161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3001 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3001  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  428  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.100606  hitchhiker  0.00156356 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5571  beta-Ig-H3/fasciclin  43.94 
 
 
134 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2869  beta-Ig-H3/fasciclin  38.24 
 
 
238 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1271  hypothetical protein  46.15 
 
 
161 aa  102  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235173  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1014  beta-Ig-H3/fasciclin  41.22 
 
 
187 aa  101  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2325  beta-Ig-H3/fasciclin  44.03 
 
 
165 aa  101  9e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1043  beta-Ig-H3/fasciclin  41.22 
 
 
187 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363938  hitchhiker  0.000000478309 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1485  beta-Ig-H3/fasciclin  43.85 
 
 
163 aa  101  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1723  beta-Ig-H3/fasciclin  38.06 
 
 
141 aa  100  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1108  beta-Ig-H3/fasciclin  41.79 
 
 
166 aa  98.6  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2373  beta-Ig-H3/fasciclin  43.08 
 
 
163 aa  98.2  9e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3576  beta-Ig-H3/fasciclin  41.5 
 
 
161 aa  98.2  9e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1409  beta-Ig-H3/fasciclin  44.03 
 
 
156 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2167  Beta-Ig-H3/fasciclin  41.67 
 
 
141 aa  96.7  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.277927 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0076  beta-Ig-H3/fasciclin  44.03 
 
 
156 aa  96.3  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.268608  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06660  hypothetical protein  41.86 
 
 
187 aa  96.3  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0622  fasciclin domain protein  43.17 
 
 
163 aa  95.9  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.951207  normal  0.83741 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  40.71 
 
 
279 aa  95.5  6e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  37.64 
 
 
201 aa  95.1  6e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2016  Beta-Ig-H3/fasciclin  42.42 
 
 
139 aa  93.6  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000921903  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  40.29 
 
 
558 aa  93.6  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2172  beta-Ig-H3/fasciclin  37.86 
 
 
164 aa  93.6  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.711656  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1387  beta-Ig-H3/fasciclin  36.62 
 
 
167 aa  92.4  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0247716 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2326  beta-Ig-H3/fasciclin  41.94 
 
 
160 aa  90.9  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001125  fasciclin domain-containing protein  40.3 
 
 
166 aa  91.3  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0298812  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5225  beta-Ig-H3/fasciclin  41.61 
 
 
194 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.109231  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0704  hypothetical protein  39.47 
 
 
157 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2251  beta-Ig-H3/fasciclin  40.94 
 
 
160 aa  89.7  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206889  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2096  beta-Ig-H3/fasciclin  41.3 
 
 
178 aa  89.4  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.243521  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1006  beta-Ig-H3/fasciclin  40.16 
 
 
133 aa  89  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1035  beta-Ig-H3/fasciclin  40.16 
 
 
133 aa  89  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.882693  hitchhiker  0.000102964 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0221  beta-Ig-H3/fasciclin  37.59 
 
 
191 aa  88.6  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46175  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1409  Beta-Ig-H3/fasciclin  37.4 
 
 
220 aa  88.2  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.92932  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4858  beta-Ig-H3/fasciclin  39.69 
 
 
151 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3373  beta-Ig-H3/fasciclin  38.1 
 
 
194 aa  88.2  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0555818  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1724  beta-Ig-H3/fasciclin  35.82 
 
 
143 aa  87.8  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2298  beta-Ig-H3/fasciclin  44.09 
 
 
301 aa  87.4  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0244  beta-Ig-H3/fasciclin  33.68 
 
 
195 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263365  normal  0.0636307 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1655  beta-Ig-H3/fasciclin  38.82 
 
 
596 aa  87  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0779815 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2207  beta-Ig-H3/fasciclin  41.54 
 
 
160 aa  87  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0621  fasciclin domain protein  41.86 
 
 
162 aa  87  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5784  beta-Ig-H3/fasciclin  42.22 
 
 
187 aa  86.7  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.638561  hitchhiker  0.0026448 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3984  beta-Ig-H3/fasciclin  44.7 
 
 
168 aa  86.7  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  0.572954 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0331  beta-Ig-H3/fasciclin  39.06 
 
 
193 aa  85.1  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0949  beta-Ig-H3/fasciclin  32.84 
 
 
135 aa  85.1  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3053  beta-Ig-H3/fasciclin  37.41 
 
 
191 aa  84.3  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.937158  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1101  beta-Ig-H3/fasciclin  38.02 
 
 
133 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1606  Beta-Ig-H3/fasciclin  37.01 
 
