More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3113 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3113  potassium channel protein  100 
 
 		 347 aa  706    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144823  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0396  TrkA domain-containing protein  41.01 
 
 		 457 aa  232  6e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0527  TrkA domain-containing protein  29.88 
 
 		 564 aa  162  6e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.630061  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  30.98 
 
 		 542 aa  162  7e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0899  TrkA domain-containing protein  30.6 
 
 		 567 aa  156  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0968  TrkA-N domain protein  30.65 
 
 		 544 aa  156  6e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.153037 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1148  TrkA-N domain protein  27.55 
 
 		 614 aa  150  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.549431 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2691  TrkA-N domain protein  29.09 
 
 		 562 aa  150  4e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.557317  normal  0.0657771 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1187  TrkA-N domain protein  29.91 
 
 		 541 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1635  Ion transport 2 domain protein  27.9 
 
 		 567 aa  140  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0302468  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1968  TrkA-N domain protein  27.38 
 
 		 544 aa  139  6e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0623944 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1196  TrkA-N domain protein  26.97 
 
 		 569 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07220  K+ transport system, NAD-binding component  27.98 
 
 		 576 aa  132  9e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.146502  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0161  TrkA domain-containing protein  28.35 
 
 		 568 aa  130  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000200021  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4312  TrkA-N domain protein  30.89 
 
 		 548 aa  122  7e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  26.65 
 
 		 330 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  27.45 
 
 		 336 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  27.66 
 
 		 335 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  32.14 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  28.1 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  28.57 
 
 		 350 aa  114  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  27.05 
 
 		 335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  27.41 
 
 		 335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  28.18 
 
 		 333 aa  113  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  33.65 
 
 		 388 aa  112  9e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0419  TrkA-N domain protein  29.47 
 
 		 313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  25.75 
 
 		 509 aa  112  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  27.88 
 
 		 341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  32.43 
 
 		 393 aa  109  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  29.17 
 
 		 351 aa  109  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  26.85 
 
 		 330 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  26.91 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  29.97 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  28.05 
 
 		 350 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  28.1 
 
 		 351 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  26.65 
 
 		 354 aa  105  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  25.93 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1315  TrkA-N domain protein  28.57 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  26.09 
 
 		 330 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  25.75 
 
 		 347 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  25.62 
 
 		 334 aa  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  25.62 
 
 		 330 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  33.04 
 
 		 395 aa  103  6e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  26.17 
 
 		 338 aa  102  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  25.62 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  25.53 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  26.13 
 
 		 362 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  28.27 
 
 		 337 aa  100  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2323  TrkA domain-containing protein  24.46 
 
 		 549 aa  99.4  7e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.551813 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  26.91 
 
 		 350 aa  99.4  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  25.08 
 
 		 371 aa  99.4  8e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  26.83 
 
 		 531 aa  98.6  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  26.86 
 
 		 335 aa  99  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  26.55 
 
 		 352 aa  96.3  7e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1924  TrkA-C domain protein  28.86 
 
 		 551 aa  96.3  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  25.42 
 
 		 352 aa  95.9  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  27.36 
 
 		 335 aa  95.1  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  25.27 
 
 		 384 aa  94.7  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  24.31 
 
 		 332 aa  94.4  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  24.15 
 
 		 332 aa  93.6  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  26.85 
 
 		 352 aa  93.2  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  26.38 
 
 		 351 aa  92.8  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  26.38 
 
 		 351 aa  92.8  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  26.14 
 
 		 350 aa  92.8  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  26.38 
 
 		 351 aa  93.2  7e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  24.25 
 
 		 346 aa  92.8  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  24.14 
 
 		 356 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  24.29 
 
 		 350 aa  92  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  24.14 
 
 		 356 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  25.15 
 
 		 341 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  25.84 
 
 		 350 aa  90.9  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  26.33 
 
 		 351 aa  90.1  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  28.71 
 
 		 399 aa  90.1  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  26.37 
 
 		 355 aa  89.7  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  27.03 
 
 		 345 aa  88.2  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  23.6 
 
 		 331 aa  87.8  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  24.08 
 
 		 351 aa  86.3  8e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  26.2 
 
 		 357 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  24.58 
 
 		 346 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  27.69 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01224  voltage-gated potassium channel  26.85 
 
 		 417 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2398  TrkA-N domain protein  26.85 
 
 		 417 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  24.77 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  26.85 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0139159 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2377  voltage-gated potassium channel  26.85 
 
 		 417 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408742  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1601  hypothetical protein  25.96 
 
 		 378 aa  84  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01234  hypothetical protein  26.85 
 
 		 417 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1359  voltage-gated potassium channel  26.85 
 
 		 417 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000079785  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  26.85 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1419  voltage-gated potassium channel  26.85 
 
 		 417 aa  84  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0226544  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1398  voltage-gated potassium channel  26.85 
 
 		 417 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.488594  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3219  voltage-gated potassium channel  28.69 
 
 		 391 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.630222 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4906  TrkA-N domain protein  25 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1715  voltage-gated potassium channel  28.69 
 
 		 391 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4068  voltage-gated potassium channel  28.69 
 
 		 391 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4298  voltage-gated potassium channel  28.69 
 
 		 391 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3716  voltage-gated potassium channel  29.03 
 
 		 391 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.947773 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  23.45 
 
 		 359 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  27.69 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0391  voltage-gated potassium channel  26.2 
 
 		 416 aa  80.5  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.131379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>