More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3007 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3007  two component system histidine kinase  100 
 
 		 729 aa  1481    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0422303  hitchhiker  0.00299589 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  38.64 
 
 		 1046 aa  508  9.999999999999999e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.96 
 
 		 1022 aa  331  4e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.85 
 
 		 1003 aa  319  1e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.284418 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.08 
 
 		 456 aa  272  2e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.16 
 
 		 371 aa  271  4e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.32 
 
 		 763 aa  269  2e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0955  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.39 
 
 		 765 aa  238  2e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 		 568 aa  234  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0417  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.41 
 
 		 853 aa  221  3e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  47.39 
 
 		 508 aa  221  5e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  44.88 
 
 		 565 aa  221  5e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1369  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 767 aa  220  7.999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0713189  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2120  multisensor signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 		 682 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1552  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.88 
 
 		 971 aa  218  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2788  histidine kinase  43.43 
 
 		 576 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2119  multisensor signal transduction histidine kinase  43.36 
 
 		 582 aa  213  7e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.43 
 
 		 780 aa  213  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  38.54 
 
 		 778 aa  211  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0768  signal transduction histidine kinase  45.38 
 
 		 383 aa  212  3e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 1287 aa  211  4e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.77 
 
 		 687 aa  210  8e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.5 
 
 		 1352 aa  209  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.87 
 
 		 1274 aa  208  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.08 
 
 		 646 aa  209  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0617  histidine kinase  39.64 
 
 		 525 aa  208  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.64 
 
 		 785 aa  208  3e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  40.31 
 
 		 970 aa  207  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1100  PAS  40.99 
 
 		 576 aa  206  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 767 aa  205  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  42.97 
 
 		 436 aa  205  3e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.257658  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.14 
 
 		 513 aa  204  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0679  sensory transduction histidine kinase  40.89 
 
 		 445 aa  204  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.502245 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.49 
 
 		 940 aa  204  7e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.48 
 
 		 765 aa  203  7e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 		 1177 aa  202  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.71 
 
 		 1116 aa  203  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4177  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 		 490 aa  202  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.83 
 
 		 844 aa  202  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  32.97 
 
 		 882 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1010  histidine kinase  39.64 
 
 		 503 aa  202  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 		 617 aa  201  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.03 
 
 		 975 aa  201  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.93 
 
 		 995 aa  202  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.94 
 
 		 1452 aa  201  5e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.8 
 
 		 1410 aa  201  6e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2206  histidine kinase  37.46 
 
 		 556 aa  201  6e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.89 
 
 		 791 aa  201  6e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.04 
 
 		 600 aa  200  9e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3362  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  41.57 
 
 		 575 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.516975 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.62 
 
 		 784 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.55 
 
 		 911 aa  199  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1373  two component sensor kinase  44.67 
 
 		 790 aa  200  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0380  histidine kinase  45.89 
 
 		 235 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0756156  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2944  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 		 573 aa  198  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0066  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  39.31 
 
 		 773 aa  198  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.712477  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 489 aa  198  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0534  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.3 
 
 		 697 aa  198  3e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.608337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  43.98 
 
 		 560 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2189  histidine kinase  45.22 
 
 		 482 aa  198  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1885  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.93 
 
 		 792 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3045  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.46 
 
 		 587 aa  197  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.02 
 
 		 977 aa  197  6e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.36 
 
 		 738 aa  197  7e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.78 
 
 		 1433 aa  197  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 589 aa  196  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.05 
 
 		 881 aa  196  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  41.49 
 
 		 771 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.38 
 
 		 927 aa  195  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0641  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.6 
 
 		 772 aa  195  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.74 
 
 		 775 aa  195  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00109411  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.1 
 
 		 1145 aa  195  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.93 
 
 		 984 aa  196  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.7 
 
 		 1237 aa  195  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4715  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.91 
 
 		 1350 aa  195  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726459  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1884  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.48 
 
 		 389 aa  195  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1305  two component sensor kinase  41.2 
 
 		 599 aa  194  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282696  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.41 
 
 		 1333 aa  194  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202305 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0107  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 774 aa  194  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1166  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.59 
 
 		 507 aa  194  5e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.57 
 
 		 873 aa  194  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.37 
 
 		 667 aa  194  6e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.79 
 
 		 882 aa  193  9e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.95 
 
 		 1143 aa  193  9e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0718  sensory box histidine kinase/response regulator  36.31 
 
 		 589 aa  193  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.97168  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2590  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.66 
 
 		 1959 aa  192  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0694001 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.08 
 
 		 917 aa  193  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0185  GAF sensor hybrid histidine kinase  42.56 
 
 		 1214 aa  193  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467777  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.11 
 
 		 1363 aa  193  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.54 
 
 		 919 aa  192  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.58 
 
 		 1313 aa  192  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0118  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.53 
 
 		 1927 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125924 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  38.57 
 
 		 606 aa  192  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.1 
 
 		 858 aa  192  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.91 
 
 		 1075 aa  192  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 		 827 aa  192  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  42.13 
 
 		 783 aa  191  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3436  histidine kinase  41.42 
 
 		 771 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.416045  normal  0.0284383 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.96 
 
 		 647 aa  192  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.33 
 
 		 2161 aa  192  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.354922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>