More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2931 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  100 
 
 		 940 aa  1870    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3706  hypothetical protein  46.86 
 
 		 771 aa  330  9e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3145  hypothetical protein  57.14 
 
 		 1096 aa  316  1.9999999999999998e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.404826  normal  0.106206 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  66.67 
 
 		 635 aa  298  3e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  34.93 
 
 		 1001 aa  283  9e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2198  hypothetical protein  55 
 
 		 747 aa  251  5e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0450097  normal  0.656514 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  32.06 
 
 		 960 aa  242  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  43.25 
 
 		 735 aa  241  4e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  42.42 
 
 		 471 aa  219  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  45.57 
 
 		 547 aa  214  9e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0698  cell surface protein  48.7 
 
 		 586 aa  212  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  34.2 
 
 		 641 aa  209  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  31.95 
 
 		 1931 aa  200  7.999999999999999e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  37.37 
 
 		 777 aa  195  3e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  35.9 
 
 		 2552 aa  194  9e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  43.57 
 
 		 861 aa  185  4.0000000000000006e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1928  hypothetical protein  39.89 
 
 		 525 aa  181  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.361746  normal  0.675694 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1797  hypothetical protein  44 
 
 		 405 aa  175  3.9999999999999995e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.000000000782574  normal  1 
 
 
 
NC_007355  Mbar_A2108  hypothetical protein  43.81 
 
 		 373 aa  175  3.9999999999999995e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  36.63 
 
 		 838 aa  169  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  41.31 
 
 		 505 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  49.76 
 
 		 978 aa  168  5e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  36.59 
 
 		 810 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3393  cell surface protein  29.78 
 
 		 564 aa  162  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.591831  normal  0.211217 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  56.74 
 
 		 1356 aa  161  5e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  48.37 
 
 		 1682 aa  160  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  35.07 
 
 		 1969 aa  159  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  31.85 
 
 		 638 aa  158  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  53.89 
 
 		 1732 aa  157  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1864  hypothetical protein  46.41 
 
 		 656 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.935351  normal  0.282908 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2170  hypothetical protein  39.64 
 
 		 525 aa  154  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1197  hypothetical protein  40 
 
 		 631 aa  153  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  54.32 
 
 		 910 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  48.94 
 
 		 2554 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  49.27 
 
 		 3295 aa  147  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  43.83 
 
 		 2122 aa  146  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1743  hypothetical protein  45.12 
 
 		 926 aa  145  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.274233  normal  0.78184 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  44.5 
 
 		 1236 aa  144  8e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  48.4 
 
 		 930 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  52.41 
 
 		 2000 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  50.31 
 
 		 460 aa  140  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  48.09 
 
 		 2036 aa  139  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  52.63 
 
 		 2272 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  50.91 
 
 		 1241 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  48.39 
 
 		 1842 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  34.29 
 
 		 871 aa  137  7.000000000000001e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  33.25 
 
 		 1300 aa  137  8e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  52.63 
 
 		 1882 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  51.32 
 
 		 575 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  31.53 
 
 		 1092 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  33.24 
 
 		 595 aa  135  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  40.54 
 
 		 859 aa  135  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  32.78 
 
 		 1667 aa  135  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  49.34 
 
 		 963 aa  135  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  47.54 
 
 		 1120 aa  134  9e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  49.32 
 
 		 1361 aa  133  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  41.41 
 
 		 679 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  46.96 
 
 		 675 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  49.07 
 
 		 1094 aa  132  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  47.02 
 
 		 685 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  46.34 
 
 		 408 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  47.8 
 
 		 1862 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  50.91 
 
 		 669 aa  130  8.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  47.09 
 
 		 1282 aa  130  8.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1549  Pyrrolo-quinoline quinone  35.96 
 
 		 656 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.259742  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  37.28 
 
 		 570 aa  130  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  45.03 
 
 		 530 aa  128  5e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  47.78 
 
 		 528 aa  128  5e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  48.05 
 
 		 658 aa  127  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2633  cell surface protein  42.94 
 
 		 245 aa  127  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.186167 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  48.05 
 
 		 713 aa  126  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  48.48 
 
 		 581 aa  126  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  47.56 
 
 		 615 aa  125  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  41.04 
 
 		 719 aa  125  5e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  46.58 
 
 		 184 aa  124  6e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  31.4 
 
 		 1056 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1644  hypothetical protein  34.56 
 
 		 416 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  47.13 
 
 		 644 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  45.29 
 
 		 791 aa  122  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  45.1 
 
 		 786 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  46.05 
 
 		 500 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0125  hypothetical protein  38.46 
 
 		 418 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  47.55 
 
 		 840 aa  121  6e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  45.76 
 
 		 819 aa  121  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  48.03 
 
 		 551 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  44.44 
 
 		 752 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  40.82 
 
 		 816 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  42.71 
 
 		 938 aa  119  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  45.45 
 
 		 561 aa  117  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  47.4 
 
 		 869 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  44.51 
 
 		 519 aa  117  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  33.55 
 
 		 831 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  44.31 
 
 		 823 aa  115  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  43.29 
 
 		 958 aa  115  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  40.67 
 
 		 560 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  45.58 
 
 		 802 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1273  PKD repeat-containing protein  48.43 
 
 		 275 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  42.49 
 
 		 845 aa  114  7.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  36.15 
 
 		 941 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  45.12 
 
 		 443 aa  112  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>