More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2963 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  223  5.0000000000000005e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  48.39 
 
 
100 aa  110  9e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  46.24 
 
 
100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2267  hypothetical protein  50 
 
 
121 aa  106  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0373343  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0908  hypothetical protein  48.08 
 
 
187 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0876  hypothetical protein  54.26 
 
 
102 aa  104  3e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2151  protein of unknown function DUF59  48.96 
 
 
107 aa  104  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1805  hypothetical protein  44.66 
 
 
108 aa  102  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.752163  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1777  hypothetical protein  51.09 
 
 
105 aa  102  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1281  hypothetical protein  46.08 
 
 
118 aa  101  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3350  protein of unknown function DUF59  50.52 
 
 
105 aa  100  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.10795 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0172  hypothetical protein  43.88 
 
 
212 aa  100  8e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2485  hypothetical protein  57.3 
 
 
183 aa  100  9e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  52.81 
 
 
160 aa  100  9e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3876  hypothetical protein  48.45 
 
 
179 aa  99.4  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107724  normal  0.0166162 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  52.17 
 
 
99 aa  99.4  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1237  hypothetical protein  52.81 
 
 
187 aa  99.4  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.568332  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  52.27 
 
 
156 aa  98.6  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5887  hypothetical protein  51.06 
 
 
120 aa  98.2  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2027  FeS assembly SUF system protein  50 
 
 
113 aa  98.6  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0141  hypothetical protein  47.17 
 
 
124 aa  97.8  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00350528  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  48.89 
 
 
111 aa  97.4  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0898  FeS assembly SUF system protein SufT  48.39 
 
 
185 aa  97.4  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0894  FeS assembly SUF system protein SufT  48.39 
 
 
185 aa  97.4  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0707  FeS assembly SUF system protein SufT  51.65 
 
 
183 aa  97.1  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.357748 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2708  phenylacetic acid degradation protein paaD  53.26 
 
 
182 aa  97.1  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  47.78 
 
 
111 aa  96.7  9e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3156  hypothetical protein  46 
 
 
180 aa  96.7  9e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04567  domain of unknown function protein  52.17 
 
 
166 aa  96.7  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0848  hypothetical protein  47.31 
 
 
185 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.898331  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4274  hypothetical protein  49.45 
 
 
128 aa  96.3  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0900  hypothetical protein  42.27 
 
 
108 aa  96.3  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3279  FeS assembly SUF system protein  44.44 
 
 
185 aa  95.9  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0585568  normal  0.0371399 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0528  hypothetical protein  49.44 
 
 
183 aa  95.5  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.830297  normal  0.540479 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1895  FeS assembly SUF system protein  50 
 
 
126 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166707  hitchhiker  0.00465404 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2441  hypothetical protein  48.94 
 
 
126 aa  95.1  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1419  metal-sulfur cluster enzyme  45.79 
 
 
178 aa  95.1  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.201751  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1320  hypothetical protein  48.31 
 
 
138 aa  95.1  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0203207  normal  0.743383 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1792  hypothetical protein  52.17 
 
 
182 aa  94.4  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.486527  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2914  FeS assembly SUF system protein  50.56 
 
 
164 aa  94.4  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446647  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1777  hypothetical protein  50.56 
 
 
131 aa  94.4  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.716432  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2404  hypothetical protein  52.17 
 
 
182 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0935  hypothetical protein  49.44 
 
 
139 aa  94  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.861252  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0608  hypothetical protein  52.17 
 
 
182 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2828  hypothetical protein  52.17 
 
 
182 aa  94  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0856  FeS assembly SUF system protein SufT  51.65 
 
 
216 aa  94  6e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3314  FeS assembly SUF system protein  43.75 
 
 
154 aa  94  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0845905 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2885  hypothetical protein  52.17 
 
 
182 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2251  FeS assembly SUF system protein  50.56 
 
 
139 aa  94  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.908211  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0929  FeS assembly SUF system protein  49.44 
 
 
139 aa  94  6e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2765  phenylacetic acid degradation protein paaD  52.17 
 
 
182 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328034  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1717  hypothetical protein  52.17 
 
 
174 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0238902  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2102  FeS assembly SUF system protein  50 
 