 
186 aa  84  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2816  beta-Ig-H3/fasciclin  43.28 
 
 
157 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal  0.235425 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0910  beta-Ig-H3/fasciclin  39.86 
 
 
208 aa  83.6  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4447  beta-Ig-H3/fasciclin  41.55 
 
 
160 aa  83.6  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0569511  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1335  beta-Ig-H3/fasciclin  38.52 
 
 
133 aa  83.6  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0336  Fas1 domain-containing protein  37.59 
 
 
184 aa  82.8  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3919  beta-Ig-H3/fasciclin  37.41 
 
 
190 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3627  beta-Ig-H3/fasciclin  37.41 
 
 
190 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1908  Beta-Ig-H3/fasciclin  41.6 
 
 
261 aa  82  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5434  beta-Ig-H3/fasciclin  37.41 
 
 
184 aa  81.6  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14413  normal  0.0716533 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2980  Beta-Ig-H3/fasciclin  37.19 
 
 
133 aa  81.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.231392  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1399  beta-Ig-H3/fasciclin  32.88 
 
 
192 aa  81.3  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.409432 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1202  beta-Ig-H3/fasciclin  37.11 
 
 
272 aa  80.9  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.27385  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0374  beta-Ig-H3/fasciclin  35.97 
 
 
183 aa  80.9  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2034  beta-Ig-H3/fasciclin  36.99 
 
 
186 aa  81.3  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6236  Beta-Ig-H3/fasciclin  39.16 
 
 
308 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669562  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0485  beta-Ig-H3/fasciclin  37.5 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2765  beta-Ig-H3/fasciclin  34.21 
 
 
184 aa  79.3  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0021  beta-Ig-H3/fasciclin  39.57 
 
 
141 aa  79.3  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3985  twin-arginine translocation pathway signal  36.89 
 
 
169 aa  78.6  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0926621  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4495  beta-Ig-H3/fasciclin  37.58 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.454582  normal  0.0107081 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3256  beta-Ig-H3/fasciclin  38.06 
 
 
186 aa  78.6  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4362  beta-Ig-H3/fasciclin  37.58 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1303  fasciclin domain-containing protein  36.3 
 
 
134 aa  78.2  0.00000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3054  secreted surface protein  38.52 
 
 
189 aa  78.6  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.272116 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11878  Beta-Ig-H3/Fasciclin domain protein  38.81 
 
 
193 aa  78.2  0.00000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1375  putative adhesion lipoprotein  38.19 
 
 
611 aa  77.4  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3372  beta-Ig-H3/fasciclin  41.04 
 
 
190 aa  77  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851575  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2094  Beta-Ig-H3/fasciclin  35.11 
 
 
133 aa  76.3  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.679914 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0973  beta-Ig-H3/fasciclin  37.31 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.517899  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3921  beta-Ig-H3/fasciclin  36.91 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00329996  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4248  beta-Ig-H3/fasciclin  35.25 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0997  beta-Ig-H3/fasciclin  38.81 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0737  beta-Ig-H3/fasciclin  36.36 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.437666  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1725  beta-Ig-H3/fasciclin  35.07 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03050  beta-Ig-H3/fasciclin repeat containing protein  36.69 
 
 
202 aa  75.1  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0459  hypothetical protein  34.67 
 
 
185 aa  74.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1085  fasciclin domain protein  40.35 
 
 
134 aa  74.7  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2872  beta-Ig-H3/fasciclin  37.96 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0637604 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14646  predicted protein  40.6 
 
 
142 aa  73.2  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6577  beta-Ig-H3/fasciclin repeat-containing protein  35.62 
 
 
184 aa  72  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5633  beta-Ig-H3/fasciclin  32.3 
 
 
222 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0278  beta-Ig-H3/fasciclin  36.5 
 
 
151 aa  70.9  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.216669  normal  0.0952762 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4241  beta-Ig-H3/fasciclin  39.09 
 
 
139 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1696  beta-Ig-H3/fasciclin  35.57 
 
 
185 aa  70.9  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5363  beta-Ig-H3/fasciclin  36.59 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1823  beta-Ig-H3/fasciclin  34.65 
 
 
315 aa  70.5  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0234116  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12888  cell surface lipoprotein mpt83 (lipoprotein P23)  37.93 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1113  beta-Ig-H3/fasciclin  36.94 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5227  beta-Ig-H3/fasciclin  33.07 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.273546  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0542  beta-Ig-H3/fasciclin  35.03 
 
 
330 aa  68.2  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07881  hypothetical protein  34.56 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6732  beta-Ig-H3/fasciclin  38.02 
 
 
216 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>