypothetical protein  27.38 
 
 		 1161 aa  198  6e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0698  cell surface protein  48.67 
 
 		 586 aa  192  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  45.04 
 
 		 861 aa  192  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0268  S-layer-related protein  25.9 
 
 		 867 aa  177  8e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1797  hypothetical protein  42.47 
 
 		 405 aa  169  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.000000000782574  normal  1 
 
 
 
NC_007355  Mbar_A1928  hypothetical protein  37.13 
 
 		 525 aa  165  5.0000000000000005e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.361746  normal  0.675694 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2108  hypothetical protein  41.94 
 
 		 373 aa  157  8e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1177  S-layer-like domain-containing protein  24.41 
 
 		 874 aa  145  4e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1577  hypothetical protein  28.02 
 
 		 744 aa  141  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1743  hypothetical protein  47.37 
 
 		 926 aa  138  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.274233  normal  0.78184 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1864  hypothetical protein  44.81 
 
 		 656 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.935351  normal  0.282908 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1197  hypothetical protein  45.39 
 
 		 631 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1549  Pyrrolo-quinoline quinone  37.61 
 
 		 656 aa  128  6e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.259742  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1644  hypothetical protein  40.52 
 
 		 416 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0125  hypothetical protein  38.96 
 
 		 418 aa  111  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0314  cadherin  33.33 
 
 		 1021 aa  106  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  30.11 
 
 		 2552 aa  101  6e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  45.87 
 
 		 471 aa  94.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1089  cell surface protein  27.36 
 
 		 396 aa  89  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.415755  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2006  hypothetical protein  29.44 
 
 		 435 aa  89  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3064  hypothetical protein  39.68 
 
 		 168 aa  88.2  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187552  normal  0.503908 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0937  KP-43 peptidase  35.1 
 
 		 1351 aa  84.7  0.000000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.215277  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  39.29 
 
 		 960 aa  81.3  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  46.91 
 
 		 938 aa  80.5  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  45.54 
 
 		 1667 aa  80.9  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  48.35 
 
 		 1001 aa  80.1  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  50 
 
 		 505 aa  79  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  51.9 
 
 		 819 aa  79  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  34.83 
 
 		 978 aa  74.7  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  34.48 
 
 		 1682 aa  74.3  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  39.2 
 
 		 2036 aa  72.4  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  39.81 
 
 		 1120 aa  72  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  38.61 
 
 		 810 aa  70.5  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  47.37 
 
 		 2272 aa  70.5  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  37.74 
 
 		 2000 aa  70.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1273  PKD repeat-containing protein  45.33 
 
 		 275 aa  70.5  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  36.64 
 
 		 1969 aa  69.7  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  47.13 
 
 		 2122 aa  69.7  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  47.67 
 
 		 1842 aa  68.9  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  48.84 
 
 		 1882 aa  68.2  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2113  cell surface protein  41.49 
 
 		 725 aa  67.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.103352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1775  hypothetical protein  22.43 
 
 		 586 aa  65.5  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2170  hypothetical protein  37.39 
 
 		 525 aa  65.5  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  48.65 
 
 		 819 aa  64.3  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  43 
 
 		 575 aa  64.3  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  37.61 
 
 		 1862 aa  63.5  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  42.39 
 
 		 408 aa  63.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  36.22 
 
 		 1328 aa  62  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  33.77 
 
 		 530 aa  61.6  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  48.15 
 
 		 1356 aa  61.6  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  33.07 
 
 		 1300 aa  60.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  27.61 
 
 		 1783 aa  60.8  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  47.5 
 
 		 1380 aa  60.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  43.33 
 
 		 1732 aa  60.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  44.3 
 
 		 1241 aa  60.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  37.14 
 
 		 1361 aa  60.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  42.22 
 
 		 2554 aa  60.1  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  46.91 
 
 		 752 aa  59.3  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0611  hypothetical protein  28.72 
 
 		 160 aa  59.3  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.896365  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0865  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  40 
 
 		 2065 aa  59.3  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  41.77 
 
 		 3295 aa  58.9  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  40.66 
 
 		 1311 aa  58.9  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  42.86 
 
 		 845 aa  58.2  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  39 
 
 		 713 aa  58.2  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  41.76 
 
 		 840 aa  57.4  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  34 
 
 		 460 aa  57  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  37.65 
 
 		 838 aa  56.6  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  40.7 
 
 		 184 aa  56.6  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  34.78 
 
 		 1387 aa  55.8  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0510  hypothetical protein  39.81 
 
 		 451 aa  55.8  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.644592 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  38.71 
 
 		 910 aa  55.1  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  33.64 
 
 		 675 aa  54.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  41.33 
 
 		 1236 aa  54.3  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  42.19 
 
 		 823 aa  54.3  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  41.05 
 
 		 528 aa  54.3  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  38.64 
 
 		 719 aa  53.5  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  34.69 
 
 		 786 aa  53.5  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  43.24 
 
 		 777 aa  52.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  40.85 
 
 		 848 aa  53.1  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  37.93 
 
 		 519 aa  53.1  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  41.76 
 
 		 1282 aa  53.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  34.45 
 
 		 551 aa  52.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0787  PKD domain-containing protein  45.83 
 
 		 561 aa  52.8  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.605081  normal  0.12809 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  38.36 
 
 		 787 aa  52.4  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3126  PKD  37.62 
 
 		 1162 aa  52.8  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0241283  unclonable  0.0000395166 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  42.03 
 
 		 802 aa  52.4  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>