More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2976 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2976  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  520  1e-146  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3977  normal  0.29484 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0889  methyltransferase type 11  53.04 
 
 		 249 aa  290  1e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0190942  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1685  hypothetical protein  49.38 
 
 		 264 aa  250  1e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1075  hypothetical protein  41.37 
 
 		 250 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.238827  normal  0.291334 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1584  methyltransferase type 11  38.27 
 
 		 250 aa  198  6e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1825  methyltransferase type 11  37.14 
 
 		 254 aa  198  7e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.627869  normal  0.366066 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1585  hypothetical protein  38.75 
 
 		 256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04067  SAM-dependent methyltransferase  37.92 
 
 		 390 aa  183  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.882987  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4877  methyltransferase type 11  34.43 
 
 		 327 aa  177  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0767  MerR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 390 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0077  MerR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 391 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1437  MerR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 390 aa  172  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8125  acetyltransferase-like protein  36.33 
 
 		 464 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.467171 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0250  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 392 aa  169  5e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.757542 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0585  methyltransferase type 11  35.47 
 
 		 253 aa  167  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0938  MerR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 398 aa  166  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7265  MerR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 391 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3419  methyltransferase type 11  34.52 
 
 		 261 aa  165  8e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381882 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0350  Methyltransferase type 11  36.48 
 
 		 253 aa  162  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0064  Methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 249 aa  162  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262124  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0966  putative transcriptional regulator  34.58 
 
 		 392 aa  154  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0552  Methyltransferase type 11  29.64 
 
 		 247 aa  151  7e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2073  methyltransferase type 12  28.4 
 
 		 239 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.131474  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2724  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.53 
 
 		 239 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1961  methyltransferase type 12  28.63 
 
 		 241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00015321  normal  0.48171 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1382  methyltransferase type 12  26.75 
 
 		 239 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00680014  normal  0.829686 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0767  hypothetical protein  46.88 
 
 		 128 aa  83.6  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0255585  normal  0.0371895 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2857  methyltransferase type 11  28.78 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295819 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  34.07 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  27.85 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.23 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0601  Methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.967057  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.93 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  32.18 
 
 		 559 aa  56.6  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1821  modification methylase HemK  36.79 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  30.28 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1430  modification methylase, HemK family  39.53 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000467016  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1717  Methyltransferase type 11  27.61 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  27.97 
 
 		 232 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  27.92 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  31.79 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 229 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  28.78 
 
 		 267 aa  53.5  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0744  Methyltransferase type 11  22.7 
 
 		 248 aa  53.5  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0330334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  22.22 
 
 		 272 aa  53.5  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  29.25 
 
 		 286 aa  53.5  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  28.28 
 
 		 285 aa  53.1  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3811  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 440 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0252  hypothetical protein  27.27 
 
 		 253 aa  53.1  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1910  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.57 
 
 		 420 aa  52.8  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0258  hypothetical protein  27.27 
 
 		 253 aa  53.1  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1460  methyltransferase type 11  32.91 
 
 		 295 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.60854  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  29.44 
 
 		 268 aa  52.4  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.33 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.67 
 
 		 259 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2490  Methyltransferase type 11  31.65 
 
 		 296 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2326  methyltransferase  32.56 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.139311  normal  0.465998 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2617  Methyltransferase type 11  28 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2402  Methyltransferase type 11  31.65 
 
 		 296 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1677  methyltransferase type 11  26.28 
 
 		 278 aa  51.2  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  26.09 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  32.95 
 
 		 254 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  32.67 
 
 		 285 aa  50.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  24.84 
 
 		 208 aa  51.2  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5646  methyltransferase type 11  30.17 
 
 		 277 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  34.41 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1279  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.76 
 
 		 253 aa  50.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20470  tocopherol o-methyltransferase  33.33 
 
 		 318 aa  50.1  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2584  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.26 
 
 		 232 aa  50.4  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  27.52 
 
 		 273 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  32.22 
 
 		 254 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02290  arginine N-methyltransferase 3, putative  28.36 
 
 		 596 aa  49.7  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1561  methyltransferase small  28.72 
 
 		 205 aa  50.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.345198  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  29.76 
 
 		 286 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 284 aa  49.7  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1171  hypothetical protein  31.62 
 
 		 351 aa  49.7  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0400  methyltransferase type 11  28.09 
 
 		 248 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.555595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  26.28 
 
 		 248 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2612  methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 208 aa  49.3  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353861  normal  0.593702 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 236 aa  49.3  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  30.77 
 
 		 351 aa  49.3  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0543  Methyltransferase type 11  29.66 
 
 		 247 aa  49.3  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0671  methyltransferase type 11  37.35 
 
 		 312 aa  49.3  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5314  methyltransferase type 11  39.13 
 
 		 221 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal  0.0718819 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0992  Methyltransferase type 11  42.37 
 
 		 255 aa  48.9  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.358942  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  32.79 
 
 		 284 aa  48.9  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  28.44 
 
 		 258 aa  48.9  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  31.65 
 
 		 254 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  24.59 
 
 		 209 aa  48.9  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00198  methyltransferase  26.73 
 
 		 280 aa  48.5  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.524751  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07280  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  30.3 
 
 		 211 aa  48.5  0.00009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.385173  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  32.32 
 
 		 287 aa  48.5  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2002  hypothetical protein  40 
 
 		 289 aa  48.5  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.419802 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0474  hypothetical protein  30.65 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3127  Methyltransferase type 11  25.2 
 
 		 248 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  36.78 
 
 		 414 aa  48.1  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4388  methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 267 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0989044  normal  0.24508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>