 
126 aa  93.6  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2422  protein of unknown function DUF59  42.57 
 
 
112 aa  92.8  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1894  FeS assembly SUF system protein SufT  52.87 
 
 
189 aa  92.8  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.91591  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0998  hypothetical protein  47.78 
 
 
108 aa  92.4  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.239725 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3473  hypothetical protein  47.19 
 
 
135 aa  92.8  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.642924  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0974  hypothetical protein  50.55 
 
 
216 aa  92  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.438965  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1600  FeS assembly SUF system protein SufT  45.92 
 
 
181 aa  92.4  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3035  FeS assembly SUF system protein  49.45 
 
 
104 aa  92  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.010077 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1674  hypothetical protein  49.45 
 
 
101 aa  92  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0498751  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0711  hypothetical protein  46.07 
 
 
135 aa  91.7  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1972  hypothetical protein  47.19 
 
 
183 aa  91.7  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04480  hypothetical protein  49.44 
 
 
108 aa  91.3  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.633098  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1196  FeS assembly SUF system protein SufT  52.17 
 
 
181 aa  91.3  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.448291  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0268  protein of unknown function DUF59  39.77 
 
 
133 aa  91.7  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1349  hypothetical protein  47.12 
 
 
176 aa  90.9  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.682238  unclonable  0.00000000000318358 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1464  FeS assembly SUF system protein  46.67 
 
 
126 aa  90.9  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26453  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0937  protein of unknown function DUF59  53.93 
 
 
107 aa  90.5  7e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00705521  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0118  protein of unknown function DUF59  44.21 
 
 
99 aa  90.1  9e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0127  hypothetical protein  43.69 
 
 
131 aa  89.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2989  hypothetical protein  47.73 
 
 
122 aa  89.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0927837 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0909  protein of unknown function DUF59  44.33 
 
 
99 aa  89.7  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0748991  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1503  aromatic ring hydroxylating enzyme  46.74 
 
 
179 aa  89.7  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.18078 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4171  FeS assembly SUF system protein SufT  42 
 
 
185 aa  89.4  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3258  FeS assembly SUF system protein  43.82 
 
 
130 aa  89.4  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60007  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01362  predicted metal-sulfur cluster enzyme  45.74 
 
 
177 aa  88.6  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.731864  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2569  hypothetical protein  45.26 
 
 
132 aa  87.8  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0327  hypothetical protein  46.94 
 
 
162 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2849  hypothetical protein  51.61 
 
 
185 aa  87.4  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0985  protein of unknown function DUF59  46.81 
 
 
102 aa  87.4  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0278176  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2338  FeS assembly SUF system protein SufT  51.61 
 
 
185 aa  87.4  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00501681  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2836  hypothetical protein  43.82 
 
 
123 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221891  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1571  hypothetical protein  43.88 
 
 
105 aa  87  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2594  FeS assembly SUF system protein  46.07 
 
 
119 aa  87  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426933  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0699  FeS assembly SUF system protein  42.99 
 
 
127 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.777618  normal  0.0436318 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1024  protein of unknown function DUF59  41.05 
 
 
142 aa  86.3  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.929199  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2460  hypothetical protein  46.59 
 
 
122 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0123184  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4461  FeS assembly SUF system protein  47.19 
 
 
127 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.148381 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0973  hypothetical protein  42.22 
 
 
108 aa  86.3  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0901491  normal  0.0907936 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  40.86 
 
 
238 aa  86.3  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4349  FeS assembly SUF system protein  46.07 
 
 
127 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1175  hypothetical protein  47.19 
 
 
107 aa  85.9  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2291  protein of unknown function DUF59  41.94 
 
 
109 aa  85.5  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0318532  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3981  FeS assembly SUF system protein  46.07 
 
 
127 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.954909 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5784  FeS assembly SUF system protein  44.44 
 
 
112 aa  85.9  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0794322  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4465  FeS assembly SUF system protein  42.7 
 
 
124 aa  85.5  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.596089 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1270  hypothetical protein  45.74 
 
 
182 aa  85.1  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0929  hypothetical protein  43.88 
 
 
105 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5844  FeS assembly SUF system protein  42.72 
 
 
123 aa  84.3  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>